47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1610 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1610  cupin 2, barrel  100 
 
 
143 aa  293  4e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000344419 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1978  cupin 2 domain-containing protein  49.63 
 
 
144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2224  hypothetical protein  53.85 
 
 
166 aa  124  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2532  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.69 
 
 
178 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0909  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.2 
 
 
137 aa  97.8  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167326  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1726  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.68 
 
 
150 aa  89.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.680674  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02199  hypothetical protein  40.35 
 
 
139 aa  90.1  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.13 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1250  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.21 
 
 
193 aa  88.2  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015051 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3293  cupin 2 domain-containing protein  32.08 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.661006 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0053  hypothetical protein  33.63 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00650  hypothetical protein  34.91 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16011  hypothetical protein  35.9 
 
 
155 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1314  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.68 
 
 
166 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000442476  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.09 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0868  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.17 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1506  hypothetical protein  33.1 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12421  hypothetical protein  32.39 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1350  cupin 2 domain-containing protein  37.23 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.687777  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3175  cupin 2 domain-containing protein  31.78 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  31.58 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10991  double-stranded beta-helix domain-containing protein  29.2 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13991  hypothetical protein  29.66 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0597  hypothetical protein  29.66 
 
 
146 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.403415  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1225  hypothetical protein  31.37 
 
 
140 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12971  hypothetical protein  30.77 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.298883  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13041  hypothetical protein  31.37 
 
 
140 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.36 
 
 
140 aa  53.9  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0594  hypothetical protein  27.86 
 
 
143 aa  53.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13891  hypothetical protein  27.86 
 
 
143 aa  53.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 
231 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2628  cupin 2 domain-containing protein  29.2 
 
 
157 aa  52.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.074736  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1204  hypothetical protein  27.21 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.259392  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1633  hypothetical protein  30.53 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04261  hypothetical protein  31.47 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.648244  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3656  cupin 2, barrel  28.93 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110053  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0998  hypothetical protein  30 
 
 
142 aa  48.9  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16041  hypothetical protein  27.4 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.29 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  31.63 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  27.01 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2157  cupin 2, barrel  32.58 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  30.11 
 
 
135 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  30.11 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  29.59 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  29.59 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.418121 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.79 
 
 
139 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>