126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0188 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_0188  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 350 aa  711    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749903 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0013  peptidoglycan-binding LysM-like protein  41.71 
 
 		 403 aa  294  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.154454 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0020  peptidoglycan-binding LysM  42.57 
 
 		 343 aa  290  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.419154 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0096  Peptidoglycan-binding LysM  41.97 
 
 		 349 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3013  peptidoglycan-binding LysM  39.03 
 
 		 345 aa  263  3e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5114  Peptidoglycan-binding LysM  41.81 
 
 		 405 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3879  peptidoglycan-binding LysM  40.82 
 
 		 430 aa  259  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0834  peptidoglycan-binding LysM  40.28 
 
 		 401 aa  252  8.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4640  peptidoglycan-binding LysM  39.94 
 
 		 408 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4083  peptidoglycan-binding LysM  38.59 
 
 		 420 aa  248  8e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164352  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0069  signal peptide protein  38.24 
 
 		 390 aa  247  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3861  peptidoglycan-binding LysM  41.01 
 
 		 409 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3357  Peptidoglycan-binding LysM  38.82 
 
 		 364 aa  245  9e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3680  Peptidoglycan-binding LysM  38.53 
 
 		 395 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4687  peptidoglycan-binding LysM  39.61 
 
 		 417 aa  242  6e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0056  peptidoglycan-binding LysM  38.03 
 
 		 345 aa  239  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4050  peptidoglycan-binding LysM  36.83 
 
 		 426 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.021914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3409  peptidoglycan-binding LysM  39.64 
 
 		 388 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392654  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00210  lysin domain-containing protein  39.04 
 
 		 341 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3395  Peptidoglycan-binding LysM  36.83 
 
 		 419 aa  231  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3566  peptidoglycan-binding LysM  37.54 
 
 		 358 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0021  hypothetical protein  38.74 
 
 		 341 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156222  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0194  peptidoglycan-binding LysM  38.99 
 
 		 383 aa  229  5e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0282  putative signal peptide protein  38.51 
 
 		 387 aa  229  6e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0349  peptidoglycan-binding LysM  36.87 
 
 		 394 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0885534 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2629  peptidoglycan-binding LysM  38.28 
 
 		 338 aa  227  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.829323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0044  peptidoglycan-binding LysM  37.08 
 
 		 338 aa  225  8e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00180  peptidoglycan-binding LysM protein  38.25 
 
 		 341 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0309659  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0018  peptidoglycan-binding LysM  37.05 
 
 		 341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000019767  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2842  LysM domain-containing protein  37.03 
 
 		 341 aa  220  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0176  LysM domain protein  36.14 
 
 		 341 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0020  peptidoglycan-binding LysM  35.54 
 
 		 341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0022  hypothetical protein  32.69 
 
 		 352 aa  207  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.124597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2274  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  34.24 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514615 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2519  hypothetical protein  36.34 
 
 		 345 aa  199  7e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2649  hypothetical protein  36.34 
 
 		 345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0077  peptidoglycan-binding LysM  36.18 
 
 		 360 aa  191  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0025  peptidoglycan-binding LysM  33.81 
 
 		 368 aa  178  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0044  LysM domain-containing protein  34.77 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.764087  normal  0.149636 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0025  peptidoglycan-binding LysM  30.87 
 
 		 374 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0021  LysM domain-containing protein  33.06 
 
 		 361 aa  171  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0018  LysM domain protein  31.94 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0019  Peptidoglycan-binding LysM  31.94 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3735  peptidoglycan-binding LysM  31.71 
 
 		 365 aa  170  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.315042  hitchhiker  0.00230648 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0036  peptidoglycan-binding LysM  32.04 
 
 		 367 aa  170  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.971795  normal  0.107314 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0032  peptidoglycan-binding LysM  32.25 
 
 		 362 aa  168  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3586  Peptidoglycan-binding LysM  32.99 
 
 		 377 aa  168  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0076  putative cell wall degradation enzyme  32.34 
 
