More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl538 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl538  GTPase  100 
 
 
315 aa  635  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  6.07031e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0543  GTPase family protein  60.76 
 
 
316 aa  391  1e-107  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2490  ribosomal biogenesis GTPase  35.05 
 
 
287 aa  194  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  1.01626e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3689  ribosomal biogenesis GTPase  34.11 
 
 
296 aa  192  8e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0162209  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3661  ribosomal biogenesis GTPase  33.22 
 
 
296 aa  192  8e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000313796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3976  ribosomal biogenesis GTPase  34.11 
 
 
296 aa  192  8e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.27206e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1307  ribosomal biogenesis GTPase  33.55 
 
 
296 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  6.15833e-08  unclonable  1.55704e-25 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2401  GTP-binding protein HSR1-related  34.98 
 
 
292 aa  191  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00457359  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1988  ribosomal biogenesis GTPase  34.98 
 
 
288 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3597  ribosomal biogenesis GTPase  34.11 
 
 
296 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3851  ribosomal biogenesis GTPase  34.11 
 
 
296 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3579  ribosomal biogenesis GTPase  34.11 
 
 
296 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.71121e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3880  ribosomal biogenesis GTPase  33.78 
 
 
296 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  5.79568e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1095  ribosomal biogenesis GTPase  34.84 
 
 
283 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00065113  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3885  ribosomal biogenesis GTPase  33.78 
 
 
296 aa  190  3e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  5.21697e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3936  ribosomal biogenesis GTPase  33.22 
 
 
296 aa  190  3e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000467955  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  33.1 
 
 
291 aa  182  5e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  2.21052e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0776  GTP-binding protein YlqF  33.8 
 
 
290 aa  182  9e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.119569  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1416  ribosomal biogenesis GTPase  33.7 
 
 
283 aa  180  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00443588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0716  GTP1/OBG protein  33.1 
 
 
292 aa  180  3e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00781144  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1367  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  31.25 
 
 
292 aa  180  3e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0973  GTP-binding protein HSR1-related protein  34.39 
 
 
282 aa  177  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.5477e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1679  ribosomal biogenesis GTPase  35.89 
 
 
281 aa  174  1e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.607688  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1961  ribosomal biogenesis GTPase  35.31 
 
 
281 aa  174  2e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.648804  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1703  ribosomal biogenesis GTPase  34.28 
 
 
310 aa  174  2e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2508  ribosomal biogenesis GTPase  36.21 
 
 
312 aa  173  3e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0913  GTPase  32.75 
 
 
279 aa  173  4e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0663  GTP-binding protein, HSR1-related  31.01 
 
 
284 aa  172  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.011457  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0773  GTPases  31.51 
 
 
280 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.79834e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0919  ribosomal biogenesis GTPase  33.33 
 
 
284 aa  170  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.294572  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2186  ribosomal biogenesis GTPase  35.79 
 
 
313 aa  169  6e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1013  ribosomal biogenesis GTPase  32.29 
 
 
283 aa  169  6e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.132908  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2263  ribosomal biogenesis GTPase  35.79 
 
 
313 aa  169  6e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2306  ribosomal biogenesis GTPase  33.88 
 
 
313 aa  169  8e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.575224  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2638  ribosomal biogenesis GTPase  35.31 
 
 
312 aa  169  8e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00454653  normal  0.052608 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2395  ribosomal biogenesis GTPase  35.79 
 
 
313 aa  169  8e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2029  ribosomal biogenesis GTPase  35.31 
 
 
312 aa  168  9e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.831437  normal  0.492608 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1293  GTP-binding protein HSR1-related  33.33 
 
 
280 aa  168  9e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  2.7879e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000287  50S ribosomal subunit maturation GTPase RbgA  33.45 
 
 
314 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.146408  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1486  ribosomal biogenesis GTPase  34.45 
 
 
313 aa  168  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2437  ribosomal biogenesis GTPase  33.33 
 
 
313 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743849  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1327  ribosomal biogenesis GTPase  34.14 
 
 
294 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.575844  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2048  GTP-binding protein, HSR1-related  37.12 
 
 
284 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  3.91161e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2283  ribosomal biogenesis GTPase  33.44 
 
 
318 aa  167  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0251974 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0705  GTP-binding protein HSR1-related protein  38.28 
 
 
298 aa  167  2e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1302  ribosomal biogenesis GTPase  34.14 
 
 
294 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00764479  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1889  ribosomal biogenesis GTPase  33.02 
 
 
313 aa  167  3e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1855  ribosomal biogenesis GTPase  33.02 
 
 
313 aa  167  3e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1882  ribosomal biogenesis GTPase  33.02 
 
 
313 aa  167  3e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140157  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06087  ribosomal biogenesis GTPase  31.74 
 
