More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl634 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl634  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 363 aa  740    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0144  peptide chain release factor 1  81.54 
 
 		 363 aa  620  1e-176  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372762  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  54.8 
 
 		 362 aa  412  1e-114  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  52.99 
 
 		 362 aa  402  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  55.87 
 
 		 355 aa  403  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  55.87 
 
 		 358 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  55.87 
 
 		 358 aa  403  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  55.87 
 
 		 358 aa  403  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  56.16 
 
 		 358 aa  404  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  55.87 
 
 		 355 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  55.87 
 
 		 358 aa  403  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  55.59 
 
 		 358 aa  404  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  55.87 
 
 		 358 aa  403  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0003  peptide chain release factor 1  56.57 
 
 		 359 aa  400  9.999999999999999e-111  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  55.87 
 
 		 355 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  55.3 
 
 		 355 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  54.57 
 
 		 358 aa  388  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  54.24 
 
 		 358 aa  386  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  54.24 
 
 		 358 aa  386  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  53.89 
 
 		 357 aa  382  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1077  peptide chain release factor 1  53.54 
 
 		 359 aa  382  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  53.85 
 
 		 358 aa  378  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0615  peptide chain release factor 1  53.94 
 
 		 358 aa  377  1e-103  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  51.86 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  51.71 
 
 		 359 aa  378  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  52.12 
 
 		 356 aa  378  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  53.07 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0793  peptide chain release factor 1  53.12 
 
 		 359 aa  376  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.510985  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  53.16 
 
 		 357 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 367 aa  373  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  52.56 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  52.91 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  53.14 
 
 		 360 aa  368  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  53.14 
 
 		 360 aa  368  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  52.03 
 
 		 363 aa  365  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  49.15 
 
 		 356 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1784  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 356 aa  368  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 359 aa  364  1e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  52.75 
 
 		 360 aa  363  2e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3435  peptide chain release factor 1  53.85 
 
 		 358 aa  363  3e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 357 aa  362  4e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0610  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 357 aa  362  5.0000000000000005e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0746132  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  48.88 
 
 		 356 aa  361  1e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  51.61 
 
 		 361 aa  360  2e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  47.66 
 
 		 360 aa  359  4e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  49.13 
 
 		 360 aa  358  7e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  49.44 
 
 		 362 aa  358  8e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 360 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0440  peptide chain release factor 1  51.44 
 
 		 354 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  53.27 
 
 		 359 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  52.03 
 
 		 363 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  51.42 
 
 		 361 aa  356  3.9999999999999996e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  49.43 
 
 		 359 aa  355  5e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4995  peptide chain release factor 1  51.04 
 
 		 357 aa  355  5.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  0.116267 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01250  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 362 aa  355  6.999999999999999e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  52.98 
 
 		 359 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  49.28 
 
 		 360 aa  354  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  49.43 
 
 		 363 aa  355  1e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  51.4 
 
 		 358 aa  353  2e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  49.43 
 
 		 357 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0196  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 357 aa  353  2.9999999999999997e-96  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.284546  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  49.15 
 
 		 361 aa  352  4e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  49.14 
 
 		 362 aa  352  5e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2309  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 358 aa  352  7e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.321803  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1856  peptide chain release factor 1  48.32 
 
 		 361 aa  352  7e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227654  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  49.03 
 
 		 360 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  49.03 
 
 		 360 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  49.03 
 
 		 360 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  48.71 
 
 		 356 aa  350  2e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  48.75 
 
 		 360 aa  350  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf295  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 		 355 aa  350  2e-95  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.410445  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  48.31 
 
 		 357 aa  350  2e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 361 aa  349  3e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  48.75 
 
 		 360 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  48.75 
 
 		 360 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  48.75 
 
 		 360 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 361 aa  349  3e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  48.75 
 
 		 360 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2912  peptide chain release factor 1  49.13 
 
 		 361 aa  349  4e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107492  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  49.29 
 
 		 360 aa  349  5e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  46.01 
 
 		 360 aa  349  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3599  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 		 362 aa  349  5e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1784  peptide chain release factor 1  48.72 
 
 		 355 aa  348  6e-95  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.404701  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  48.19 
 
 		 360 aa  348  6e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1582  peptide chain release factor 1  48.17 
 
 		 357 aa  348  9e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1990  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 361 aa  348  1e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00333479  decreased coverage  0.0018191 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  48.15 
 
 		 358 aa  348  1e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0790  peptide chain release factor 1  48.17 
 
 		 362 aa  347  1e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.224449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  50.29 
 
 		 358 aa  347  1e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  47.88 
 
 		 356 aa  347  2e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  48.44 
 
 		 355 aa  347  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2449  peptide chain release factor 1  51.84 
 
 		 359 aa  346  3e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3737  peptide chain release factor 1  49.16 
 
 		 363 aa  346  4e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  48.71 
 
 		 360 aa  346  4e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1599  peptide chain release factor 1  48.43 
 
 		 355 aa  346  4e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  48.71 
 
 		 360 aa  346  4e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2436  peptide chain release factor 1  48.47 
 
 		 360 aa  345  5e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000671796  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1931  peptide chain release factor 1  48.47 
 
 		 360 aa  345  5e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000608431  normal  0.0690317 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01196  hypothetical protein  48.47 
 
 		 360 aa  345  5e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.26987  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1359  peptide chain release factor 1  48.47 
 
 		 360 aa  345  5e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000344623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>