More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0020 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0020  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
330 aa  677    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0678  transcriptional regulator, LysR family  52.77 
 
 
309 aa  322  6e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0725  LysR family transcriptional regulator  53.09 
 
 
319 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0693  LysR family transcriptional regulator  53.09 
 
 
319 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0589363  normal  0.107501 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3813  LysR family transcriptional regulator  53.09 
 
 
319 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0241  LysR family transcriptional regulator  53.09 
 
 
319 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0594299  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0640  LysR family transcriptional regulator  53.42 
 
 
319 aa  316  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2661  LysR family transcriptional regulator  53.09 
 
 
319 aa  316  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.230449 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0615  LysR family transcriptional regulator  53.42 
 
 
319 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1281  oxidative stress regulatory protein OxyR  52.77 
 
 
319 aa  315  7e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2522  LysR family transcriptional regulator  51.6 
 
 
319 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0196222  normal  0.718346 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0307  oxidative stress regulatory protein OxyR  52.44 
 
 
319 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1168  oxidative stress regulatory protein OxyR  52.44 
 
 
319 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2390  oxidative stress regulatory protein OxyR  52.44 
 
 
319 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2576  oxidative stress regulatory protein OxyR  52.44 
 
 
319 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2340  transcriptional regulator, LysR family  51.14 
 
 
313 aa  311  9e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0639  LysR family transcriptional regulator  53.56 
 
 
319 aa  311  1e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3987  LysR family transcriptional regulator  51.28 
 
 
319 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3358  oxidative stress regulatory protein OxyR  52.12 
 
 
319 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3367  oxidative stress regulatory protein  52.12 
 
 
319 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0672559  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3324  oxidative stress regulatory protein OxyR  52.12 
 
 
319 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519513  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4389  LysR family transcriptional regulator  52.38 
 
 
301 aa  307  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3244  LysR family transcriptional regulator  51.48 
 
 
306 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0711  transcriptional regulator, LysR family  51.82 
 
 
319 aa  306  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0103  transcriptional regulator, LysR family  53.42 
 
 
318 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2941  LysR family transcriptional regulator  51.66 
 
 
318 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0694604  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2805  LysR family transcriptional regulator  50.16 
 
 
316 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0202  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  51.19 
 
 
307 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0164  LysR family transcriptional regulator  50.85 
 
 
308 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.474897  normal  0.112541 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5357  LysR family transcriptional regulator  50.85 
 
 
308 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.164156  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5309  LysR family transcriptional regulator  50.85 
 
 
308 aa  301  9e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0066  oxidative stress regulatory protein OxyR, putative  51.19 
 
 
307 aa  301  9e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5218  LysR family transcriptional regulator  50.85 
 
 
308 aa  301  9e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48440  Transcriptional regulator, LysR family protein  50.66 
 
 
311 aa  301  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0556278  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3739  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 
307 aa  300  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.717698  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1615  LysR family transcriptional regulator  50.97 
 
 
311 aa  299  5e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0196883 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2542  transcriptional regulator, LysR family  49.67 
 
 
315 aa  295  7e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.42186  normal  0.238303 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2690  hydrogen peroxide-inducible genes activator transcription regulator protein  49.84 
 
 
317 aa  294  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.211159 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3718  LysR family transcriptional regulator  51.18 
 
 
308 aa  294  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2953  transcriptional regulator, LysR family  49.35 
 
 
315 aa  291  7e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152689  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6121  putative transcriptional regulator  51.36 
 
 
310 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70560  LysR family transcriptional regulator  51.36 
 
 
310 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5558  LysR family transcriptional regulator  50.85 
 
 
309 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4396  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 
309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.20014 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5066  transcriptional regulator, LysR family  45.79 
 
 
321 aa  281  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3681  LysR family transcriptional regulator  45.43 
 
 
317 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0368  transcriptional regulator, LysR family  46.98 
 
 
321 aa  280  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.257927  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0377  LysR family transcriptional regulator  46.98 
 
 
321 aa  280  4e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34254  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0017  LysR family transcriptional regulator  44.88 
 
 
304 aa  279  5e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.163482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0594  LysR family transcriptional regulator  46.03 
 
 
321 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1013  LysR family transcriptional regulator  44.86 
 
 
321 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0736859  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0324  LysR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
318 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0489134 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0472  LysR family transcriptional regulator  44.62 
 
 
331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2339  transcriptional regulator, LysR family  48.38 
 
 
308 aa  262  6e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.111299  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2334  LysR family transcriptional regulator  44.62 
 
 
322 aa  261  8.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.618914 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0054  LysR family transcriptional regulator  43.71 
 
 
304 aa  258  1e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2958  LysR family transcriptional regulator  44.71 
 
 
324 aa  248  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2381  LysR family transcriptional regulator  41.37 
 
 
308 aa  228  7e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128975  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2782  LysR family transcriptional regulator  42.5 
 
 
301 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427064  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2886  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 
301 aa  209  7e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03200  transcriptional regulator  39.13 
 
 
300 aa  207  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4079  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  39.31 
 
 
305 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0119  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  39.31 
 
 
305 aa  206  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.985596  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0138  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  39.31 
 
 
305 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2323  oxidative stress transcriptional regulator  40 
 
 
301 aa  206  7e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.523521  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2714  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  38.83 
 
 
302 aa  205  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4222  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79182  normal  0.12833 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03846  DNA-binding transcriptional dual regulator  38.49 
 
 
305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.782076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4025  transcriptional regulator, LysR family  38.49 
 
 
305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4335  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  38.14 
 
 
305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.916411 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4409  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  38.49 
 
 
305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.386018  normal  0.0576457 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4453  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  38.14 
 
 
305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.730139  hitchhiker  0.0000741656 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4456  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  38.14 
 
 
305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000210908 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4055  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  38.49 
 
 
305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03795  hypothetical protein  38.49 
 
 
305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5423  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  38.49 
 
 
305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.748146 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4366  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  38.14 
 
 
305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0520  hydrogen peroxide-inducible genes activator  39.52 
 
 
311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.454545  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4530  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  38.14 
 
 
305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  hitchhiker  0.00000332798 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4195  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  38.49 
 
 
305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4503  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  38.49 
 
 
305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.030834  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4448  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  38.49 
 
 
305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0187  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  38.91 
 
 
302 aa  200  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1654  hydrogen peroxide-inducible genes activator  39.52 
 
 
311 aa  200  3e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00724333  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4775  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  38.28 
 
 
305 aa  200  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760624  hitchhiker  0.00336049 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4025  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  38.14 
 
 
305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0193  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  38.91 
 
 
302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1778  hydrogen peroxide-inducible genes activator  36.21 
 
 
296 aa  199  6e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0127  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  38.91 
 
 
305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.985261  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1779  hydrogen peroxide-inducible genes activator  35.86 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2291  LysR family transcriptional regulator  41.49 
 
 
320 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11333  normal  0.519031 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2425  LysR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
308 aa  195  7e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.540189  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0871  oxidative stress transcriptional regulator  43.17 
 
 
311 aa  193  3e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000180312  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0783  LysR family transcriptional regulator  43.17 
 
 
311 aa  193  3e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33611  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2213  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  37.24 
 
 
297 aa  193  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3788  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  37.24 
 
 
302 aa  192  6e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4718  hydrogen peroxide-inducible genes activator  35.17 
 
 
299 aa  191  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0687  transcriptional regulator, LysR family  40.65 
 
 
320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.366193 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0036  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  36.36 
 
 
304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002320  Transcriptional regulator, LysR family  37.82 
 
 
303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.726256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>