More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl173 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl173  dehydrogenase  100 
 
 
278 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl172  dehydrogenase  58.7 
 
 
279 aa  356  1.9999999999999998e-97  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.72 
 
 
280 aa  244  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.49 
 
 
279 aa  234  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205485  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.12 
 
 
280 aa  228  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.82 
 
 
283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.64 
 
 
281 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 
279 aa  218  7e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 
282 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
280 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.45 
 
 
277 aa  212  7e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0647025  normal  0.205798 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.41 
 
 
285 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.239273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
281 aa  210  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.84 
 
 
279 aa  210  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000868521 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
284 aa  209  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 
277 aa  207  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
286 aa  202  6e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.54 
 
 
283 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 
274 aa  202  7e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.25 
 
 
280 aa  198  7e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
279 aa  198  7.999999999999999e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
276 aa  198  9e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 
282 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  39.25 
 
 
284 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.59 
 
 
285 aa  195  8.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 
280 aa  194  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 
286 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
283 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 
299 aa  192  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  38.87 
 
 
284 aa  191  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 
285 aa  191  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
276 aa  191  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 
282 aa  190  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
275 aa  190  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.88 
 
 
275 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  37.74 
 
 
280 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
287 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3499  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.23 
 
 
294 aa  189  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.22 
 
 
292 aa  189  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0160935 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.03 
 
 
292 aa  188  7e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 
276 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1152  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 
258 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.84 
 
 
286 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  38.64 
 
 
280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  37.26 
 
 
284 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.12 
 
 
296 aa  182  8.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149437 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1177  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
288 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.12 
 
 
283 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451559  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.64 
 
 
279 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
276 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
291 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321588  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
291 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
291 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403602  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
293 aa  176  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.25 
 
 
283 aa  175  7e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366194  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.72 
 
 
271 aa  175  9e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
286 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0971  Short-chain alcohol dehydrogenase  35.27 
 
 
287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  33.96 
 
 
276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 
293 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.426918 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 
293 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.935944  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0757  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  36.51 
 
 
282 aa  172  3.9999999999999995e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0227485  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.7 
 
 
295 aa  172  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
291 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0244  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
291 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.864634 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
276 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
276 aa  170  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.19 
 
 
284 aa  170  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  34.66 
 
 
284 aa  170  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  32.71 
 
 
277 aa  170  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6919  short chain dehydrogenase  32.2 
 
 
276 aa  169  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
284 aa  169  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 
280 aa  168  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  36.8 
 
 
282 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
279 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1451  short chain dehydrogenase  31.94 
 
 
277 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6377  short chain dehydrogenase  31.94 
 
 
277 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.06 
 
 
281 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7041  short chain dehydrogenase  31.56 
 
 
277 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  normal  0.204999 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  38.65 
 
 
274 aa  166  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.83 
 
 
290 aa  165  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  30.86 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7039  short chain dehydrogenase  32.33 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0246661  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  35.21 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46420  short chain dehydrogenase  31.82 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000350021  hitchhiker  0.000971378 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.93 
 
 
278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
272 aa  162  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
268 aa  161  9e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
279 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
279 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96036  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  36.02 
 
 
303 aa  160  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5725  short chain dehydrogenase  31.44 
 
 
277 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
282 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
272 aa  159  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
282 aa  160  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32520  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  31.54 
 
 
278 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1180  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
279 aa  159  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>