More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0227 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0850  DNA topoisomerase I  49.82 
 
 
884 aa  755    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.999873  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2831  DNA topoisomerase I  48.75 
 
 
894 aa  806    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.442826 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1529  DNA topoisomerase I  53.31 
 
 
779 aa  696    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.23259e-34 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  55.78 
 
 
757 aa  717    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3631  DNA topoisomerase I  46.87 
 
 
910 aa  778    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.391987 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0569  DNA topoisomerase I  49.12 
 
 
877 aa  809    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  59.79 
 
 
768 aa  833    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1133  DNA topoisomerase I  47.16 
 
 
816 aa  749    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3847  DNA topoisomerase I  48.41 
 
 
977 aa  768    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0674028 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2711  DNA topoisomerase I  53.31 
 
 
779 aa  696    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000391579  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1756  DNA topoisomerase I  49 
 
 
904 aa  791    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0604  DNA topoisomerase I  49.12 
 
 
877 aa  808    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2326  DNA topoisomerase I  53.39 
 
 
799 aa  828    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.240337  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  59.46 
 
 
851 aa  801    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1387  DNA topoisomerase I  48.36 
 
 
884 aa  782    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903307  normal  0.17492 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2652  DNA topoisomerase I  60.97 
 
 
759 aa  798    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2522  DNA topoisomerase I  61.12 
 
 
759 aa  801    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  54.12 
 
 
756 aa  718    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1137  DNA topoisomerase I  45.21 
 
 
900 aa  728    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1005  DNA topoisomerase I  47.56 
 
 
894 aa  757    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.387965  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0323  DNA topoisomerase I  46.75 
 
 
820 aa  735    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0218677  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0010  DNA topoisomerase I  60.26 
 
 
857 aa  1008    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1712  DNA topoisomerase I  49.28 
 
 
911 aa  780    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.583112  normal  0.397735 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3010  DNA topoisomerase I  52.61 
 
 
783 aa  848    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.846821  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3826  DNA topoisomerase I  47.06 
 
 
852 aa  730    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801079  normal  0.0383535 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2178  DNA topoisomerase I  49.88 
 
 
884 aa  756    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  50.66 
 
 
841 aa  668    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1869  DNA topoisomerase I  49.41 
 
 
815 aa  803    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04049  DNA topoisomerase I  50.36 
 
 
830 aa  798    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  55.3 
 
 
758 aa  717    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3508  DNA topoisomerase I  47.22 
 
 
909 aa  785    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.989959 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3671  DNA topoisomerase I  49.36 
 
 
885 aa  811    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3202  DNA topoisomerase I  50.23 
 
 
915 aa  837    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3309  DNA topoisomerase I  47.7 
 
 
888 aa  790    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2419  DNA topoisomerase I  47.62 
 
 
911 aa  743    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0527527  normal  0.116125 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1803  DNA topoisomerase I  47.09 
 
 
859 aa  706    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.120095  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0594  DNA topoisomerase I  42.54 
 
 
827 aa  647    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0750  DNA topoisomerase I  46.56 
 
 
820 aa  734    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3160  DNA topoisomerase I  44.18 
 
 
907 aa  709    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.973259  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  49.43 
 
 
836 aa  645    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2239  DNA topoisomerase I  48.03 
 
 
922 aa  746    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0515029  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0227  DNA topoisomerase I  100 
 
 
845 aa  1748    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0428468  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2277  DNA topoisomerase I  53.9 
 
 
854 aa  801    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0137658 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3033  DNA topoisomerase I  47.49 
 
 
914 aa  739    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298843  normal  0.412116 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2437  DNA topoisomerase I  49.16 
 
 
936 aa  778    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0547767  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0729  DNA topoisomerase I  48.63 
 
 
891 aa  778    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.074453  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  54 
 
 
758 aa  702    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2339  DNA topoisomerase I  47.4 
 
 
893 aa  751    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.786994  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1211  DNA topoisomerase I  47.37 
 
