More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0234 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  100 
 
 
381 aa  749    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0185  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  70.32 
 
 
379 aa  546  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107492  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  70 
 
 
407 aa  536  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2597  cytochrome c assembly family protein  69.81 
 
 
396 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  69.68 
 
 
401 aa  528  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3712  cytochrome C assembly protein  69.81 
 
 
396 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3741  cytochrome c assembly family protein  69.81 
 
 
408 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124691  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3034  cytochrome c assembly family protein  68.42 
 
 
396 aa  531  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1958  cytochrome C assembly protein  69.81 
 
 
396 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.32068  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3770  cytochrome C assembly protein  69.81 
 
 
396 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3512  cytochrome C assembly protein  69.81 
 
 
396 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3135  cytochrome C assembly protein  69.81 
 
 
396 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  68.73 
 
 
396 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0283  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  69.54 
 
 
396 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  68.73 
 
 
396 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0361  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  68.73 
 
 
396 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342475  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  68.46 
 
 
396 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  68.73 
 
 
396 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  68.73 
 
 
396 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1528  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  70.81 
 
 
394 aa  519  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.890342  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3609  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  68 
 
 
401 aa  520  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.122456  hitchhiker  0.00000004022 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0348  cytochrome c assembly protein  67.65 
 
 
403 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00374335 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  68.55 
 
 
395 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2805  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  66.85 
 
 
405 aa  508  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  68.55 
 
 
395 aa  508  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  69.89 
 
 
395 aa  503  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  56.81 
 
 
444 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374119  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5587  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  57.74 
 
 
446 aa  468  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405546  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0712  cytochrome c assembly protein  57.04 
 
 
444 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.189956 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0774  cytochrome c assembly protein  55.84 
 
 
465 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1133  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  56.64 
 
 
438 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0986  cytochrome c assembly protein  57.74 
 
 
444 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.472219  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0666  cytochrome c assembly protein  55.94 
 
 
463 aa  461  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  60.37 
 
 
391 aa  449  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4837  cytochrome c assembly protein  53.95 
 
 
442 aa  438  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294706  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  59.95 
 
 
405 aa  439  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0434  putative cytochrome c asssembly protein  53.08 
 
 
473 aa  433  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.105274  normal  0.205387 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  54.97 
 
 
390 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  56.38 
 
 
395 aa  408  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0091  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  68.56 
 
 
454 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  50.91 
 
 
395 aa  333  3e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  50.91 
 
 
352 aa  332  5e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  43.27 
 
 
284 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.92 
 
 
282 aa  201  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  43.75 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.37 
 
 
283 aa  196  7e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  41.97 
 
 
284 aa  190  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  41.39 
 
 
276 aa  188  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  40.43 
 
 
284 aa  186  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.89 
 
 
282 aa  186  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  40.88 
 
 
283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.19 
 
 
282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  39.22 
 
 
278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  44 
 
 
282 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.39 
 
 
271 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  43.11 
 
 
271 aa  179  8e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  43.88 
 
 
271 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1049  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.58 
 
 
310 aa  177  3e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143982  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  42.41 
 
 
271 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  42.41 
 
 
271 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  41.36 
 
 
271 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  37.5 
 
 
283 aa  169  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0575  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like protein  42.79 
 
 
320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  40.75 
 
 
278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.77 
 
 
284 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  38.43 
 
 
329 aa  160  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.39 
 
 
283 aa  159  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40.28 
 
 
323 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  36.61 
 
 
283 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.47 
 
 
330 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  36.47 
 
 
304 aa  148  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.09 
 
 
272 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1519  cytochrome c assembly protein  41.71 
 
 
255 aa  145  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.47 
 
 
339 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.7 
 
 
309 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0929  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.25 
 
 
346 aa  143  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6117  cytochrome c assembly protein  35.55 
 
 
396 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.242647  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  33.23 
 
 
325 aa  140  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.02 
 
 
328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.6 
 
 
321 aa  139  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  34.75 
 
 
315 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  38.43 
 
 
378 aa  139  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  34.36 
 
 
315 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2075  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.9 
 
 
258 aa  138  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1248  heme transporter  34.11 
 
 
304 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0513  cytochrome c assembly protein  35.78 
 
 
397 aa  134  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  0.322787 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02970  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.44 
 
 
333 aa  134  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2200  cytochrome c assembly protein  37.22 
 
 
327 aa  131  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09971  putative heme transporter  33.97 
 
 
311 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.671585  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3781  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.37 
 
 
1054 aa  129  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000633001  normal  0.0119892 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16811  putative heme transporter  34.75 
 
 
318 aa  129  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  32.85 
 
 
309 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4095  cytochrome c assembly protein  38.05 
 
 
325 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16923  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  35.29 
 
 
309 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0869  cytochrome c assembly protein  33.46 
 
 
327 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.0057057  normal  0.189022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4512  cytochrome c assembly protein  35.84 
 
 
328 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4515  cytochrome c assembly protein  37.33 
 
 
330 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  34.39 
 
 
309 aa  126  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5672  cytochrome c assembly protein  36.32 
 
 
326 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3702  cytochrome c assembly protein  36.32 
 
 
326 aa  126  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>