 		 353 aa  168  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0025  peptidoglycan-binding LysM  33.05 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0039  peptidoglycan-binding LysM  32.6 
 
 		 369 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.357546 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2087  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  32.73 
 
 		 393 aa  166  5e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0028  peptidoglycan-binding LysM  31.06 
 
 		 374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.198583 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0036  peptidoglycan-binding LysM  30.79 
 
 		 374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243599 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2472  hypothetical protein  31.53 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0032  peptidoglycan-binding LysM  30.6 
 
 		 376 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0033  peptidoglycan-binding LysM  30.6 
 
 		 376 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0030  peptidoglycan-binding LysM  30.79 
 
 		 374 aa  162  6e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.772252  hitchhiker  0.00540943 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0032  Peptidoglycan-binding LysM  30.6 
 
 		 376 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235775 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0033  LysM domain-containing protein  31 
 
 		 378 aa  161  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0028  peptidoglycan-binding LysM  30.6 
 
 		 376 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2464  peptidoglycan-binding LysM  30.61 
 
 		 377 aa  157  4e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002058  LysM domain-containing protein  29.97 
 
 		 364 aa  153  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.778363  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2136  hypothetical protein  29.7 
 
 		 377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04054  LysM domain protein  32.35 
 
 		 366 aa  145  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00390  hypothetical protein  30 
 
 		 364 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1930  hypothetical protein  30.42 
 
 		 384 aa  136  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1866  peptidoglycan-binding LysM  29.68 
 
 		 384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00023  Peptidoglycan-binding LysM  26.18 
 
 		 367 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.574097  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0024  peptidoglycan-binding LysM  27.17 
 
 		 359 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2866  hypothetical protein  32.09 
 
 		 329 aa  113  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2551  LysM domain-containing protein  29.57 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0889  peptidoglycan-binding LysM  27.07 
 
 		 333 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000030411  hitchhiker  0.00000000000323717 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0409  LysM domain-containing protein  25.14 
 
 		 333 aa  106  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000322112  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0501  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  26.49 
 
 		 429 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0530  peptidoglycan-binding LysM  25.14 
 
 		 331 aa  100  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1527  Peptidoglycan-binding LysM  28.61 
 
 		 338 aa  97.1  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27524e-30 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3691  peptidoglycan-binding LysM  27.3 
 
 		 340 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000027016  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2713  Peptidoglycan-binding LysM  28.38 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.292431  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2695  peptidoglycan-binding LysM  25.72 
 
 		 435 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.123815 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2701  peptidoglycan-binding LysM  24.92 
 
 		 440 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2887  Peptidoglycan-binding LysM  25.67 
 
 		 440 aa  89.4  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2794  Peptidoglycan-binding LysM  25.67 
 
 		 440 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0244523  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3268  Peptidoglycan-binding LysM  25.16 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000361142  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0537  peptidoglycan-binding LysM  24.91 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201658  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0326  LysM domain protein  46.51 
 
 		 377 aa  55.8  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0219877  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  46 
 
 		 219 aa  55.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3954  hypothetical protein  46.81 
 
 		 405 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2091  hypothetical protein  37.18 
 
 		 167 aa  53.9  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2244  hypothetical protein  39.29 
 
 		 156 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2044  LysM domain/BON superfamily protein  44.44 
 
 		 143 aa  49.3  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  45.83 
 
 		 1051 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0991  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0156975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0233  peptidoglycan-binding LysM  39.58 
 
 		 242 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1342  peptidoglycan-binding LysM  43.14 
 
 		 389 aa  47  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.779699  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2328  peptidoglycan-binding LysM  37.7 
 
 		 234 aa  47  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000346433  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1039  LysM domain-containing protein  40 
 
 		 243 aa  46.6  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000199986  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1442  hypothetical protein  45.83 
 
 		 212 aa  46.2  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01655  hypothetical protein  44 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2006  Peptidoglycan-binding LysM  43.48 
 
 		 154 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.899391  normal  0.48043 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1755  peptidoglycan-binding LysM  30.67 
 
 		 195 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.273127 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>