 
849 aa  757    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3417  DNA topoisomerase I  49.88 
 
 
961 aa  791    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0414891  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4733  DNA topoisomerase I  49.46 
 
 
916 aa  755    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.767724  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1354  DNA topoisomerase I  48.94 
 
 
849 aa  788    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.75959  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3535  DNA topoisomerase I  48.26 
 
 
911 aa  759    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1505  DNA topoisomerase I  49.28 
 
 
896 aa  803    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1645  DNA topoisomerase I  47.37 
 
 
924 aa  783    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.247282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4350  DNA topoisomerase I  47.65 
 
 
913 aa  783    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.350571  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2632  DNA topoisomerase I  54.16 
 
 
797 aa  862    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.080388  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1282  DNA topoisomerase I  50 
 
 
867 aa  808    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390974  normal  0.233625 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2316  DNA topoisomerase I  50.18 
 
 
880 aa  763    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3591  DNA topoisomerase I  51.79 
 
 
824 aa  816    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.405231  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  59.36 
 
 
765 aa  828    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  59.46 
 
 
851 aa  801    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0932  DNA topoisomerase I  48.74 
 
 
914 aa  789    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231933  normal  0.891499 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0191  DNA topoisomerase I  54.81 
 
 
823 aa  805    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3660  DNA topoisomerase I  54.05 
 
 
783 aa  741    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.739108  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0843  DNA topoisomerase I  46.93 
 
 
869 aa  797    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.077347  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1295  DNA topoisomerase I  48.13 
 
 
884 aa  780    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722616  decreased coverage  0.00167989 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0528  DNA topoisomerase I  52.35 
 
 
776 aa  699    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000697651  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1934  DNA topoisomerase I  49.41 
 
 
815 aa  801    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0659  DNA topoisomerase I  48.8 
 
 
851 aa  755    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579537  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0086  DNA topoisomerase I  59.21 
 
 
765 aa  824    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000043689  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3914  DNA topoisomerase I  48.02 
 
 
901 aa  772    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445243  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2090  DNA topoisomerase I  52.3 
 
 
834 aa  854    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475207  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3308  DNA topoisomerase I  46.87 
 
 
910 aa  780    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.603325 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  49.72 
 
 
780 aa  632  1e-180  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  49.42 
 
 
789 aa  630  1e-179  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  50.32 
 
 
711 aa  622  1e-177  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3437  DNA topoisomerase I  42.29 
 
 
872 aa  617  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.500167 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  44.95 
 
 
793 aa  617  1e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2200  DNA topoisomerase I  42.86 
 
 
895 aa  609  1e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.170187  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0027  DNA topoisomerase I  41.15 
 
 
874 aa  610  1e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3274  DNA topoisomerase I  40.37 
 
 
910 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.384669 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1416  DNA topoisomerase I  41.19 
 
 
883 aa  599  1e-170  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0873  DNA topoisomerase I  42.66 
 
 
877 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.143011 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0846  DNA topoisomerase I  42.66 
 
 
877 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  48.73 
 
 
703 aa  591  1e-167  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2197  DNA topoisomerase I  40.36 
 
 
923 aa  590  1e-167  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.777958  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  49.76 
 
 
696 aa  591  1e-167  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  49.21 
 
 
703 aa  588  1e-166  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0657  DNA topoisomerase I  39.48 
 
 
913 aa  582  1.0000000000000001e-165  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  49.6 
 
 
702 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0030  DNA topoisomerase I  41.32 
 
 
881 aa  585  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  48.23 
 
 
710 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  45.7 
 
 
767 aa  584  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1704  DNA topoisomerase I  40.16 
 
 
858 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.11411  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41359  predicted protein  43.81 
 
 
840 aa  582  1e-164  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0907147 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04331  DNA topoisomerase I  41.42 
 
 
899 aa  581  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0369496  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32680  DNA topoisomerase I  39.34 
 
 
962 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  47.34 
 
 
697 aa  576  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  50.08 
 
 
693 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>