More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1447 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1447  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 
203 aa  406  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.703222  normal  0.345478 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4793  cytochrome c oxidase, subunit I  34.34 
 
 
874 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153175  normal  0.530231 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0094  putative cytochrome c oxidase subunit III protein  36.27 
 
 
216 aa  124  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512296  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0695  putative cytochrome c oxidase subunit I  36.46 
 
 
201 aa  124  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2349  putative cytochrome c oxidase subunit III protein  36.51 
 
 
213 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0168  putative cytochrome c oxidase subunit I  34.52 
 
 
877 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.606404  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5828  cytochrome c oxidase subunit III  34.9 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2989  putative cytochrome c oxidase subunit III protein  36.27 
 
 
212 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181607  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2028  cytochrome c oxidase subunit III  36.32 
 
 
214 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000242871 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0944  cytochrome C oxidase subunit I  34.04 
 
 
950 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0770  cytochrome c oxidase, subunit I/subunit III  34.04 
 
 
962 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306921  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  34.04 
 
 
974 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0081  putative cytochrome c oxidase subunit III  34.76 
 
 
217 aa  98.2  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379927  normal  0.0255884 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6356  putative cytochrome c oxidase subunit III protein  29.63 
 
 
198 aa  97.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5489  cytochrome c oxidase subunit III  34.34 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324839  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  30.69 
 
 
214 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6573  cytochrome c oxidase, subunit I  33.16 
 
 
882 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0983225  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  29.89 
 
 
207 aa  94.7  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  29.31 
 
 
211 aa  94.7  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6287  cytochrome c oxidase, subunit I  33.16 
 
 
879 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171761  normal  0.0477153 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2185  putative cytochrome c oxidase, subunit III  34.57 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0357507 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  39.64 
 
 
239 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  30.46 
 
 
206 aa  93.2  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1293  cytochrome c oxidase, subunit I  31.22 
 
 
879 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6538  cytochrome c oxidase, subunit I  31.22 
 
 
879 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5242  cytochrome c oxidase subunit III  35.6 
 
 
200 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141471  normal  0.645563 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  28.74 
 
 
208 aa  92.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0458  putative cytochrome c oxidase subunit I  29.41 
 
 
201 aa  89.7  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  28.16 
 
 
197 aa  89  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  35.33 
 
 
212 aa  88.6  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  29.31 
 
 
205 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  26.44 
 
 
198 aa  85.5  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  29.31 
 
 
205 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  28.18 
 
 
210 aa  85.1  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5501  cytochrome c oxidase, subunit I  31.69 
 
 
876 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0931338 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  32.7 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  29.56 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1144  cytochrome c oxidase subunit III  33.79 
 
 
268 aa  79  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  30.83 
 
 
293 aa  79  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0296  cytochrome c oxidase, subunit III  29.68 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  32.09 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1249  cytochrome c oxidase, subunit III  32.35 
 
 
293 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147299  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  30.39 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3823  cytochrome c oxidase subunit III  31.54 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267917 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  22.75 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  25.51 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0618  cytochrome c oxidase, subunit III  32.65 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3575  cytochrome c oxidase subunit III  28.74 
 
 
222 aa  75.1  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515089  normal  0.0102703 
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  29.1 
 
 
229 aa  75.1  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  29.73 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_002978  WD0141  cytochrome c oxidase, subunit III  29.8 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.400418  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  33.73 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04010  Cytochrome c oxidase subunit III  28.1 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0882  cytochrome c oxidase, subunit III  31.62 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0523  cytochrome c oxidase subunit III  32.65 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  34.34 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  34.34 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0586  cytochrome c oxidase subunit III  32.64 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141909  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0472  cytochrome c oxidase, subunit III  31.94 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  34.34 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0228  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0766  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486485  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3044  cytochrome c oxidase, subunit III  29.32 
 
 
288 aa  73.6  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00173082  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  32.43 
 
 
439 aa  73.2  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  32.65 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  27.22 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0233  cytochrome c oxidase subunit III  30.37 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  32.65 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  25.71 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  28.49 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0367  cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  31.37 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0187  cytochrome c oxidase, subunit III  30.26 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  24.08 
 
 
201 aa  72  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0242  cytochrome c oxidase subunit III  32.03 
 
 
286 aa  72  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0155178 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0223  cytochrome c oxidase subunit III  32.03 
 
 
286 aa  72  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.591162 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  28.1 
 
 
295 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  30.37 
 
 
293 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0039  cytochrome c oxidase, subunit III  29.1 
 
 
304 aa  71.6  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061642  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  28.57 
 
 
291 aa  71.2  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  28.66 
 
 
294 aa  71.6  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  33.73 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  27.45 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  26.94 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  31.55 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4317  cytochrome c oxidase, subunit III  32.21 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0577944  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  27.45 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3177  putative cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  29.14 
 
 
293 aa  70.9  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00203621  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0265  cytochrome c oxidase subunit III  30.83 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1880  Cytochrome-c oxidase  27.57 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0746  cytochrome c oxidase, subunit III  31.25 
 
 
293 aa  70.9  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0126142  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0629  cytochrome c oxidase, subunit I  27.37 
 
 
796 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  22.92 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3532  cytochrome c oxidase, subunit III  27.7 
 
 
293 aa  69.3  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.671052  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0260  cytochrome c oxidase, subunit III  32.43 
 
 
284 aa  69.3  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742832  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3458  cytochrome c oxidase, subunit III  32.43 
 
 
284 aa  69.3  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.107293  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1045  cytochrome c oxidase subunit III  30.61 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  31.74 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  32.65 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1829  cytochrome c oxidase, aa3-type, subunit III  32.65 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.346117  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2855  cytochrome c oxidase subunit III  27.7 
 
 
293 aa  68.9  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>