More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl355 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0684  valyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 
917 aa  652    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.980667  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 
879 aa  692    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 
880 aa  686    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2045  valyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 
887 aa  644    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  49.72 
 
 
881 aa  880    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2685  valyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 
888 aa  637    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000391784 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1364  valyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 
909 aa  640    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1228  valyl-tRNA synthetase  50.06 
 
 
876 aa  897    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0887446  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12260  valyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 
882 aa  646    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  49.78 
 
 
881 aa  881    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18101  valyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 
933 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 
880 aa  877    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0445  valyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
883 aa  847    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.262089  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 
881 aa  716    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0407  valyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 
880 aa  665    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0922688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  49.72 
 
 
881 aa  880    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  49.72 
 
 
881 aa  879    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl355  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 
873 aa  1791    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.473625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  49.72 
 
 
881 aa  880    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 
865 aa  656    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0785  valyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 
921 aa  655    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0756  valyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 
921 aa  657    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 
867 aa  649    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29141  valyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 
947 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1629  valyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
883 aa  664    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 
891 aa  662    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1531  valyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 
888 aa  647    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0577  valyl-tRNA synthetase  36.77 
 
 
912 aa  656    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113426  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4102  valyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 
1006 aa  647    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2982  valyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
1002 aa  637    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 
892 aa  723    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1091  valyl-tRNA synthetase  36.72 
 
 
929 aa  638    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1721  valyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 
876 aa  914    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2315  valyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 
885 aa  647    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169749  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 
879 aa  750    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0504  valyl-tRNA synthetase  49.72 
 
 
884 aa  895    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000238585  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 
880 aa  885    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  50.06 
 
 
881 aa  885    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2558  valyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 
914 aa  637    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0956  valyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 
887 aa  650    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 
881 aa  742    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1503  valyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 
924 aa  665    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000330515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  49.72 
 
 
881 aa  880    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 
884 aa  736    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1775  valyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 
918 aa  643    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.651419  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 
909 aa  684    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0742  valyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 
926 aa  654    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279651  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0258  valyl-tRNA synthetase  63.24 
 
 
872 aa  1150    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0236  valyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 
879 aa  639    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
880 aa  697    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 
909 aa  673    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
881 aa  880    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0722  valyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 
895 aa  646    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3563  valyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 
883 aa  640    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_372  valyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 
880 aa  678    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0207996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1799  valyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 
886 aa  636    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.398016  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0091  valyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 
943 aa  648    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1729  valyl-tRNA synthetase  37.54 
 
 
884 aa  639    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 
881 aa  874    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
866 aa  689    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0950  valyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 
883 aa  674    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1755  valyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 
876 aa  914    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.746599  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18731  valyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
918 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  50.06 
 
 
881 aa  883    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0010  valyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 
922 aa  655    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.885408  hitchhiker  0.00234532 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0705  valyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 
909 aa  652    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.727948  normal  0.597989 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 
874 aa  735    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 
881 aa  686    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3558  valyl-tRNA synthetase  37.54 
 
 
883 aa  636    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462597  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1241  valyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
879 aa  723    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3564  valyl-tRNA synthetase  39.98 
 
 
921 aa  677    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1090  valyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 
881 aa  639    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0316767  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0367  valyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 
907 aa  652    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.159173  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 
880 aa  731    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 
880 aa  727    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2538  valyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 
897 aa  653    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 
911 aa  665    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0263  valyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 
874 aa  755    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 
865 aa  666    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0555  valyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 
917 aa  656    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00036551 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0678  valyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 
909 aa  652    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 
883 aa  736    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
881 aa  689    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 
885 aa  728    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf019  fusion of oligopeptide transport protein OppF and Valyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
1631 aa  660    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2479  valyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 
880 aa  816    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225877  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1392  valyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
902 aa  813    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0390871  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1219  valyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 
879 aa  839    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0322  valyl-tRNA synthetase  46.4 
 
 
894 aa  822    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0513  valyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 
883 aa  838    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 
882 aa  726    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0192  valyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 
892 aa  658    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.209132  normal  0.584595 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1199  valyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
883 aa  742    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.842329  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01578  valyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 
924 aa  650    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.337374  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0741  valyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 
888 aa  641    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0469934  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1580  valyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 
886 aa  659    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1457  valyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 
874 aa  650    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  50.06 
 
 
881 aa  881    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3631  valyl-tRNA synthetase  37.54 
 
 
883 aa  636    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0657894 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 
882 aa  711    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>