More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0063 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  100 
 
 
448 aa  922    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  47.72 
 
 
457 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  45.31 
 
 
438 aa  389  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  41.08 
 
 
479 aa  330  2e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  39.95 
 
 
441 aa  328  9e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  45.61 
 
 
447 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  45.33 
 
 
468 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  46.41 
 
 
517 aa  322  6e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  38.5 
 
 
464 aa  315  9e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  44.44 
 
 
503 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  43.8 
 
 
475 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  43.58 
 
 
475 aa  311  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  43.8 
 
 
473 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  43.8 
 
 
473 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  42.98 
 
 
472 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  45.35 
 
 
490 aa  309  8e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  42.65 
 
 
465 aa  307  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  43.06 
 
 
474 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  42.66 
 
 
475 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  40.85 
 
 
457 aa  303  5.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  37.31 
 
 
464 aa  302  8.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  39.47 
 
 
477 aa  298  1e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  45.08 
 
 
453 aa  298  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  40.19 
 
 
462 aa  298  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  38.93 
 
 
477 aa  295  9e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  42.01 
 
 
465 aa  295  9e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  40.42 
 
 
454 aa  293  4e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  40.42 
 
 
454 aa  293  4e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  41.03 
 
 
464 aa  288  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  37.86 
 
 
460 aa  285  8e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  40 
 
 
464 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  37.59 
 
 
741 aa  284  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  37.88 
 
 
470 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  38.95 
 
 
490 aa  280  4e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  40.21 
 
 
446 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  40.28 
 
 
480 aa  278  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  39.73 
 
 
513 aa  277  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  39.82 
 
 
459 aa  268  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  39.24 
 
 
475 aa  267  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  40.48 
 
 
491 aa  265  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  37.6 
 
 
475 aa  264  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  38.46 
 
 
498 aa  264  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  37.8 
 
 
471 aa  260  4e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  38.7 
 
 
470 aa  259  6e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  39.38 
 
 
491 aa  259  9e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  37.53 
 
 
471 aa  258  1e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  36.49 
 
 
439 aa  256  7e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  38.02 
 
 
472 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  38.56 
 
 
470 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  38.76 
 
 
503 aa  253  5.000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  37.53 
 
 
462 aa  253  7e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  37.64 
 
 
491 aa  250  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  36.83 
 
 
468 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  36.83 
 
 
468 aa  249  8e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  36.83 
 
 
468 aa  249  9e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  38.02 
 
 
460 aa  249  9e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  41.38 
 
 
465 aa  249  9e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  38.29 
 
 
472 aa  248  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  37.92 
 
 
441 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  41.25 
 
 
441 aa  248  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  37.09 
 
 
466 aa  247  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  36.56 
 
 
468 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  37.09 
 
 
466 aa  247  4e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  36.81 
 
 
482 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0270  M23 peptidase domain-containing protein  34.2 
 
 
423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00486213  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  35.7 
 
 
512 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  37.07 
 
 
468 aa  244  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1920  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  34.49 
 
 
452 aa  242  7.999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0283385  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.81 
 
 
441 aa  239  8e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  38.51 
 
 
430 aa  237  4e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  34.73 
 
 
433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  39.67 
 
 
417 aa  233  6e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  33.69 
 
 
429 aa  228  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  35.2 
 
 
437 aa  224  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  35.19 
 
 
353 aa  224  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  42.41 
 
 
523 aa  224  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  33.33 
 
 
436 aa  221  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  34.57 
 
 
439 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  35.33 
 
 
435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  36.81 
 
 
533 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  35.46 
 
 
440 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  35.46 
 
 
440 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  34.28 
 
 
437 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  36.45 
 
 
429 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0732  peptidase M23B  33.43 
 
 
406 aa  193  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  36.39 
 
 
464 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  40.76 
 
 
385 aa  191  2e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  31.13 
 
 
490 aa  187  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  32.21 
 
 
460 aa  187  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  31.51 
 
 
453 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  34.24 
 
 
429 aa  183  4.0000000000000006e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02615  peptidase, M23/M37 family protein  32.79 
 
 
417 aa  183  7e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  38.4 
 
 
569 aa  182  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1433  peptidase M23B  35.86 
 
 
380 aa  182  8.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.484783  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  42.04 
 
 
665 aa  181  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  41.59 
 
 
695 aa  181  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  30.46 
 
 
457 aa  180  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  39.08 
 
 
687 aa  180  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  36.76 
 
 
680 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  41.44 
 
 
695 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0353482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>