235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl368.1 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl368.1  30S ribosomal protein S20  100 
 
 
81 aa  156  8e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.51128e-45  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0818  30S ribosomal protein S20  76.54 
 
 
81 aa  120  6e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  46.91 
 
 
89 aa  72  2e-12  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  51.95 
 
 
86 aa  65.9  2e-10  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  50.65 
 
 
87 aa  65.1  3e-10  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  52.56 
 
 
86 aa  63.9  7e-10  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53249e-08 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf244  ribosomal protein S20  46.84 
 
 
87 aa  63.9  8e-10  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026073  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0647  30S ribosomal protein S20  50 
 
 
84 aa  63.2  1e-09  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  2.92559e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  46.99 
 
 
162 aa  62.4  2e-09  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  1.27538e-06  unclonable  1.13677e-09 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 
92 aa  61.2  4e-09  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  50.67 
 
 
86 aa  61.6  4e-09  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  45.57 
 
 
88 aa  59.7  1e-08  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1643  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 
83 aa  60.1  1e-08  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1678  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 
83 aa  60.1  1e-08  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1654  ribosomal protein S20  47.56 
 
 
167 aa  59.3  2e-08  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.158748  hitchhiker  0.00316633 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  48.05 
 
 
92 aa  59.3  2e-08  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  48.05 
 
 
86 aa  58.9  2e-08  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  46.34 
 
 
86 aa  58.5  3e-08  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2242  30S ribosomal protein S20  50.65 
 
 
86 aa  58.2  4e-08  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.636504  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  45.57 
 
 
88 aa  58.2  4e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1755  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 
91 aa  57.8  5e-08  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00299182  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  42.68 
 
 
96 aa  57.4  6e-08  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  3.00859e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  43.9 
 
 
86 aa  57.4  6e-08  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 
86 aa  57.4  6e-08  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  44.3 
 
 
88 aa  56.2  1e-07  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 
89 aa  56.2  1e-07  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  46.34 
 
 
88 aa  56.2  1e-07  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  5.91631e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  47.5 
 
 
105 aa  55.8  2e-07  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  45.68 
 
 
95 aa  55.8  2e-07  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  44.3 
 
 
88 aa  55.8  2e-07  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  40.45 
 
 
98 aa  55.8  2e-07  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1678  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 
90 aa  56.2  2e-07  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  45 
 
 
151 aa  55.8  2e-07  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  46.75 
 
 
95 aa  55.5  2e-07  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 
88 aa  56.2  2e-07  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  3.03326e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  45.68 
 
 
88 aa  55.5  2e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0500  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 
90 aa  56.2  2e-07  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.166841  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  42.86 
 
 
89 aa  55.1  3e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2941  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 
112 aa  55.5  3e-07  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.205918  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0094  ribosomal protein S20  43.04 
 
 
89 aa  55.1  3e-07  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1019  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 
116 aa  55.1  3e-07  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  43.53 
 
 
86 aa  55.5  3e-07  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  46.15 
 
 
84 aa  55.1  3e-07  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  1.67926e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 
88 aa  54.7  4e-07  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.0022e-08  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 
88 aa  54.7  4e-07  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  7.11095e-08  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 
88 aa  54.7  4e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  3.22066e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0126  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 
95 aa  54.7  4e-07  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000563837  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 
88 aa  54.7  4e-07  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04341  30S ribosomal protein S20  39.33 
 
 
100 aa  54.7  4e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2835  ribosomal protein S20  41.03 
 
 
90 aa  54.3  5e-07  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.621113 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1153  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 
83 aa  54.7  5e-07  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.320164  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  40.24 
 
 
86 aa  54.3  6e-07  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 
88 aa  54.3  6e-07  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  7.00681e-09  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 
107 aa  54.3  6e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  42.86 
 
 
86 aa  53.9  7e-07  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 
88 aa  53.9  7e-07  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  43.21 
 
 
86 aa  53.9  8e-07  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  41.46 
 
 
96 aa  53.9  8e-07  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  5.67629e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 
88 aa  53.5  9e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18881  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 
98 aa  53.1  1e-06  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.825907  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 
87 aa  53.1  1e-06  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 
88 aa  53.1  1e-06  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0582  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 
87 aa  53.1  1e-06  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  1.60392e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  45.57 
 
 
88 aa  53.1  1e-06  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 
91 aa  52.8  1e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1018  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 
98 aa  53.1  1e-06  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.859687  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 
91 aa  52.8  1e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  43.21 
 
 
90 aa  53.1  1e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16911  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 
97 aa  52.4  2e-06  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3631  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 
87 aa  52  2e-06  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  5.06786e-06  normal  0.726814 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 
88 aa  52.8  2e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  2.94185e-06  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0023  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 
87 aa  52  2e-06  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.55802e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0025  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 
87 aa  52  2e-06  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.87642e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0022  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 
87 aa  52  2e-06  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  3.78838e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 
86 aa  52.4  2e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 
88 aa  52.8  2e-06  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  4.08096e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0027  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 
87 aa  52  2e-06  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.4189e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  43.59 
 
 
90 aa  52.8  2e-06  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  1.26326e-09  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0026  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 
87 aa  52  2e-06  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  1.3085e-09  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 
88 aa  52.8  2e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  48.19 
 
 
88 aa  52.8  2e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0921  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 
88 aa  52.4  2e-06  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  2.53205e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 
87 aa  52.8  2e-06  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 
87 aa  52.8  2e-06  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  44.44 
 
 
86 aa  52.8  2e-06  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07740  ribosomal protein S20  44.44 
 
 
172 aa  52.8  2e-06  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.603346 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2893  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 
88 aa  52.4  2e-06  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204979  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 
86 aa  52.4  2e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00026  hypothetical protein  44.44 
 
 
87 aa  52  2e-06  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  3.13857e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1580  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
97 aa  52.8  2e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00027  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 
87 aa  52  2e-06  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  4.13778e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 
88 aa  52.8  2e-06  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  2.04572e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4205  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 
97 aa  52.4  2e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.885045 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3575  ribosomal protein S20  44.44 
 
 
87 aa  52  2e-06  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.1535e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 
86 aa  52.4  2e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0047  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 
87 aa  51.6  3e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  8.72417e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3590  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 
87 aa  52  3e-06  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  5.79115e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0792  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 
87 aa  52  3e-06  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.29038e-06  normal  0.540603 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0048  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 
87 aa  51.6  3e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  3.98649e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0047  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 
87 aa  51.6  3e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  5.42728e-06  normal  0.0144218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>