More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl160 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0712  DNA ligase, NAD-dependent  63.36 
 
 
668 aa  870  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl160  DNA ligase, polydeoxyribonucleotide synthase NAD+  100 
 
 
666 aa  1342  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0025564  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.65 
 
 
669 aa  606  1e-172  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.65 
 
 
669 aa  606  1e-172  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.65 
 
 
669 aa  605  1e-172  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.65 
 
 
669 aa  606  1e-172  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.65 
 
 
669 aa  606  1e-172  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.8 
 
 
669 aa  607  1e-172  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.65 
 
 
669 aa  607  1e-172  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.8 
 
 
669 aa  607  1e-172  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.8 
 
 
669 aa  606  1e-172  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.2 
 
 
669 aa  605  1e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.2 
 
 
669 aa  602  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.55 
 
 
670 aa  595  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1513  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.83 
 
 
648 aa  586  1e-166  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1444  DNA ligase, NAD-dependent  45.05 
 
 
680 aa  585  1e-165  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0179686  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1515  NAD-dependent DNA ligase  45.18 
 
 
668 aa  583  1e-165  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.872196 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.05 
 
 
670 aa  581  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  42.47 
 
 
673 aa  556  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0850  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.8 
 
 
652 aa  556  1e-157  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1993  DNA ligase, NAD-dependent  44.61 
 
 
667 aa  552  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  44.61 
 
 
667 aa  552  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1442  DNA ligase, NAD-dependent  44.85 
 
 
665 aa  550  1e-155  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.474438  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  44.58 
 
 
663 aa  549  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  42.92 
 
 
670 aa  547  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  43.84 
 
 
663 aa  542  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  45.52 
 
 
662 aa  544  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0683  DNA ligase, NAD-dependent  41.78 
 
 
684 aa  544  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.992096  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  40.38 
 
 
712 aa  542  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  41.94 
 
 
672 aa  541  1e-152  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0472  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.82 
 
 
686 aa  541  1e-152  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  43.85 
 
 
673 aa  541  1e-152  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  1.64842e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  41.85 
 
 
672 aa  535  1e-151  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  42.11 
 
 
678 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0427  NAD-dependent DNA ligase  44.43 
 
 
684 aa  536  1e-151  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  43.69 
 
 
670 aa  532  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.39643e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0369  DNA ligase (NAD(+))  43.2 
 
 
661 aa  530  1e-149  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.49 
 
 
676 aa  529  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  40.74 
 
 
681 aa  526  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  42.27 
 
 
659 aa  527  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  6.11736e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0136  DNA ligase, NAD-dependent  44.8 
 
 
673 aa  525  1e-147  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.145225  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  40.48 
 
 
685 aa  524  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  41.42 
 
 
677 aa  521  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  1.92603e-05  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  42.09 
 
 
674 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  41.19 
 
 
670 aa  520  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.5 
 
 
679 aa  518  1e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  38.94 
 
 
673 aa  518  1e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1511  DNA ligase, NAD-dependent  42.99 
 
 
662 aa  516  1e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217425  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  41.78 
 
 
668 aa  515  1e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  41.63 
 
 
674 aa  516  1e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3475  DNA ligase, NAD-dependent  42.42 
 
 
668 aa  515  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.502596  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.69 
 
 
670 aa  511  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.48607e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.69 
 
 
670 aa  509  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  2.69504e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4656  DNA ligase, NAD-dependent  41.86 
 
 
673 aa  510  1e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.203554  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.69 
 
 
670 aa  509  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.53003e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  41.06 
 
 
671 aa  511  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  41.63 
 
 
668 aa  510  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  41.52 
 
 
666 aa  511  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1253  DNA ligase, NAD-dependent  41.39 
 
 
669 aa  506  1e-142  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1738  DNA ligase (NAD(+))  40.42 
 
 
670 aa  506  1e-142  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000265236  hitchhiker  3.08694e-09 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  40.18 
 
 
706 aa  507  1e-142  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1433  DNA ligase, NAD-dependent  42.69 
 
 
704 aa  506  1e-142  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2679  DNA ligase, NAD-dependent  39.94 
 
 
685 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.8832e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2205  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.09 
 
 
680 aa  503  1e-141  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1705  DNA ligase, NAD-dependent  39.79 
 
 
685 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000114947  decreased coverage  2.04337e-10 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0503  DNA ligase, NAD-dependent  41.15 
 
 
671 aa  502  1e-141  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.720163  normal  0.76832 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0947  DNA ligase, NAD-dependent  45.05 
 
 
675 aa  504  1e-141  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2758  DNA ligase, NAD-dependent  39.94 
 
 
685 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00554758  hitchhiker  0.000696981 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  41.33 
 
 
672 aa  502  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2896  DNA ligase, NAD-dependent  39.58 
 
 
689 aa  504  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0996  DNA ligase, NAD-dependent  42.42 
 
 
668 aa  502  1e-141  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2364  DNA ligase, NAD-dependent  39.52 
 
 
685 aa  501  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0084265  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  41.82 
 
 
688 aa  500  1e-140  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  39.29 
 
 
690 aa  501  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  4.29666e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  39.29 
 
 
690 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  1.19836e-07 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  41.82 
 
 
688 aa  500  1e-140  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  41.54 
 
 
681 aa  499  1e-140  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1313  DNA ligase  40.65 
 
 
670 aa  499  1e-140  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.269353 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3318  DNA ligase, NAD-dependent  41.67 
 
 
670 aa  499  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.563923 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  39.14 
 
 
691 aa  499  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  1.91104e-10 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1455  DNA ligase, NAD-dependent  40.85 
 
 
671 aa  498  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2377  DNA ligase, NAD-dependent  40.27 
 
 
669 aa  497  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000760862  unclonable  2.01736e-06 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf373  DNA ligase  43.43 
 
 
665 aa  497  1e-139  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  1.22507e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2552  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.17 
 
 
680 aa  498  1e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2461  DNA ligase, NAD-dependent  38.83 
 
 
670 aa  497  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360751  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1878  DNA ligase, NAD-dependent  36.53 
 
 
711 aa  494  1e-138  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1516  DNA ligase (NAD(+))  39.37 
 
 
681 aa  494  1e-138  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  6.78531e-05  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  38.56 
 
 
684 aa  494  1e-138  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0475  DNA ligase, NAD-dependent  39.38 
 
 
676 aa  493  1e-138  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0568  NAD-dependent DNA ligase  41.47 
 
 
680 aa  493  1e-138  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  39.82 
 
 
690 aa  494  1e-138  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01312  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.21 
 
 
670 aa  493  1e-138  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21501  NAD-dependent DNA ligase  42.71 
 
 
690 aa  493  1e-138  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  38.78 
 
 
708 aa  489  1e-137  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  4.6682e-05  normal  0.968488 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2205  DNA ligase, NAD-dependent  38.58 
 
 
708 aa  489  1e-137  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.82 
 
 
671 aa  489  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  4.02344e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  40.03 
 
 
671 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  4.50383e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0492  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.58 
 
 
669 aa  491  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.42454e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0894  DNA ligase, NAD-dependent  40.44 
 
 
700 aa  491  1e-137  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1559  DNA ligase, NAD-dependent  41.15 
 
 
662 aa  491  1e-137  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0638727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>