289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl478 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl478  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  310  4e-84  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0548  hypothetical protein  58.06 
 
 
155 aa  172  1e-42  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  38.51 
 
 
159 aa  119  2e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  38.51 
 
 
159 aa  119  2e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  37.89 
 
 
159 aa  115  2e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  37.65 
 
 
159 aa  114  5e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  36.65 
 
 
159 aa  114  7e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  36.65 
 
 
159 aa  114  7e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  36.65 
 
 
159 aa  114  7e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  36.65 
 
 
159 aa  114  7e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  36.65 
 
 
159 aa  114  7e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  36.65 
 
 
159 aa  113  9e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  37.2 
 
 
160 aa  113  1e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  37.27 
 
 
159 aa  112  2e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  36.02 
 
 
159 aa  112  2e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  36.02 
 
 
167 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  36.02 
 
 
167 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  36.02 
 
 
159 aa  110  6e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  2.24859e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  41.94 
 
 
154 aa  110  8e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  36.65 
 
 
177 aa  110  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  34.16 
 
 
159 aa  107  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.53536e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  34.16 
 
 
159 aa  105  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  34.16 
 
 
159 aa  105  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  2.87275e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  36.48 
 
 
159 aa  105  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  36.42 
 
 
159 aa  105  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.7339e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  37.27 
 
 
159 aa  104  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  31.17 
 
 
154 aa  104  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2916  protein of unknown function DUF163  28.93 
 
 
159 aa  103  9e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  36.54 
 
 
156 aa  102  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.14035e-07 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  35.22 
 
 
159 aa  100  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  36.2 
 
 
159 aa  100  6e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  30.52 
 
 
154 aa  100  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.55884e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  35.76 
 
 
159 aa  100  8e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  7.42092e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  32.3 
 
 
159 aa  100  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  8.81248e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  34.16 
 
 
159 aa  99.8  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  7.43067e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  35.4 
 
 
159 aa  99.8  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  31.17 
 
 
153 aa  98.2  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.67091e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  35.4 
 
 
159 aa  97.4  6e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  34.16 
 
 
159 aa  96.7  9e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  32.72 
 
 
159 aa  97.1  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  28.57 
 
 
156 aa  96.7  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  1.42803e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  28.3 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  32.5 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  31.06 
 
 
160 aa  95.9  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.73176e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0377  rRNA large subunit methyltransferase  29.3 
 
 
155 aa  95.9  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2659  hypothetical protein  30.77 
 
 
157 aa  94.7  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0267321  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  33.12 
 
 
160 aa  94.4  5e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  29.22 
 
 
153 aa  94  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  35.67 
 
 
165 aa  93.2  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  32.91 
 
 
159 aa  91.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  32.92 
 
 
159 aa  91.7  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  31.06 
 
 
160 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2599  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  91.3  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2416  hypothetical protein  29.38 
 
 
160 aa  89.4  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0648918  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  29.68 
 
 
145 aa  89  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  27.85 
 
 
155 aa  89  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  8.61677e-08 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  32.72 
 
 
158 aa  87.4  6e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01660  hypothetical protein  30.13 
 
 
150 aa  87.4  6e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.134339  hitchhiker  7.74135e-12 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0406  hypothetical protein  23.9 
 
 
155 aa  87  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57756  normal  0.24642 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  28.57 
 
 
154 aa  87  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1662  hypothetical protein  30.13 
 
 
158 aa  86.3  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.399666  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  25.62 
 
 
153 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0024  hypothetical protein  28.03 
 
 
146 aa  86.3  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.820161  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1077  protein of unknown function DUF163  37.74 
 
 
154 aa  85.5  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0647  rRNA large subunit methyltransferase  26.54 
 
 
160 aa  85.9  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0130752 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  26.92 
 
 
156 aa  85.5  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.09351e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01881  rRNA large subunit methyltransferase  26.11 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0790169  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3612  hypothetical protein  27.27 
 
 
152 aa  84.3  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.47821e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  28.93 
 
 
157 aa  84.3  6e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  30.97 
 
 
153 aa  84  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  1.33759e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  28.22 
 
 
159 aa  84  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3799  rRNA large subunit methyltransferase  25.32 
 
 
155 aa  84  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3342  rRNA large subunit methyltransferase  30.77 
 
 
155 aa  83.6  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  1.27948e-07  normal  0.0166889 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  33.13 
 
 
157 aa  82.8  1e-15  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0613  rRNA large subunit methyltransferase  24.05 
 
 
155 aa  83.2  1e-15  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4861  rRNA large subunit methyltransferase  24.05 
 
 
155 aa  82.8  2e-15  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394825  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4808  rRNA large subunit methyltransferase  24.05 
 
 
155 aa  82.8  2e-15  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.24458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4683  rRNA large subunit methyltransferase  24.05 
 
 
155 aa  82.8  2e-15  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2139  hypothetical protein  26.11 
 
 
154 aa  82.4  2e-15  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.895316  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4277  rRNA large subunit methyltransferase  29.01 
 
 
160 aa  82.8  2e-15  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf790  hypothetical protein  32.26 
 
 
143 aa  82  3e-15  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  24.84 
 
 
156 aa  81.3  4e-15  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2061  rRNA large subunit methyltransferase  25.47 
 
 
160 aa  81.3  4e-15  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.895166  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  25.64 
 
 
153 aa  81.3  5e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0088  rRNA large subunit methyltransferase  27.85 
 
 
156 aa  80.9  5e-15  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0114414  normal  0.53865 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4366  rRNA large subunit methyltransferase  24.84 
 
 
155 aa  80.9  6e-15  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712545  normal  0.959916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4826  hypothetical protein  24.84 
 
 
155 aa  80.9  6e-15  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715352  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1807  rRNA large subunit methyltransferase  26.92 
 
 
157 aa  80.5  8e-15  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1884  rRNA large subunit methyltransferase  26.92 
 
 
157 aa  80.5  8e-15  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.616736  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0845  protein of unknown function DUF163  27.92 
 
 
155 aa  80.1  9e-15  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0190186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4971  rRNA large subunit methyltransferase  23.72 
 
 
155 aa  80.1  9e-15  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  31.06 
 
 
159 aa  80.1  1e-14  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  24.36 
 
 
153 aa  79.3  2e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1327  rRNA large subunit methyltransferase  29.45 
 
 
156 aa  79  2e-14  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  28.93 
 
 
159 aa  79.3  2e-14  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  24.36 
 
 
153 aa  79  2e-14  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1544  hypothetical protein  24.84 
 
 
155 aa  79  2e-14  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00441553  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1331  rRNA large subunit methyltransferase  29.45 
 
 
156 aa  79  2e-14  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0747  protein of unknown function DUF163  26.32 
 
 
157 aa  78.6  3e-14  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0433  rRNA large subunit methyltransferase  27.78 
 
 
166 aa  78.6  3e-14  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>