235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl368.1 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl368.1  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 81 aa  156  8e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.5112799999999996e-45  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0818  30S ribosomal protein S20  76.54 
 
 		 81 aa  120  6e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 89 aa  72  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  51.95 
 
 		 86 aa  65.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  50.65 
 
 		 87 aa  65.1  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  52.56 
 
 		 86 aa  63.9  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf244  ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026073  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0647  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 84 aa  63.2  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000292559  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  46.99 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  50.67 
 
 		 86 aa  61.6  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  45.57 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1643  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1678  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  48.05 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1654  ribosomal protein S20  47.56 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.158748  hitchhiker  0.00316633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  48.05 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  46.34 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2242  30S ribosomal protein S20  50.65 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.636504  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1755  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00299182  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  42.68 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  43.9 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  46.34 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1678  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  40.45 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  47.5 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  46.75 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0500  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.166841  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  45 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1019  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  43.53 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2941  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.205918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  46.15 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0094  ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0126  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000563837  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04341  30S ribosomal protein S20  39.33 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1153  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.320164  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2835  ribosomal protein S20  41.03 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.621113 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000700681  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  40.24 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  41.46 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 91 aa  52.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 91 aa  52.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1018  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.859687  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  45.57 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18881  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0582  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000160392  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00027  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 87 aa  52  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000413778  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3575  ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 87 aa  52  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021535  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00026  hypothetical protein  44.44 
 
 		 87 aa  52  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000313857  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  44.44 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07740  ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.603346 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0023  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 87 aa  52  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000255802  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4205  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.885045 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1580  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0025  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 87 aa  52  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.87642e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0022  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 87 aa  52  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000378838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0027  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 87 aa  52  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024189  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3631  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 87 aa  52  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000506786  normal  0.726814 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2893  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204979  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0921  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000253205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0026  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 87 aa  52  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000013085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16911  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  48.19 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  43.59 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0792  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000429038  normal  0.540603 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12430  SSU ribosomal protein S20P  48.05 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0372924  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3462  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000449993  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 92 aa  51.6  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0047  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 87 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00000872417  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>