More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1066 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0922  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  100 
 
 
99 aa  194  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.425592 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1066  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  100 
 
 
99 aa  194  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3888  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  66.27 
 
 
105 aa  105  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0912284  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1766  competence protein ComEA  62.34 
 
 
89 aa  99.4  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0368807  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2222  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  64.79 
 
 
100 aa  93.2  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0466  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  46.88 
 
 
265 aa  84.7  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2698  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  41.46 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.48092  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3100  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  41.46 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0329  DNA uptake protein  54.84 
 
 
234 aa  77.8  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2662  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  57.38 
 
 
105 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.648617  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1699  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  41.41 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17420  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  50 
 
 
279 aa  75.1  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.711078  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0940  putative DNA uptake protein, ComEA-like protein  51.28 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.705703 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1008  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  53.03 
 
 
114 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000463906  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1756  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  40.4 
 
 
181 aa  73.9  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1813  DNA-binding protein, putative  57.38 
 
 
121 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1682  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  55.74 
 
 
225 aa  73.6  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00173147  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1647  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  55.74 
 
 
225 aa  73.6  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1508  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  58.93 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0575  hypothetical protein  47.37 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2476  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  55.74 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2544  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  55.74 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.644466  normal  0.0231779 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1054  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  47.37 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1013  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  47.37 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192712  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1612  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  58.62 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1103  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  53.33 
 
 
187 aa  72  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000407291  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2731  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  58.62 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0259304 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1646  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  58.62 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.330475  normal  0.397521 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1704  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  49.18 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2642  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  55.74 
 
 
121 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.377933 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1623  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  58.62 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0037  competence protein ComEA  47.56 
 
 
79 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0368973  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0011  competence protein ComEA  47.56 
 
 
79 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00025095  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0010  competence protein ComEA  46.34 
 
 
79 aa  70.9  0.000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1428  hypothetical protein  54.05 
 
 
173 aa  70.5  0.000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1520  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  49.12 
 
 
107 aa  70.5  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216127  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2087  comE operon protein 1, putative  48.48 
 
 
254 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1157  comE operon protein 1, putative  42.42 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4167  DNA-binding protein  44.74 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3267  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  49.18 
 
 
271 aa  69.3  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00676892  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2375  putative comE operon protein 1  48.48 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2489  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  43.48 
 
 
99 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.632838  normal  0.0131987 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0781  competence protein CelA  42.42 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.918663  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2562  hypothetical protein  50 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2071  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  50 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20070  ComEA-related protein  59.02 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2372  putative DNA uptake protein, ComEA-like  48.72 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170687  normal  0.307117 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2137  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  42.86 
 
 
100 aa  67.8  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1944  DNA uptake protein related DNA-binding protein  49.18 
 
 
200 aa  67.8  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.727384  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1521  late competence protein required for DNA binding and uptake  45.9 
 
 
231 aa  68.2  0.00000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3915  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  50.82 
 
 
269 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.261792  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1507  hypothetical protein  60.38 
 
 
103 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.24688e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2830  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  46.67 
 
 
230 aa  67.8  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.192028  normal  0.919156 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0989  hypothetical protein  50 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0962  DNA uptake protein or related DNA-binding protein  45.31 
 
 
109 aa  67.4  0.00000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0624  hypothetical protein  54.69 
 
 
115 aa  67  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1714  DNA transport competence protein  47.89 
 
 
109 aa  67  0.00000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0133378  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0230  acetohydroxy acid synthase large subunit  54.69 
 
 
115 aa  67  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1644  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  47.89 
 
 
109 aa  67  0.00000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.374375  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1407  hypothetical protein  54.69 
 
 
115 aa  67  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3093  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  51.72 
 
 
107 aa  67  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000182901 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2994  helix-hairpin-helix motif  48.65 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.358565  hitchhiker  0.00170682 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3053  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  37.68 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0339  hypothetical protein  43.37 
 
 
83 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00775538  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3304  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  49.21 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0506678  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2662  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  49.18 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0963672  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13270  DNA uptake protein  51.61 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0753  hypothetical protein  47.3 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3003  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  44.87 
 
 
91 aa  65.5  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.347216  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2512  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  45.9 
 
 
213 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1375  hypothetical protein  58.93 
 
 
321 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.737555  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12460  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  48.33 
 
 
285 aa  65.5  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.214678  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0032  hypothetical protein  56.9 
 
 
231 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0867768  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0826  helix-hairpin-helix DNA-binding, class 1  40 
 
 
355 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0217462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2221  putative comE protein  56.9 
 
 
231 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2573  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  51.72 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73465  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1737  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  47.54 
 
 
290 aa  64.3  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2387  hypothetical protein  56.9 
 
 
202 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0930  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  48.44 
 
 
114 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2803  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  50.82 
 
 
277 aa  64.3  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5146  hypothetical protein  58.93 
 
 
207 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1136  hypothetical protein  56.9 
 
 
202 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.381849  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2207  hypothetical protein  56.9 
 
 
199 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2259  putative comE protein  56.9 
 
 
202 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.235936  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1668  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  41.94 
 
 
206 aa  63.9  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1865  hypothetical protein  56.9 
 
 
202 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10240  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  49.18 
 
 
243 aa  64.3  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.773806  hitchhiker  0.000000381007 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1869  hypothetical protein  57.89 
 
 
203 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.391692  hitchhiker  0.000308285 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6234  hypothetical protein  57.89 
 
 
203 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.815006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1845  hypothetical protein  57.89 
 
 
203 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311424  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1815  putative DNA uptake protein, ComEA-like protein  56.67 
 
 
196 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.15312 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0934  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  48.44 
 
 
114 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0507  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  46.38 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3189  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  49.18 
 
 
286 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1428  hypothetical protein  57.89 
 
 
207 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441194  decreased coverage  0.00108668 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1879  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  40.59 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.382969  normal  0.520774 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2156  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  39.33 
 
 
90 aa  62.8  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.367346  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0122  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  49.18 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.214821  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0729  helix-hairpin-helix DNA-binding, class 1  52.11 
 
 
126 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0643  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  42.86 
 
 
210 aa  63.2  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000019703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>