More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl642 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl642  ribokinase  100 
 
 		 308 aa  615  1e-175  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  36.76 
 
 		 345 aa  216  5e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  41.23 
 
 		 309 aa  215  9e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  39.07 
 
 		 310 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  40.91 
 
 		 304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  40.86 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  38.28 
 
 		 308 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  38.44 
 
 		 308 aa  210  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  37.62 
 
 		 308 aa  209  5e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  38.36 
 
 		 318 aa  209  5e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  38.24 
 
 		 308 aa  208  8e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  37.38 
 
 		 308 aa  208  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  37.38 
 
 		 308 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  37.38 
 
 		 308 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  37.17 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  37.79 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  35.64 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  34.97 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  36.18 
 
 		 307 aa  202  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  37.7 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  39.48 
 
 		 310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  35.76 
 
 		 308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  37.79 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  37.5 
 
 		 305 aa  199  7e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  38.54 
 
 		 305 aa  198  9e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  39.55 
 
 		 310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  36.21 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  37.79 
 
 		 312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  36.09 
 
 		 306 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  33 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  35.88 
 
 		 309 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  37.86 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  37.21 
 
 		 314 aa  192  6e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  36.39 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  36.39 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  36.39 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  35.12 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  36.39 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  35.55 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  37.5 
 
 		 295 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  35.42 
 
 		 317 aa  191  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  37.29 
 
 		 298 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  35.79 
 
 		 302 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  36.3 
 
 		 298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  36.39 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04400  sugar kinase, ribokinase  36.21 
 
 		 305 aa  189  4e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.736771 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  35.83 
 
 		 306 aa  189  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  37.29 
 
 		 298 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  36.07 
 
 		 309 aa  188  8e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  36.07 
 
 		 309 aa  188  8e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  36.07 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  35.74 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  38.57 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  35.74 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  35.74 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  35.74 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  36.09 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  34.95 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  35.74 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  33.78 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  35.55 
 
 		 340 aa  186  4e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  34.71 
 
 		 295 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1119  ribokinase  37.7 
 
 		 302 aa  186  6e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970785  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  36.3 
 
 		 298 aa  185  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  34.78 
 
 		 302 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  33.78 
 
 		 308 aa  185  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1818  ribokinase-like domain-containing protein  38.31 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.72818  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  36.3 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  35.22 
 
 		 311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0696  ribokinase  37.62 
 
 		 304 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  35.22 
 
 		 311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  36.3 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  35.41 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  35.97 
 
 		 298 aa  183  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  35.22 
 
 		 311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  35.97 
 
 		 298 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  35.97 
 
 		 298 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  38.13 
 
 		 290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  35.95 
 
 		 307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  36.18 
 
 		 298 aa  182  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  35.97 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  34.75 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2471  ribokinase  36.86 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  34.75 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  34.75 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  34.75 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  34.75 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  36.77 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  34.11 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  36.09 
 
 		 306 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  34.75 
 
 		 303 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  34.87 
 
 		 305 aa  178  9e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  35.43 
 
 		 308 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  33.77 
 
 		 309 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  33.99 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  34.47 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  33.33 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  36.58 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  35.41 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  34.98 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>