More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0109 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
703 aa  1437    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3793  TonB-dependent siderophore receptor  41.76 
 
 
720 aa  518  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16695  normal  0.789951 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  39.04 
 
 
689 aa  476  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2705  TonB-dependent siderophore receptor  39.59 
 
 
705 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  39.66 
 
 
703 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0102  TonB-dependent siderophore receptor  38.62 
 
 
755 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058066  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4064  TonB-dependent siderophore receptor  39.09 
 
 
707 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3457  TonB-dependent siderophore receptor  38.95 
 
 
707 aa  458  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  35.63 
 
 
708 aa  449  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  38.52 
 
 
704 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0907  TonB-dependent siderophore receptor  38.45 
 
 
712 aa  450  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892024  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  38.15 
 
 
705 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0411  TonB-dependent siderophore receptor  37.13 
 
 
758 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4489  TonB-dependent siderophore receptor  38.34 
 
 
696 aa  438  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515859  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0227  TonB-dependent siderophore receptor  37.46 
 
 
738 aa  437  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2631  TonB-dependent siderophore receptor  39.2 
 
 
770 aa  434  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2754  TonB-dependent siderophore receptor  38.8 
 
 
747 aa  434  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  37.65 
 
 
746 aa  429  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2855  TonB-dependent siderophore receptor  38.71 
 
 
747 aa  432  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1329  TonB-dependent siderophore receptor  37.79 
 
 
701 aa  432  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.267924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0700  TonB-dependent siderophore receptor  35.96 
 
 
776 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0376627  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  36.95 
 
 
723 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  35.8 
 
 
742 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4232  TonB-dependent siderophore receptor  38.35 
 
 
747 aa  429  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  35.8 
 
 
728 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  35.52 
 
 
708 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0866  TonB-dependent siderophore receptor  37.06 
 
 
696 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.86038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26420  putative TonB-dependent receptor  36.25 
 
 
718 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316508  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1347  TonB-dependent siderophore receptor  37.06 
 
 
696 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122487  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5560  TonB-dependent receptor  36.16 
 
 
739 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  36.39 
 
 
690 aa  416  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  35.67 
 
 
720 aa  412  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3209  TonB-dependent siderophore receptor family protein  36.68 
 
 
820 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2036  TonB-dependent siderophore receptor family protein  36.68 
 
 
756 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3193  Outer membrane receptor protein, mostly Fe transport  36.53 
 
 
756 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0877  TonB-dependent siderophore receptor  36.68 
 
 
756 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0596191  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0831  TonB-dependent receptor plug  36.81 
 
 
721 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.519524  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3154  TonB-dependent siderophore receptor  36.53 
 
 
756 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1899  TonB-dependent siderophore receptor  36.68 
 
 
756 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2711  TonB-dependent siderophore receptor  36.68 
 
 
756 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192964  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0859  TonB-dependent siderophore receptor  35.83 
 
 
727 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00225734 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1412  TonB-dependent siderophore receptor family protein  35.07 
 
 
822 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  32.75 
 
 
749 aa  325  1e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  32.36 
 
 
716 aa  319  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.977961 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2318  TonB-dependent siderophore receptor  32.85 
 
 
779 aa  313  5.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375964  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  31.16 
 
 
710 aa  310  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3002  TonB-dependent siderophore receptor  31.86 
 
 
717 aa  308  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3330  TonB-dependent siderophore receptor  30.95 
 
 
728 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.417694  normal  0.580446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2412  TonB-dependent siderophore receptor  31.09 
 
 
717 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  31.69 
 
 
730 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  31.3 
 
 
730 aa  293  8e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1297  TonB-dependent siderophore receptor  31.56 
 
 
721 aa  289  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2853  TonB-dependent receptor, putative  31.05 
 
 
784 aa  280  8e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0123555  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3657  TonB-dependent receptor  31.01 
 
 
735 aa  278  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.558128  normal  0.251953 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4740  TonB-dependent siderophore receptor  31.08 
 
 
726 aa  269  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58513  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1526  TonB-dependent siderophore receptor  30.85 
 
 
724 aa  266  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.970314  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3326  TonB-dependent receptor, plug  29.21 
 
 
737 aa  244  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.686308  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3462  hypothetical protein  28.61 
 
 
797 aa  227  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.385249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3362  tonB-dependent receptor family protein  28.34 
 
 
813 aa  219  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0573796  normal  0.429192 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00020  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.4 
 
 
601 aa  214  4.9999999999999996e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000882452  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  24.41 
 
 
770 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  24.96 
 
 
710 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  24.41 
 
 
710 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  26.51 
 
 
689 aa  177  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3716  TonB-dependent receptor, plug  31.36 
 
 
527 aa  177  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0878035  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  26.19 
 
 
776 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  25.62 
 
 
700 aa  172  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  25.8 
 
 
689 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  25.47 
 
 
792 aa  167  9e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  25.17 
 
 
707 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  25.44 
 
 
795 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  26.1 
 
 
706 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2952  TonB-dependent receptor  32.27 
 
 
399 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  26.1 
 
 
706 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  26.13 
 
 
698 aa  164  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  26.11 
 
 
825 aa  160  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  26.11 
 
 
825 aa  160  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2391  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 
762 aa  160  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  26.27 
 
 
719 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  24.41 
 
 
695 aa  157  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.44 
 
 
706 aa  156  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  25.33 
 
 
711 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  25.74 
 
 
751 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  24.39 
 
 
718 aa  155  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  23.86 
 
 
708 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  26.7 
 
 
705 aa  154  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3953  TonB-dependent siderophore receptor  23.74 
 
 
701 aa  152  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000731032  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4042  TonB-dependent siderophore receptor  24.12 
 
 
697 aa  151  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.296308  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  24.72 
 
 
753 aa  150  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  24.79 
 
 
701 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  25.83 
 
 
742 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  25.83 
 
 
742 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  25.75 
 
 
712 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  22.8 
 
 
709 aa  148  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  24.93 
 
 
701 aa  148  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  22.8 
 
 
757 aa  148  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4504  TonB-dependent siderophore receptor  24.68 
 
 
703 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000141313  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4307  TonB-dependent siderophore receptor  24.66 
 
 
706 aa  146  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000234699  hitchhiker  0.000000000225287 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  24.82 
 
 
755 aa  145  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  24.29 
 
 
732 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>