104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl471 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl471  nucleoside diphosphate (nudix) hydrolase  100 
 
 		 174 aa  350  4e-96  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00345431  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1536  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 		 331 aa  154  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0990  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 173 aa  147  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000363849  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0396  NUDIX hydrolase  42.77 
 
 		 171 aa  137  7e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000159718  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0674  NUDIX family hydrolase  30.28 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1742  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.445003  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1593  NUDIX hydrolase  28.22 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1205  hypothetical protein  25.66 
 
 		 182 aa  57  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418064 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_7007  predicted protein  30.3 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17300  ADP-ribose pyrophosphatase  28 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.197919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  25 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1548  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.35 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51389  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2914  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.35 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  29.13 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3117  NUDIX hydrolase  30.85 
 
 		 178 aa  52  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.129541  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0803  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  26.98 
 
 		 182 aa  52  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010723  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3270  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.89 
 
 		 181 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3207  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.89 
 
 		 181 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3195  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.89 
 
 		 181 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.376007  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3375  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.89 
 
 		 181 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.923272  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0626  MutT/nudix family protein  30.68 
 
 		 161 aa  51.2  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000112131  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0820  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  26.98 
 
 		 182 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3215  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  26.98 
 
 		 182 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3022  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  26.98 
 
 		 182 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4179  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  26.98 
 
 		 182 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02721  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  26.98 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2826  NUDIX hydrolase  25.83 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02684  hypothetical protein  26.98 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.406743  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3045  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  20.48 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3308  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  26.98 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  24.44 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3273  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.21 
 
 		 181 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  24.44 
 
 		 178 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3318  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 		 185 aa  47.8  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000044442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07000  NUDIX hydrolase  26.5 
 
 		 177 aa  47.8  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1553  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 		 182 aa  47.4  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0732  hydrolase, NUDIX family  28.67 
 
 		 163 aa  47.4  0.00009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265713 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3048  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  26.19 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2032  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  27.05 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2862  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  normal  0.0453514 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.91 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.189435  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13638  putative isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  24.68 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.279506  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2201  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.33 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43573  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4564  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  25.84 
 
 		 196 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.669276  hitchhiker  0.00145949 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2276  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  28.36 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00103129 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3123  NUDIX hydrolase  23.97 
 
 		 141 aa  45.8  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0687463 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4600  NUDIX hydrolase  27.83 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0447936 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5294  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  22.03 
 
 		 190 aa  45.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4731  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  26.19 
 
 		 171 aa  45.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.291133  decreased coverage  0.0000344266 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  30.12 
 
 		 177 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2550  hypothetical protein  28.69 
 
 		 203 aa  45.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal  0.669028 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0324  NUDIX hydrolase  25 
 
 		 134 aa  45.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0625  NUDIX hydrolase  24.29 
 
 		 185 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 177 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9366  Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  23.89 
 
 		 193 aa  44.7  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3307  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  23.81 
 
 		 183 aa  44.7  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 178 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3389  NUDIX hydrolase  21.66 
 
 		 181 aa  44.3  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1754  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  21.23 
 
 		 191 aa  44.3  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.202271  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  26.97 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1582  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.69 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196336  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1120  NUDIX hydrolase  29.23 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0313  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  23.03 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.814228 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  27.86 
 
 		 459 aa  43.9  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04480  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  25.45 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2431  NUDIX hydrolase  25.23 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00584965  normal  0.262781 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20640  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  22.89 
 
 		 213 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0969  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  20.62 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0417204 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4379  NUDIX hydrolase  22.96 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4299  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  28.95 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.651923  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2523  hydrolase, nudix family  25.62 
 
 		 141 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.464819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2431  hydrolase, nudix family  25.62 
 
 		 141 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2543  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.85 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188971  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0725  NUDIX hydrolase  22.22 
 
 		 178 aa  42  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21040  ADP-ribose pyrophosphatase  26.26 
 
 		 154 aa  42.4  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5925  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.63 
 
 		 181 aa  42  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0950734 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0674  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.94 
 
 		 177 aa  41.6  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.90735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0749  NUDIX family hydrolase  31.25 
 
 		 164 aa  41.6  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.159748  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0736  NUDIX domain-containing protein  31.25 
 
 		 164 aa  41.6  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0277965  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0269  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  23.42 
 
 		 175 aa  41.6  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2480  NUDIX family hydrolase  25.62 
 
 		 141 aa  42  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2639  NUDIX family hydrolase  25.62 
 
 		 141 aa  42  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0346  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 		 182 aa  42  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0239643 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0343  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  23.97 
 
 		 198 aa  42  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.447974  normal  0.157249 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2246  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 168 aa  42  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171331  decreased coverage  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  27.74 
 
 		 149 aa  41.2  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  23.77 
 
 		 132 aa  41.6  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2546  NUDIX family hydrolase  25.41 
 
 		 141 aa  41.6  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2398  NUDIX hydrolase  23.08 
 
 		 177 aa  41.6  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10425  normal  0.260078 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3569  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  21.47 
 
 		 197 aa  41.6  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.863637 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1623  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  22.11 
 
 		 175 aa  41.2  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11763  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  20.33 
 
 		 203 aa  41.2  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00483885 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36667  predicted protein  34.18 
 
 		 185 aa  41.2  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.179207 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2848  NUDIX hydrolase  26.62 
 
 		 184 aa  41.2  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000562976  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09350  dihydrofolate reductase  25.24 
 
 		 337 aa  41.2  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.32591  normal  0.990964 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  26.55 
 
 		 138 aa  40.8  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02177  predicted NUDIX hydrolase  25.41 
 
 		 141 aa  40.8  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256653  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1407  NUDIX hydrolase  25.41 
 
 		 141 aa  40.8  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>