65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0605 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0605  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  100 
 
 
216 aa  452  1e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.452129 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1661  CRISPR-associated protein Cas4  47.32 
 
 
214 aa  197  8e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.975016  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1299  hypothetical protein  47.06 
 
 
214 aa  195  5e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.938866  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2974  CRISPR-associated Cas4 family protein  47.52 
 
 
212 aa  188  5e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1432  CRISPR-associated Cas4 family protein  45.15 
 
 
214 aa  186  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.343364  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02697  crispr-associated protein Cas4  44.12 
 
 
210 aa  182  5e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  47.4 
 
 
216 aa  181  7e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3523  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  46.34 
 
 
218 aa  180  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  44.61 
 
 
215 aa  179  4e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  48.45 
 
 
199 aa  177  8e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0793  CRISPR-associated protein Cas4  46.46 
 
 
209 aa  175  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813459  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  43.84 
 
 
255 aa  172  4e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1632  CRISPR-associated protein Cas4  45.18 
 
 
218 aa  171  6e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.98908 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1975  CRISPR-associated protein Cas4  43.06 
 
 
220 aa  167  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360978  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1481  CRISPR-associated protein Cas4  40.19 
 
 
222 aa  164  7e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3647  CRISPR-associated protein Cas4  39.17 
 
 
225 aa  163  2e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0832  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  44.27 
 
 
228 aa  162  4e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2187  CRISPR-associated protein Cas4  38.89 
 
 
223 aa  161  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  39.7 
 
 
210 aa  161  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  41.88 
 
 
206 aa  155  6e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1006  CRISPR-associated Cas4 family protein  39.71 
 
 
219 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  40.5 
 
 
204 aa  152  3e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0494  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  41.62 
 
 
214 aa  152  3e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4331  CRISPR-associated Cas4 family protein  39.01 
 
 
222 aa  151  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  8.54832e-05  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0479  RecB family exonuclease  40.28 
 
 
234 aa  150  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.957708  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  41.58 
 
 
205 aa  149  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0851  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  37.33 
 
 
224 aa  147  1e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2723  CRISPR-associated Cas4 family protein  39.89 
 
 
208 aa  145  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3906  CRISPR-associated Cas4 family protein  42.35 
 
 
212 aa  146  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164887  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0235  CRISPR-associated Cas4 family protein  41.24 
 
 
211 aa  142  5e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2652  CRISPR-associated protein Cas4  38.46 
 
 
212 aa  140  2e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0303971  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1155  CRISPR-associated Cas4 family protein  40.1 
 
 
212 aa  138  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  39.29 
 
 
218 aa  134  1e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1478  CRISPR-associated protein Cas4  39.9 
 
 
218 aa  133  2e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.470243 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  35.75 
 
 
194 aa  131  8e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  37.7 
 
 
196 aa  130  2e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  1.76829e-05 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  34.8 
 
 
570 aa  119  4e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  34.78 
 
 
559 aa  116  2e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.98 
 
 
544 aa  117  2e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  37.43 
 
 
545 aa  113  2e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3345  CRISPR-associated Cas4 family protein  33 
 
 
221 aa  108  4e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0218123  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  33.16 
 
 
200 aa  108  7e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  34.17 
 
 
190 aa  106  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  33 
 
 
553 aa  105  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  31.75 
 
 
196 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  32.45 
 
 
196 aa  99  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  1.01589e-06 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  31.91 
 
 
196 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  31.71 
 
 
550 aa  95.9  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  1.41365e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  29.72 
 
 
594 aa  94.4  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  39.71 
 
 
580 aa  90.5  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2343  hypothetical protein  39.71 
 
 
333 aa  89.7  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  28.37 
 
 
598 aa  84.7  1e-15  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.65 
 
 
193 aa  83.6  2e-15  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.37 
 
 
190 aa  83.2  3e-15  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  29.44 
 
 
558 aa  80.5  2e-14  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.32 
 
 
198 aa  67.8  1e-10  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.66 
 
 
198 aa  67  2e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  28.42 
 
 
190 aa  65.9  5e-10  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.75 
 
 
172 aa  49.7  3e-05  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3220  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.96 
 
 
204 aa  48.9  6e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.680334  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  23.62 
 
 
202 aa  48.5  7e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0637  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.49 
 
 
191 aa  47  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.042721  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6022  CRISPR-associated protein Cas4  27.04 
 
 
195 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  0.45154 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0774  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  23.98 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15190  CRISPR-associated protein Cas4  19.79 
 
 
198 aa  41.6  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>