117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1244 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1244  CheW protein  100 
 
 
175 aa  359  1e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.95901  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3897  CheW protein  36.21 
 
 
170 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3690  CheW protein  36.53 
 
 
168 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1574  CheW protein  36.57 
 
 
175 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.10393 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1138  CheW-like protein  34.86 
 
 
176 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3576  putative CheW protein  36.16 
 
 
175 aa  102  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510091  normal  0.211391 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2899  CheW protein  35.43 
 
 
175 aa  102  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1373  CheW-like protein  32.57 
 
 
176 aa  99  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.135811  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4624  CheW protein  34.66 
 
 
177 aa  97.8  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3019  putative CheW protein  34.48 
 
 
175 aa  97.1  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3352  putative CheW protein  35.59 
 
 
176 aa  95.1  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0562  CheW protein  34.5 
 
 
181 aa  95.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.770084 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0614  CheW protein  33.92 
 
 
181 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2550  CheW protein  36.05 
 
 
174 aa  92.8  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0670  putative twitching motility protein  35.09 
 
 
181 aa  91.7  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0903  CheW protein  31.21 
 
 
175 aa  91.3  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3969  CheW protein  32.14 
 
 
176 aa  89.4  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946011 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3188  twitching motility signal transduction protein  34.4 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.572564  normal  0.255997 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0671  CheW protein  29.28 
 
 
180 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0116901  normal  0.597773 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  35.24 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2621  CheW-like protein  28.24 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  34.91 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1018  pilus biogenesis protein  30.34 
 
 
176 aa  63.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.708664  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0894  CheW protein  30.34 
 
 
176 aa  63.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  32.48 
 
 
184 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  26.53 
 
 
179 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  32.48 
 
 
184 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  32.48 
 
 
184 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0316337 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01604  pilus biogenesis protein  30.34 
 
 
176 aa  60.1  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.329291  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  25.95 
 
 
183 aa  58.9  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  32.06 
 
 
184 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0516  CheW protein  32.98 
 
 
171 aa  56.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3087  CheW protein  31.87 
 
 
176 aa  56.6  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.166967 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05340  twitching motility protein PilI  30.11 
 
 
178 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0510  twitching motility protein PilI  30.11 
 
 
178 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2902  putative CheW protein  30 
 
 
181 aa  54.7  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0490  CheW-like protein  28.81 
 
 
179 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  25.17 
 
 
178 aa  53.9  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5032  type IV pilus protein PilI  27.97 
 
 
179 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2157  putative CheW protein  25.97 
 
 
179 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  27.27 
 
 
189 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.2 
 
 
165 aa  52.4  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3769  putative CheW protein  25 
 
 
181 aa  52.4  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3632  twitching motility protein PilI  21.43 
 
 
179 aa  52  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3247  CheW protein  36.79 
 
 
172 aa  51.2  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  31.48 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2470  response regulator receiver modulated CheW protein  26.9 
 
 
324 aa  49.3  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  23.53 
 
 
478 aa  48.1  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  28.89 
 
 
515 aa  48.1  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0331  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.99 
 
 
173 aa  47.8  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.337865  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0309  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.99 
 
 
173 aa  47.8  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0405  putative CheW protein  29.03 
 
 
177 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1688  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.99 
 
 
173 aa  47.8  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  27.37 
 
 
178 aa  47.4  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  25 
 
 
205 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  28.7 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1871  CheW protein  32.18 
 
 
185 aa  47  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.61 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  33.33 
 
 
161 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  32.56 
 
 
164 aa  45.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0723  putative CheW protein  34.09 
 
 
142 aa  45.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  32.58 
 
 
159 aa  45.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  23.53 
 
 
178 aa  45.4  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.12 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1368  chemotaxis protein CheW  28.12 
 
 
172 aa  43.9  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2190  CheW protein  26.97 
 
 
199 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  27.48 
 
 
306 aa  43.9  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  30.12 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  30.12 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  30.12 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  30.12 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  30.12 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  30.12 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2380  CheW protein  28.15 
 
 
177 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  27.27 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  23.26 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4233  putative CheW protein  28.03 
 
 
168 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000281  chemotaxis protein CheV  32.1 
 
 
342 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.261322  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2029  CheW protein  29.9 
 
 
200 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  35.19 
 
 
306 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  35.19 
 
 
306 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  27.38 
 
 
306 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  28.89 
 
 
165 aa  42.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  35.19 
 
 
308 aa  42.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05890  hypothetical protein  32.1 
 
 
326 aa  42.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2182  CheW protein  34.21 
 
 
164 aa  42.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0206  CheW domain protein  30 
 
 
164 aa  42.4  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00161643  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  28.92 
 
 
159 aa  42  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  28.92 
 
 
159 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0751  CheW protein  26.92 
 
 
169 aa  42  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  30.95 
 
 
162 aa  42  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  26 
 
 
141 aa  42  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  29.41 
 
 
308 aa  42.4  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0724  CheW protein  28.41 
 
 
171 aa  42  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1489  CheW domain-containing protein  27.83 
 
 
168 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00055258  normal  0.88086 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2144  CheW-like protein  26.85 
 
 
313 aa  41.6  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  27.06 
 
 
520 aa  41.6  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1611  CheW protein  23.33 
 
 
141 aa  41.6  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00323467  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  26.96 
 
 
309 aa  41.2  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.04 
 
 
164 aa  41.6  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>