More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0853 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
288 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
288 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  71.53 
 
 
288 aa  378  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  71.69 
 
 
280 aa  362  3e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  67.96 
 
 
285 aa  356  1.9999999999999998e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  66.79 
 
 
308 aa  332  3e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  66.67 
 
 
297 aa  328  4e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  66.43 
 
 
283 aa  329  4e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2399  phosphomethylpyrimidine kinase  68.77 
 
 
287 aa  320  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3067  phosphomethylpyrimidine kinase  65.58 
 
 
299 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119732  normal  0.199028 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3294  phosphomethylpyrimidine kinase  65.45 
 
 
293 aa  297  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  54.18 
 
 
273 aa  268  5.9999999999999995e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2204  phosphomethylpyrimidine kinase  64.96 
 
 
294 aa  258  9e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.811485 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  54.09 
 
 
303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  54.8 
 
 
303 aa  252  6e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0100  bifunctional hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase/hydroxy-methylpyrimidine kinase  52.96 
 
 
301 aa  248  7e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504997  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  53.79 
 
 
268 aa  248  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  53.93 
 
 
268 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  51.82 
 
 
268 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  50.74 
 
 
270 aa  238  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  53.56 
 
 
268 aa  236  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
268 aa  235  6e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  50.55 
 
 
271 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  47.17 
 
 
267 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0169  phosphomethylpyrimidine kinase  56.2 
 
 
276 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0889  phosphomethylpyrimidine kinase  49.65 
 
 
293 aa  230  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000698623  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  50.36 
 
 
285 aa  229  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  46.42 
 
 
272 aa  229  3e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0212  phosphomethylpyrimidine kinase  52.26 
 
 
290 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  51.7 
 
 
271 aa  227  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  48.12 
 
 
269 aa  227  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  51.3 
 
 
270 aa  226  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  48.75 
 
 
285 aa  224  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  46.39 
 
 
264 aa  224  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  47.35 
 
 
260 aa  224  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  46.42 
 
 
267 aa  224  2e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  52.26 
 
 
271 aa  223  4e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
269 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  51.33 
 
 
263 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  46.39 
 
 
264 aa  222  7e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  48.09 
 
 
265 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  46.59 
 
 
266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  50.93 
 
 
265 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  45.83 
 
 
270 aa  219  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  48.36 
 
 
497 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 
266 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  50.18 
 
 
260 aa  218  8.999999999999998e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  43.75 
 
 
264 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  48.2 
 
 
492 aa  216  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  48.06 
 
 
490 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0134  phosphomethylpyrimidine kinase  53.18 
 
 
271 aa  215  5.9999999999999996e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  46.21 
 
 
262 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  51.32 
 
 
269 aa  215  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  52.27 
 
 
275 aa  214  9e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  44.06 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  42.64 
 
 
269 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0131  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  50.37 
 
 
269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.752831  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  48.91 
 
 
497 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  48.87 
 
 
264 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  48.16 
 
 
297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1004  phosphomethylpyrimidine kinase  48.18 
 
 
275 aa  212  5.999999999999999e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  46.49 
 
 
267 aa  211  7.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  49.64 
 
 
484 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  48.31 
 
 
264 aa  210  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  44.06 
 
 
267 aa  210  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0209  phosphomethylpyrimidine kinase  48.54 
 
 
304 aa  210  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.606568  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  44.66 
 
 
267 aa  210  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 
323 aa  209  5e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0218  phosphomethylpyrimidine kinase  48.18 
 
 
291 aa  209  6e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.940459  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1407  phosphomethylpyrimidine kinase  48.51 
 
 
267 aa  208  7e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  49.82 
 
 
484 aa  208  9e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  45.49 
 
 
277 aa  207  1e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  49.06 
 
 
264 aa  207  1e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  43.56 
 
 
267 aa  207  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5777  phosphomethylpyrimidine kinase  48.34 
 
 
277 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269735  normal  0.0629461 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  43.78 
 
 
260 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  45.99 
 
 
264 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  49.25 
 
 
268 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  44.06 
 
 
266 aa  206  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  44.06 
 
 
266 aa  206  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  44.06 
 
 
266 aa  206  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  50.37 
 
 
266 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  44.06 
 
 
266 aa  206  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  44.06 
 
 
266 aa  206  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  44.06 
 
 
266 aa  206  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  43.61 
 
 
266 aa  206  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  44.06 
 
 
266 aa  205  6e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  43.68 
 
 
266 aa  205  7e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  43.68 
 
 
266 aa  205  7e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  45.45 
 
 
270 aa  205  8e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  44.49 
 
 
270 aa  204  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  44.49 
 
 
270 aa  204  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  45.45 
 
 
270 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  45.55 
 
 
494 aa  204  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  48.74 
 
 
274 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  43.3 
 
 
266 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  44.11 
 
 
270 aa  203  3e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  48.09 
 
 
269 aa  202  5e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  42.91 
 
 
266 aa  202  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  48.67 
 
 
283 aa  202  5e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>