 
314 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2590  ribosomal biogenesis GTPase  35.09 
 
 
313 aa  166  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0169  ribosomal biogenesis GTPase  34.59 
 
 
323 aa  165  1e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  3.16145e-07  normal  0.720532 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1203  GTP-binding protein HSR1-related  38.33 
 
 
283 aa  165  1e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.39155e-09  normal  0.179888 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07360  GTP-binding protein HSR1-related  33.1 
 
 
282 aa  164  2e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7476e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0811  ribosomal biogenesis GTPase  32.76 
 
 
287 aa  164  2e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00749287  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1752  ribosomal biogenesis GTPase  34.39 
 
 
313 aa  164  2e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1982  ribosomal biogenesis GTPase  32.08 
 
 
318 aa  164  2e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0461  ribosomal biogenesis GTPase  32.43 
 
 
314 aa  163  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.178573  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2924  HSR1-related GTP-binding protein  33.69 
 
 
299 aa  163  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1409  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  29.23 
 
 
271 aa  163  4e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.421311  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2146  GTP-binding protein, HSR1-related  31.65 
 
 
305 aa  162  5e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3634  ribosomal biogenesis GTPase  34.51 
 
 
334 aa  162  5e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.909228  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1707  GTP-binding protein, HSR1-related  34.28 
 
 
277 aa  162  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.12169  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1301  GTP-binding protein HSR1-related  33.33 
 
 
299 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.33299e-15 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1490  GTP-binding protein  30.99 
 
 
278 aa  161  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  6.59617e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1589  ribosomal biogenesis GTPase  32.79 
 
 
313 aa  162  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1054  ribosomal biogenesis GTPase  31.89 
 
 
315 aa  160  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0186  GTP-binding protein HSR1-related protein  34.15 
 
 
285 aa  159  5e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2377  ribosomal biogenesis GTPase  32.03 
 
 
307 aa  158  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1993  ribosomal biogenesis GTPase  33.33 
 
 
314 aa  158  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0543739  normal  0.136959 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2487  GTP-binding protein HSR1-related  31.91 
 
 
328 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.10563e-10 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1350  GTP-binding protein HSR1-related  32.65 
 
 
319 aa  157  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0587703  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0764  GTP-binding protein YlqF  33.62 
 
 
284 aa  157  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1554  GTP-binding protein  33.68 
 
 
281 aa  156  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2510  GTP-binding protein, HSR1-related  32.65 
 
 
319 aa  156  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  0.0153931 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3753  GTP1/OBG protein  32.98 
 
 
276 aa  155  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.36118e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1349  GTP-binding  30.25 
 
 
319 aa  155  8e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00974199  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1604  GTP-binding protein, HSR1-related  32.16 
 
 
277 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  4.52633e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2758  GTP-binding protein, HSR1-related  33.33 
 
 
329 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0145905 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3396  GTP-binding  33.22 
 
 
330 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0663  ribosomal biogenesis GTPase  31.36 
 
 
279 aa  150  2e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.5554  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1204  GTP-binding  29.47 
 
 
305 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185511  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0843  GTP-binding protein HSR1-related  32.03 
 
 
271 aa  149  5e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1785  GTP-binding  29.27 
 
 
307 aa  149  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.417498 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2270  GTP-binding protein  30.64 
 
 
322 aa  149  7e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193404  hitchhiker  3.44964e-07 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0669  ribosomal biogenesis GTPase  28.76 
 
 
311 aa  149  8e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.378944  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2453  ribosomal biogenesis GTPase  35.96 
 
 
312 aa  148  9e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.643671  normal  0.265294 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2474  GTP-binding protein HSR1-related  30.39 
 
 
317 aa  148  1e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal  0.279197 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1388  GTP-binding  32.39 
 
 
316 aa  146  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4128  ribosomal biogenesis GTPase  31.28 
 
 
281 aa  145  7e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0973  GTP-binding protein YlqF  27.9 
 
 
270 aa  143  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000216329  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1586  ribosomal biogenesis GTPase  30.17 
 
 
281 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0128264 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1018  GTPase  34.35 
 
 
282 aa  143  3e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.447609  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1227  GTP-binding protein HSR1-related  32.44 
 
 
279 aa  143  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.240539  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3629  GTP-binding protein HSR1-related  29.93 
 
 
320 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1114  ribosomal biogenesis GTPase  31.94 
 
 
287 aa  142  8e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.44359  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4089  ribosomal biogenesis GTPase  31.58 
 
 
281 aa  141  1e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1312  GTP-binding protein, HSR1-related  33.22 
 
 
319 aa  141  2e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02636  ribosomal biogenesis GTPase  33.09 
 
 
323 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02701  ribosomal biogenesis GTPase  33.91 
 
 
287 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0776649  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>