126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1429 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1429  copper resistance protein CopC  100 
 
 
120 aa  248  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  29.63 
 
 
188 aa  60.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1742  copper resistance protein CopC  34.21 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  30.63 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  26.77 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  35.04 
 
 
124 aa  57.8  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  31.13 
 
 
125 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  28.57 
 
 
122 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  30.89 
 
 
182 aa  57  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  32.43 
 
 
207 aa  57  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3307  copper resistance protein CopC  30.97 
 
 
111 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.980594 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  28.57 
 
 
143 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1971  copper resistance protein CopC  26.85 
 
 
140 aa  53.5  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.520942  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  34.65 
 
 
244 aa  53.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  30.1 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  30.1 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  30.1 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  26.36 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  29.41 
 
 
210 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  33.33 
 
 
173 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  28.28 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  33.06 
 
 
210 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  29.06 
 
 
184 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3414  copper resistance protein CopC  28.57 
 
 
126 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  30.19 
 
 
126 aa  51.6  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  24.11 
 
 
565 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  32.11 
 
 
571 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4289  copper resistance protein CopC  26.85 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.379862  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  24.11 
 
 
564 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  28.7 
 
 
178 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0251  copper resistance protein CopC  26.85 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2238  copper resistance protein CopC  29.63 
 
 
126 aa  50.1  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3544  copper resistance protein CopC  27.36 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0711776  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  26.42 
 
 
125 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  28.83 
 
 
226 aa  48.9  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  32.65 
 
 
214 aa  48.9  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  30.1 
 
 
119 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  26.36 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  26.36 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  28.93 
 
 
197 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4567  copper resistance protein CopC  30.69 
 
 
272 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  26.36 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  31.03 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  27.27 
 
 
124 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2140  copper resistance protein CopC  31.86 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  30.1 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  27.93 
 
 
172 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  28.97 
 
 
208 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  29.73 
 
 
174 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2276  copper resistance protein CopC  29.09 
 
 
124 aa  47.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2925  copper resistance protein CopC  32.04 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  30.1 
 
 
124 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  30.1 
 
 
124 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  30.1 
 
 
124 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  29.81 
 
 
118 aa  47  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  29.63 
 
 
174 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2223  copper resistance protein CopC  25.81 
 
 
122 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.213465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  29.63 
 
 
174 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2347  copper resistance protein CopC  28.95 
 
 
122 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  26.26 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  26.26 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  30.17 
 
 
544 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  27.27 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  30.17 
 
 
544 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  30.21 
 
 
265 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6114  copper resistance protein CopC  29.09 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00881614  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  26.26 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  26.26 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  26.26 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  26.26 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  29.41 
 
 
544 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  29 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  27.55 
 
 
131 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5431  copper resistance protein CopC  29.52 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  26.26 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  26.26 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  28.95 
 
 
547 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  26.53 
 
 
126 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  28.57 
 
 
869 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5210  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 
434 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  0.695526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  23.3 
 
 
560 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  26.53 
 
 
129 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  26.53 
 
 
129 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  31.96 
 
 
593 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  26.72 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  29.41 
 
 
549 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3446  copper resistance protein CopC  25.66 
 
 
120 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3812  copper resistance protein CopC  26.67 
 
 
124 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.994582  normal  0.824411 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  32.99 
 
 
513 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  30 
 
 
519 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  32.04 
 
 
208 aa  43.9  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2487  copper resistance protein CopC  30.56 
 
 
128 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1388  copper resistance protein CopC  31.53 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  30.77 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  27.55 
 
 
225 aa  43.5  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1495  copper resistance protein CopC  25 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594535  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4019  copper resistance protein CopC  30.69 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659263  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  26.61 
 
 
613 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  26.02 
 
 
173 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>