44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0576 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0576  putative site-specific recombinase, prophage insertion  100 
 
 
682 aa  1397    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000232694  normal  0.0137689 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1604  hypothetical protein  47.7 
 
 
679 aa  551  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0288386  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1454  putative site-specific recombinase  39.54 
 
 
826 aa  462  1e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0963  site-specific recombinase  38.81 
 
 
826 aa  458  1e-127  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.482047  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0463  site-specific recombinase  39.13 
 
 
686 aa  424  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0910  site-specific recombinase-like protein  37.84 
 
 
810 aa  422  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0375775  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0363  putative site-specific recombinase  41.12 
 
 
672 aa  423  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.731088  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0607  site-specific recombinase  39.01 
 
 
669 aa  398  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248138  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1614  site-specific recombinase  40.51 
 
 
698 aa  386  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132056  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1665  site-specific recombinase Gcr  37.41 
 
 
673 aa  371  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.287576  normal  0.977345 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1488  putative site-specific recombinase  30.67 
 
 
676 aa  318  2e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6101  site-specific recombinase  29.95 
 
 
652 aa  271  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.542674  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2558  putative membrane proten  29.34 
 
 
705 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3377  putative membrane proten  29.34 
 
 
705 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3343  site-specific recombinase  29.08 
 
 
705 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1151  putative membrane proten  29.34 
 
 
705 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0289  putative membrane proten  29.34 
 
 
705 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3386  hypothetical protein  29.08 
 
 
705 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1266  hypothetical protein  29.39 
 
 
704 aa  258  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942074  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0942  putative site-specific recombinase transmembrane protein  30.68 
 
 
694 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.145069 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2375  membrane proten, putative  29.6 
 
 
624 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.552217  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4002  putative site-specific recombinase transmembrane protein  28.73 
 
 
722 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485681  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0599  site-specific recombinase-like protein  29.77 
 
 
707 aa  247  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264915  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3901  putative site-specific recombinase transmembrane protein  30.08 
 
 
694 aa  246  6.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0800854 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0877  putative site-specific recombinase transmembrane protein  30.48 
 
 
694 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.104417 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0709  site-specific recombinase-like protein  29.36 
 
 
704 aa  243  9e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0676  site-specific recombinase-like protein  29.36 
 
 
704 aa  243  9e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119652  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0225  site-specific recombinase-like  29.36 
 
 
704 aa  243  9e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277689  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2054  putative site-specific recombinase transmembrane protein  28.66 
 
 
706 aa  238  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0624  site-specific recombinase-like protein  29.73 
 
 
707 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.232961  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3796  site-specific recombinase-like  29.56 
 
 
707 aa  232  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279951  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1056  putative site-specific recombinase transmembrane protein  29.12 
 
 
705 aa  232  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0715578  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2676  site-specific recombinase-like protein  30.31 
 
 
728 aa  231  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680243  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1023  putative site-specific recombinase transmembrane protein  28.77 
 
 
703 aa  227  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.926056  normal  0.592134 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1012  putative site-specific recombinase transmembrane protein  30.18 
 
 
696 aa  228  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.644984 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0530  putative site-specific recombinase transmembrane protein  28.26 
 
 
684 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3662  putative site-specific recombinase transmembrane protein  28.3 
 
 
654 aa  212  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0720  putative site-specific recombinase transmembrane protein  29.01 
 
 
655 aa  207  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0359  putative site-specific recombinase transmembrane protein  28.95 
 
 
660 aa  203  9e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0348  putative site-specific recombinase transmembrane protein  29.22 
 
 
660 aa  200  7e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0876893  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3469  putative site-specific recombinase transmembrane protein  28.18 
 
 
700 aa  198  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379972  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0436  putative site-specific recombinase transmembrane protein  29.08 
 
 
663 aa  197  6e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.27543 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0492  putative site-specific recombinase transmembrane protein  28.35 
 
 
656 aa  192  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4468  putative site-specific recombinase transmembrane protein  26.96 
 
 
657 aa  182  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.410033 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>