More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl231 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl231  ribonuclease III, dsRNA-specific ribonuclease  100 
 
 		 231 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0492  ribonuclease III  58.52 
 
 		 232 aa  286  2e-76  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.863648  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  38.91 
 
 		 246 aa  161  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  39.91 
 
 		 246 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  39.29 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  39.29 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  40.36 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  38.3 
 
 		 259 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  37.61 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  37.56 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  38.77 
 
 		 245 aa  149  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  38.01 
 
 		 377 aa  148  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  41.1 
 
 		 236 aa  148  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  39.29 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  39.29 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  39.29 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  39.29 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  39.29 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  39.29 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  39.29 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  39.29 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  38.89 
 
 		 241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  39.29 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  38.89 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  37.44 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  41.18 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  36.67 
 
 		 385 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  39.35 
 
 		 262 aa  143  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  37.93 
 
 		 240 aa  143  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  38.36 
 
 		 240 aa  142  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  35.71 
 
 		 383 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  35.71 
 
 		 383 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0780  ribonuclease III  38.64 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.30965e-17 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  40.29 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  36.95 
 
 		 241 aa  139  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  34.8 
 
 		 240 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1159  ribonuclease III  34.07 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000332232  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0774  ribonuclease III  41.36 
 
 		 229 aa  135  4e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  37.02 
 
 		 248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1144  ribonuclease III  41.82 
 
 		 229 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  34.6 
 
 		 246 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  37.02 
 
 		 248 aa  134  9e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  35.51 
 
 		 240 aa  134  9e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  36.68 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  32.72 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  36.49 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1565  ribonuclease III  35.82 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  36.6 
 
 		 237 aa  132  6e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  37.17 
 
 		 233 aa  132  6e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  35.59 
 
 		 225 aa  131  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  35.59 
 
 		 225 aa  131  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  33.62 
 
 		 234 aa  131  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  35.16 
 
 		 232 aa  131  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  33.03 
 
 		 246 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  39.09 
 
 		 229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0839  ribonuclease III  40.64 
 
 		 227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0453  ribonuclease III  34.42 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0598  ribonuclease III  33.18 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243515 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  36.36 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  35.43 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  33.8 
 
 		 222 aa  129  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1604  ribonuclease III  38.57 
 
 		 231 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0863  ribonuclease III  38.15 
 
 		 248 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.016205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1007  ribonuclease III  38.15 
 
 		 248 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0279333 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  34.84 
 
 		 246 aa  128  9.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  33.48 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  36.73 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18360  RNAse III  36.41 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  33.48 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  38.25 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  33.61 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  38.25 
 
 		 224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2086  ribonuclease III  37.99 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1571  ribonuclease III  35.78 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.325561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  37.02 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  38.25 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  32.75 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  34.96 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0928  ribonuclease III  32.6 
 
 		 256 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  37.09 
 
 		 221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  35.02 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  38.07 
 
 		 234 aa  125  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0993  ribonuclease III  32.74 
 
 		 256 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0631846  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2252  ribonuclease III  33.19 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8017  ribonuclease III  34.62 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  34.76 
 
 		 246 aa  123  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  36.56 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1159  ribonuclease III  37.79 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0556281  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  34.53 
 
 		 223 aa  124  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1063  ribonuclease III  32.74 
 
 		 256 aa  122  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362018  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1388  ribonuclease III  33.33 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.625723  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  34.88 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1287  ribonuclease III  34.95 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  33.18 
 
 		 234 aa  122  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  35.34 
 
 		 231 aa  122  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2418  ribonuclease III  33.19 
 
 		 256 aa  122  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  37.79 
 
 		 223 aa  122  5e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2780  ribonuclease III  38.14 
 
 		 267 aa  122  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2495  ribonuclease III  32.55 
 
 		 273 aa  122  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2245  ribonuclease III  33.03 
 
 		 229 aa  122  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>