More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1781 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1781  putative prophage repressor  100 
 
 
194 aa  392  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000051926  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2596  putative prophage repressor  44.68 
 
 
210 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3718  LexA repressor  42.49 
 
 
199 aa  157  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.875348  normal  0.435562 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4974  peptidase S24 and S26 domain protein  37.31 
 
 
212 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2517  peptidase S24 and S26 domain protein  38.37 
 
 
192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983902  normal  0.477555 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  36.51 
 
 
208 aa  91.3  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0899  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  40.83 
 
 
148 aa  90.5  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0048  DNA polymerase V  40.17 
 
 
137 aa  89.7  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109264 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3116  LexA repressor  34.03 
 
 
202 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2201  peptidase S24 and S26 domain protein  40.83 
 
 
150 aa  87.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2741  LexA repressor  34.03 
 
 
205 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3076  SOS mutagenesis protein UmuD  41.46 
 
 
139 aa  86.3  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1981  putative prophage repressor  39.5 
 
 
148 aa  86.3  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2601  LexA repressor  34.55 
 
 
205 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0704  putative prophage repressor  39.37 
 
 
163 aa  85.9  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  41.18 
 
 
206 aa  84.7  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  34.06 
 
 
238 aa  84.7  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0100  protein MucA  37.88 
 
 
147 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.903241  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1337  umuD protein  38.52 
 
 
141 aa  83.6  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  41.53 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.92 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  36.13 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  35.29 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1841  LexA repressor  28.38 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.924658  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  36.13 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  34.65 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0919  peptidase S24 and S26 domain protein  37.3 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.391106  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3152  LexA repressor  31.38 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4496  LexA repressor  27.63 
 
 
232 aa  80.5  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1669  hypothetical protein  37.69 
 
 
138 aa  80.5  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1663  hypothetical protein  37.69 
 
 
138 aa  80.5  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1739  LexA repressor  33.33 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1096  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.35 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0403674  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0192  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.03 
 
 
200 aa  79.7  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1741  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.41 
 
 
226 aa  79  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0247  LexA repressor  32.28 
 
 
202 aa  79  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0945075  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14510  LexA repressor  32.34 
 
 
202 aa  78.6  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4494  LexA repressor  32.8 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4579  LexA repressor  32.8 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4429  LexA repressor  32.8 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000308575 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1201  SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidase)-like  33.61 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4580  LexA repressor  32.8 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.285079 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2081  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.19 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4631  LexA repressor  32.8 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.381765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2425  LexA repressor  31.41 
 
 
205 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0514  LexA repressor  32.8 
 
 
202 aa  77.8  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  32.58 
 
 
222 aa  78.2  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2310  LexA repressor  32.08 
 
 
224 aa  77.8  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.389414  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1549  LexA repressor  32.08 
 
 
224 aa  77.8  0.00000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.583013  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03915  LexA repressor  32.07 
 
 
202 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.499421  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3950  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.07 
 
 
202 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4912  LexA repressor  30.48 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199048  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2520  LexA repressor  30.69 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0774546  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3985  LexA repressor  32.07 
 
 
202 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.359891 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03875  hypothetical protein  32.07 
 
 
202 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.453972  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1179  putative SOS mutagenesis protein UmuD  36.92 
 
 
143 aa  77.8  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.482422  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4505  LexA repressor  32.07 
 
 
202 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2809  LexA repressor  27.39 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33074  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1368  peptidase S24 and S26 domain protein  36.36 
 
 
150 aa  77.4  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.734123  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0020  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.46 
 
 
199 aa  77.8  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000309012  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3249  LexA repressor  27.59 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4283  LexA repressor  32.07 
 
 
202 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  32.2 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  32.2 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5524  LexA repressor  32.07 
 
 
202 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194949  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4596  LexA repressor  32.07 
 
 
202 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4554  LexA repressor  32.07 
 
 
202 aa  77.4  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3860  LexA repressor  33.16 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.528638  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3565  LexA repressor  31.92 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173958  hitchhiker  0.00714221 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1587  LexA repressor  32.66 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.477026 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3974  LexA repressor  28.35 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1939  LexA repressor  36.42 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269028  normal  0.116637 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1300  LexA repressor  33.16 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1611  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.53 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000160494  unclonable  3.1983e-16 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1729  LexA repressor  27.07 
 
 
233 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3770  LexA repressor  33.16 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.638288  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0275  SOS mutagenesis protein UmuD  38.26 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121942  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0733  LexA repressor  32.28 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09441  putative SOS mutagenesis protein UmuD  38.26 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.497301  normal  0.0831546 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1208  putative prophage repressor  36.22 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00934288  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1439  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.29 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  33.88 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3997  LexA repressor  29.85 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0056  hypothetical protein  36.92 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.221897  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2061  peptidase S24 and S26 domain protein  33.61 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0332748  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3510  LexA repressor  32.5 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.9651  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3524  LexA repressor  32.63 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1004  hypothetical protein  38.94 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  28.06 
 
 
258 aa  74.7  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2792  LexA repressor  31.75 
 
 
202 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147289  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0052  mutagenesis and repair protein MucA  32.82 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.69 
 
 
206 aa  74.3  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  29.44 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0099  LexA repressor  33.33 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2341  putative prophage repressor  38.33 
 
 
139 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3328  transcriptional repressor, LexA family  30.69 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2352  putative prophage repressor  38.33 
 
 
139 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1291  putative SOS mutagenesis protein UmuD  36.13 
 
 
147 aa  74.3  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172985  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2457  peptidase S24/S26 domain-containing protein  38.33 
 
 
139 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2006  peptidase S24 and S26 domain protein  38.33 
 
 
139 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>