More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl149 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl149  30S ribosomal protein S11  100 
 
 
130 aa  263  8e-70  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000575404  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0671  30S ribosomal protein S11  87.96 
 
 
129 aa  202  1e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  70.83 
 
 
129 aa  185  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  70.83 
 
 
129 aa  185  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  70.83 
 
 
129 aa  184  3e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2303  30S ribosomal protein S11  57.14 
 
 
134 aa  173  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0404  30S ribosomal protein S11  57.89 
 
 
134 aa  173  9e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0396  30S ribosomal protein S11  57.89 
 
 
134 aa  173  9e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1045  30S ribosomal protein S11  57.89 
 
 
134 aa  172  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0624  30S ribosomal protein S11  57.14 
 
 
134 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5047  30S ribosomal protein S11  56.39 
 
 
134 aa  171  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  65.57 
 
 
128 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0499  30S ribosomal protein S11  56.39 
 
 
134 aa  171  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0343  30S ribosomal protein S11  55.64 
 
 
134 aa  168  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255505  hitchhiker  0.000136373 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0131  30S ribosomal protein S11  67.44 
 
 
129 aa  168  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000108519  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  58.91 
 
 
129 aa  167  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3419  30S ribosomal protein S11  56.67 
 
 
133 aa  167  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.119474 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4219  30S ribosomal protein S11  55.64 
 
 
134 aa  167  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.815037  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  58.91 
 
 
129 aa  167  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  60.47 
 
 
129 aa  167  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3925  30S ribosomal protein S11  54.89 
 
 
134 aa  166  7e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  60.83 
 
 
129 aa  166  8e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  62.31 
 
 
131 aa  166  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  60 
 
 
129 aa  165  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  54.69 
 
 
135 aa  165  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  61.67 
 
 
129 aa  165  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  60 
 
 
131 aa  165  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  57.25 
 
 
132 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  57.36 
 
 
129 aa  164  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  60.83 
 
 
131 aa  164  4e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  59.69 
 
 
129 aa  164  4e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  57.36 
 
 
129 aa  164  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 
129 aa  164  5e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 
133 aa  164  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0278  30S ribosomal protein S11  58.91 
 
 
129 aa  164  5e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  0.618273 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0481  30S ribosomal protein S11  58.14 
 
 
130 aa  164  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0181  30S ribosomal protein S11  56.59 
 
 
130 aa  164  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000807145  hitchhiker  0.00156032 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0428  30S ribosomal protein S11  56.59 
 
 
130 aa  163  5.9999999999999996e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.316417  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0137  30S ribosomal protein S11  67.44 
 
 
129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000197157  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  59.69 
 
 
129 aa  163  8e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  55.81 
 
 
130 aa  163  9e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2995  30S ribosomal protein S11  56.67 
 
 
133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3273  30S ribosomal protein S11  56.67 
 
 
133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  58.14 
 
 
129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2926  30S ribosomal protein S11  56.67 
 
 
133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  56.59 
 
 
130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  57.36 
 
 
129 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  57.36 
 
 
129 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  57.36 
 
 
129 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1923  30S ribosomal protein S11  54.26 
 
 
130 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194942  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  53.38 
 
 
134 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  53.38 
 
 
134 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  53.38 
 
 
134 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2989  30S ribosomal protein S11  56.59 
 
 
130 aa  162  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108591  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0236  30S ribosomal protein S11  56.59 
 
 
130 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000127993  unclonable  0.00000919144 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  56.67 
 
 
133 aa  161  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  56.67 
 
 
133 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4667  30S ribosomal protein S11  55.81 
 
 
130 aa  161  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000031185  unclonable  0.00000000812252 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  56.67 
 
 
133 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  56.67 
 
 
133 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  56.67 
 
 
133 aa  161  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  56.67 
 
 
133 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3886  30S ribosomal protein S11  57.36 
 
 
129 aa  161  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  56.67 
 
 
133 aa  161  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  56.67 
 
 
133 aa  161  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0207  30S ribosomal protein S11  55.81 
 
 
130 aa  161  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000194302  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  56.67 
 
 
133 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  56.67 
 
 
133 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  56.67 
 
 
133 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  56.67 
 
 
133 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0171  30S ribosomal protein S11  56.59 
 
 
130 aa  161  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000137898  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  56.67 
 
 
133 aa  161  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  56.67 
 
 
133 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  56.67 
 
 
133 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  65.22 
 
 
137 aa  160  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0157  30S ribosomal protein S11  67.44 
 
 
129 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000139705  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1549  ribosomal protein S11  60.77 
 
 
131 aa  160  4.0000000000000004e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5169  30S ribosomal protein S11  68.22 
 
 
129 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  57.36 
 
 
129 aa  161  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1882  30S ribosomal protein S11  65.89 
 
 
127 aa  160  4.0000000000000004e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  56.59 
 
 
129 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4296  30S ribosomal protein S11  55.81 
 
 
130 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000132773  unclonable  0.0000000000385388 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  57.36 
 
 
129 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0193  30S ribosomal protein S11  55.81 
 
 
130 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310597  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0074  30S ribosomal protein S11  57.63 
 
 
135 aa  160  5.0000000000000005e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.475977  hitchhiker  0.00000000906112 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  54.26 
 
 
130 aa  160  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0783  30S ribosomal protein S11  58.14 
 
 
129 aa  160  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483609  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0136  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 
129 aa  160  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0136  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 
129 aa  160  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000120861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0131  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 
129 aa  160  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000558036  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0129  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 
129 aa  160  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000161096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0136  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 
129 aa  160  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000602059  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0167  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 
129 aa  160  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000803352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0149  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 
129 aa  160  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.28722e-60 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0133  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 
129 aa  160  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1458  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 
129 aa  160  7e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000430937  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0308  30S ribosomal protein S11  58.14 
 
 
129 aa  160  7e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0130  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 
129 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000100663  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  55.81 
 
 
129 aa  159  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  57.5 
 
 
129 aa  159  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>