More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl309 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B1609  DNA topoisomerase IV subunit B  57.19 
 
 		 654 aa  730    Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000967673  decreased coverage  0.000000000000694445 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1617  DNA topoisomerase IV subunit B  58.19 
 
 		 656 aa  732    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000200667  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0925  DNA topoisomerase IV subunit B  54.84 
 
 		 666 aa  686    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.305492  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  57.19 
 
 		 654 aa  738    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1154  DNA topoisomerase IV subunit B  55.66 
 
 		 653 aa  712    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  57.34 
 
 		 654 aa  738    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  57.34 
 
 		 654 aa  739    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl309  DNA topoisomerase IV subunit B  100 
 
 		 647 aa  1323    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.747062  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  57.34 
 
 		 654 aa  739    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2247  DNA topoisomerase IV subunit B  57.03 
 
 		 654 aa  737    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000227299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  57.34 
 
 		 654 aa  739    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3285  DNA topoisomerase IV subunit B  57.19 
 
 		 654 aa  738    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  57.34 
 
 		 654 aa  738    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0523  DNA topoisomerase IV subunit B  52.54 
 
 		 642 aa  673    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0457  DNA topoisomerase IV, B subunit  75.62 
 
 		 643 aa  1010    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.576082  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  57.19 
 
 		 654 aa  738    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000439989  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1416  DNA topoisomerase IV subunit B  55.71 
 
 		 665 aa  697    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0092743  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2558  DNA topoisomerase IV subunit B  57.76 
 
 		 645 aa  733    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3706  DNA topoisomerase IV subunit B  57.34 
 
 		 654 aa  733    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1443  DNA topoisomerase IV subunit B  55.71 
 
 		 663 aa  697    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0710964  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0782  DNA topoisomerase IV subunit B  53.99 
 
 		 674 aa  691    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000186449  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1065  DNA topoisomerase IV subunit B  56.78 
 
 		 644 aa  717    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0137081  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1026  DNA topoisomerase IV subunit B  54.86 
 
 		 674 aa  669    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0999  DNA topoisomerase IV subunit B  54.67 
 
 		 661 aa  699    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1364  DNA topoisomerase IV subunit B  53.83 
 
 		 687 aa  664    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0683915  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0633  DNA topoisomerase IV subunit B  56.54 
 
 		 649 aa  709    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.144503  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf020  topoiosmerase IV subunit B  53.25 
 
 		 637 aa  647    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  51.27 
 
 		 640 aa  624  1e-177  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  51.27 
 
 		 650 aa  616  1e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  51.36 
 
 		 640 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  52.99 
 
 		 640 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  53.24 
 
 		 640 aa  608  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  47.98 
 
 		 647 aa  607  9.999999999999999e-173  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  49.28 
 
 		 637 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  50.96 
 
 		 634 aa  602  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  48.41 
 
 		 628 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  49.6 
 
 		 636 aa  599  1e-170  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  50.88 
 
 		 642 aa  597  1e-169  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  47.53 
 
 		 649 aa  595  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  49.69 
 
 		 645 aa  598  1e-169  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  49.45 
 
 		 636 aa  595  1e-169  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  47.39 
 
 		 633 aa  598  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  52.36 
 
 		 640 aa  592  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  52.36 
 
 		 640 aa  592  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  52.36 
 
 		 640 aa  592  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  52.67 
 
 		 640 aa  593  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  52.36 
 
 		 640 aa  592  1e-168  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  52.36 
 
 		 640 aa  592  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  48.98 
 
 		 644 aa  593  1e-168  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  52.36 
 
 		 640 aa  592  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  47.86 
 
 		 636 aa  592  1e-168  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  50 
 
 		 644 aa  593  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2676  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  49.07 
 
 		 638 aa  593  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000429732  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  52.85 
 
 		 640 aa  593  1e-168  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  50.64 
 
 		 642 aa  589  1e-167  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  51.11 
 
 		 638 aa  591  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  50.47 
 
 		 633 aa  588  1e-167  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  52.36 
 
 		 640 aa  591  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  52.2 
 
 		 640 aa  590  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  47.26 
 
 		 686 aa  591  1e-167  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  47.28 
 
 		 650 aa  585  1e-166  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  48.64 
 
 		 632 aa  588  1e-166  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  47.87 
 
 		 635 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_4  DNA gyrase, B subunit  49.6 
 
 		 642 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  50.88 
 
 		 627 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  48.9 
 
 		 648 aa  582  1.0000000000000001e-165  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  52.04 
 
 		 640 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  49.3 
 
 		 652 aa  581  1e-164  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  47.55 
 
 		 637 aa  581  1e-164  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  49.6 
 
 		 641 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  50.08 
 
 		 642 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  48.75 
 
 		 648 aa  577  1.0000000000000001e-163  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  49.84 
 
 		 650 aa  575  1.0000000000000001e-163  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  49.13 
 
 		 633 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  51.34 
 
 		 637 aa  572  1.0000000000000001e-162  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  49.45 
 
 		 650 aa  572  1e-161  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  45.74 
 
 		 636 aa  570  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0296  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  47.34 
 
 		 642 aa  572  1e-161  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0041  DNA gyrase, B subunit  47.73 
 
 		 634 aa  570  1e-161  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  47.78 
 
 		 635 aa  569  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  51.83 
 
 		 638 aa  571  1e-161  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  51.67 
 
 		 638 aa  571  1e-161  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  48.37 
 
 		 650 aa  570  1e-161  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf800  DNA gyrase subunit B  46.7 
 
 		 647 aa  568  1e-160  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  47.27 
 
 		 651 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  48.9 
 
 		 635 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  48.75 
 
 		 651 aa  564  1.0000000000000001e-159  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  46.99 
 
 		 637 aa  561  1e-158  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0306  DNA gyrase, B subunit  46.71 
 
 		 643 aa  559  1e-158  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337431  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  48.64 
 
 		 633 aa  558  1e-158  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  49.53 
 
 		 649 aa  561  1e-158  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  47.09 
 
 		 644 aa  556  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0003  DNA gyrase subunit B  47.3 
 
 		 772 aa  555  1e-157  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0335  DNA gyrase, B subunit  49.14 
 
 		 645 aa  557  1e-157  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00050  DNA gyrase subunit B  45.99 
 
 		 720 aa  555  1e-157  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0006  DNA gyrase subunit B  46.25 
 
 		 696 aa  557  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  47.22 
 
 		 659 aa  558  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  48.66 
 
 		 643 aa  553  1e-156  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  46.27 
 
 		 651 aa  554  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0006  DNA gyrase subunit B  47.52 
 
 		 661 aa  553  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.925878  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>