105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0010 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0010  transport-associated  100 
 
 
101 aa  189  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2076  transport-associated protein  46.53 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.585071  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0477  transport-associated  44.12 
 
 
103 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1796  transport-associated  45.95 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1805  transport-associated protein  47.56 
 
 
106 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0875  transport-associated  50 
 
 
104 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.647487  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1788  transport-associated  40.82 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663263  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3867  transport-associated  46.34 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0916  transport-associated  53.73 
 
 
104 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  37.23 
 
 
104 aa  58.9  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  37.23 
 
 
104 aa  58.9  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  37.23 
 
 
104 aa  58.9  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2837  transport-associated  43.01 
 
 
104 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.47962  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3514  transport-associated  41.94 
 
 
104 aa  57  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  36.97 
 
 
199 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  44.83 
 
 
192 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  44 
 
 
205 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  44 
 
 
205 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  44 
 
 
205 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  44 
 
 
205 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  44 
 
 
205 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2251  transport-associated  50.75 
 
 
103 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  36.56 
 
 
103 aa  55.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2673  transport-associated  43.75 
 
 
104 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  45.45 
 
 
276 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  46.38 
 
 
202 aa  54.3  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  40.54 
 
 
204 aa  54.3  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2407  transport-associated protein  41.24 
 
 
104 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00333473  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  46.15 
 
 
104 aa  53.5  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  42.86 
 
 
201 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  42.86 
 
 
201 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2549  hypothetical protein  50 
 
 
113 aa  52.8  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62690  hypothetical protein  47.83 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  47.83 
 
 
202 aa  52.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5456  hypothetical protein  47.83 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  42.86 
 
 
201 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  42.86 
 
 
201 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  42.86 
 
 
201 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  42.86 
 
 
201 aa  52.8  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  42.86 
 
 
201 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4004  transport-associated  41.33 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38345  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  43.84 
 
 
204 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  43.84 
 
 
204 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  43.84 
 
 
204 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2542  transport-associated protein  43.24 
 
 
105 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000702242 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  41.67 
 
 
201 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1671  transport-associated  43.24 
 
 
105 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  40.79 
 
 
205 aa  51.2  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3156  phospholipid-binding domain-containing protein  44.59 
 
 
246 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3027  phospholipid-binding domain-containing protein  41.77 
 
 
184 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119447  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1376  osmotically inducible protein Y  44.59 
 
 
174 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  41.56 
 
 
201 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0063  transport-associated  35.85 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37402  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5244  transport-associated  35.92 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.797989  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3412  transport-associated  38.54 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43670  Transport-associated protein  45.45 
 
 
120 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.226738  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4236  transport-associated protein  29.79 
 
 
175 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  44.78 
 
 
171 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  44.78 
 
 
171 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2909  putative lipoprotein  47.83 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434819  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2175  osmotically inducible periplasmic protein  44.29 
 
 
166 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17152  normal  0.224433 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3603  transport-associated  43.06 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.335448  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1372  transport-associated  39.44 
 
 
136 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6457  transport-associated  39.44 
 
 
136 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591912  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0726  transport-associated  46.58 
 
 
117 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.724439  normal  0.0177667 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4707  transport-associated protein  43.9 
 
 
116 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0425  hypothetical protein  34.44 
 
 
183 aa  47  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2343  transport-associated  36.9 
 
 
104 aa  47.4  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259537  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4572  transport-associated  43.9 
 
 
116 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.414411  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1501  transport-associated protein  33 
 
 
104 aa  47  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0449  hypothetical protein  34.44 
 
 
183 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3436  transport-associated  46.05 
 
 
127 aa  47  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.865751  normal  0.0604848 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2274  transport-associated  42.19 
 
 
150 aa  45.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.431584  normal  0.766565 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5303  transport-associated  39.74 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320232  normal  0.0505821 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1600  transport-associated  42.19 
 
 
150 aa  45.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  38.81 
 
 
279 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04303  putative phospholipid-binding domain family  43.75 
 
 
120 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  40.3 
 
 
202 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  37.31 
 
 
279 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1119  transport-associated  44.44 
 
 
104 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.777172 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5639  transport-associated  35.71 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6387  transport-associated  35.71 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.508762 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5083  transport-associated protein  37.33 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  39.06 
 
 
275 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4288  transport-associated  39.06 
 
 
138 aa  42.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4398  transport-associated  39.06 
 
 
138 aa  42.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  41.27 
 
 
218 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  37.5 
 
 
278 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2682  transport-associated protein  38.64 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2206  transport-associated protein  44.26 
 
 
195 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0874  transport-associated  38.57 
 
 
163 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1170  phospholipid binding protein  39.73 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.191898 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  38.36 
 
 
275 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4244  transport-associated protein  26.83 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5436  transport-associated  39.73 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.627744 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2170  transport-associated  41.79 
 
 
104 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.395466  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4484  hypothetical protein  50 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4818  transport-associated protein  45.45 
 
 
118 aa  41.2  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.958315  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3022  transport-associated  37.68 
 
 
158 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  0.200341 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13110  hypothetical protein  34 
 
 
161 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>