16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0621 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0621  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000560407  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4344  hypothetical protein  49.02 
 
 
60 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0307  hypothetical protein  51.16 
 
 
60 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31710  hypothetical protein  44.44 
 
 
61 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5172  hypothetical protein  47.73 
 
 
60 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.147523  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0193  hypothetical protein  47.73 
 
 
60 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.813264  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5079  hypothetical protein  47.73 
 
 
60 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215609  normal  0.98479 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5232  hypothetical protein  47.73 
 
 
60 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0290  hypothetical protein  47.73 
 
 
60 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.413626 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0085  hypothetical protein  48 
 
 
59 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03710  hypothetical protein  47.06 
 
 
60 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191808 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0375  hypothetical protein  45.1 
 
 
60 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981262  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0564  hypothetical protein  41.46 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.746632  normal  0.169391 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1579  hypothetical protein  39.47 
 
 
72 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1978  hypothetical protein  40 
 
 
61 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000250196  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2850  Protein of unknown function DUF2292  40 
 
 
53 aa  40.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>