More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl196 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl196  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  100 
 
 
425 aa  849    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0292309  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0209  rRNA methyltransferase RsmB (sun protein), putative  53.43 
 
 
428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  35.83 
 
 
442 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  35.37 
 
 
442 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  33.86 
 
 
444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  33.33 
 
 
447 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  32.96 
 
 
444 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  33.03 
 
 
444 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  33.26 
 
 
444 aa  229  6e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  32.8 
 
 
444 aa  229  8e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  34.73 
 
 
435 aa  228  1e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  32.8 
 
 
444 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  33.26 
 
 
444 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  32.8 
 
 
444 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  33.03 
 
 
444 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  33.03 
 
 
444 aa  228  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  33.03 
 
 
444 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  33.03 
 
 
444 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  29.69 
 
 
444 aa  226  7e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  34.53 
 
 
455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  32.87 
 
 
435 aa  219  8.999999999999998e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  32.87 
 
 
435 aa  219  8.999999999999998e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  29.35 
 
 
446 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1171  sun protein  29.02 
 
 
449 aa  213  5.999999999999999e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1513  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  30.8 
 
 
448 aa  211  1e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0664  Fmu (Sun) domain protein  34.94 
 
 
430 aa  210  4e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0762  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  33.11 
 
 
438 aa  208  1e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000298868 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  27.45 
 
 
451 aa  205  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  28.25 
 
 
448 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  31.03 
 
 
462 aa  204  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  29.96 
 
 
453 aa  203  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1042  Fmu (Sun) domain protein  33.17 
 
 
406 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1437  sun protein  32.49 
 
 
430 aa  201  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  28.22 
 
 
453 aa  201  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  28.41 
 
 
452 aa  199  9e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  33.8 
 
 
438 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1119  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  29.14 
 
 
429 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  27.78 
 
 
452 aa  197  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  27.07 
 
 
452 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  27.96 
 
 
449 aa  195  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  28.16 
 
 
448 aa  195  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0928  sun protein  31.23 
 
 
445 aa  193  4e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  30.75 
 
 
452 aa  193  6e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0425  sun protein  32.41 
 
 
438 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04881  Sun protein (Fmu protein)  31.87 
 
 
437 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.929228  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  29.87 
 
 
443 aa  191  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  29.53 
 
 
452 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20681  Sun protein (Fmu protein)  28.64 
 
 
450 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2084  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  31.25 
 
 
424 aa  190  4e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616143  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  30.83 
 
 
440 aa  190  5e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  32.71 
 
 
438 aa  189  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  28.25 
 
 
464 aa  189  8e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  28.67 
 
 
429 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04221  Sun protein (Fmu protein)  29.18 
 
 
432 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1768  sun protein  27.71 
 
 
444 aa  187  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  25.63 
 
 
451 aa  186  5e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  30.28 
 
 
427 aa  186  8e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  30.09 
 
 
436 aa  186  8e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  27.23 
 
 
451 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  26.79 
 
 
451 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  29.75 
 
 
427 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  30.36 
 
 
449 aa  183  6e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  26.91 
 
 
446 aa  183  7e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  29.43 
 
 
451 aa  182  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00020  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  31.63 
 
 
439 aa  182  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  30.52 
 
 
456 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0021  sun protein  26.1 
 
 
434 aa  180  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0022  sun protein  26.1 
 
 
431 aa  180  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.242982 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2201  Fmu (Sun) domain protein  32.87 
 
 
437 aa  179  5.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.256814  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  28.83 
 
 
434 aa  180  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0804  sun protein  27.74 
 
 
445 aa  179  7e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0103148 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  27.75 
 
 
448 aa  179  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0728  sun protein  32.73 
 
 
449 aa  179  8e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0317  sun protein  32.28 
 
 
440 aa  178  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1575  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  27.87 
 
 
445 aa  177  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  27.12 
 
 
452 aa  178  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  28.15 
 
 
451 aa  177  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1394  RNA-binding protein  30.61 
 
 
442 aa  177  3e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  28.7 
 
 
429 aa  177  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  28.7 
 
 
429 aa  176  6e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  28.48 
 
 
429 aa  176  7e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  28.48 
 
 
429 aa  176  7e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  27.75 
 
 
448 aa  176  7e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  28.48 
 
 
429 aa  176  7e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  28.48 
 
 
429 aa  176  7e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  28.48 
 
 
429 aa  176  7e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  26.71 
 
 
429 aa  176  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  26.71 
 
 
429 aa  176  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0015  sun protein  27.33 
 
 
462 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0800124 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0073  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  29.98 
 
 
444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  24.27 
 
 
443 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  25.06 
 
 
457 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  28.06 
 
 
429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  26.19 
 
 
435 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3970  16S rRNA methyltransferase B  28.38 
 
 
429 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.121594  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3791  16S rRNA methyltransferase B  28.83 
 
 
429 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  31.4 
 
 
438 aa  173  5e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0179  sun protein  27.94 
 
 
448 aa  172  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  30.72 
 
 
448 aa  172  9e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  27.09 
 
 
429 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.199091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>