More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl135 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  100 
 
 
180 aa  361  3e-99  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0684  50S ribosomal protein L5  81.67 
 
 
180 aa  307  5e-83  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  67.98 
 
 
179 aa  255  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  67.98 
 
 
179 aa  256  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  67.98 
 
 
179 aa  256  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  67.98 
 
 
179 aa  256  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  67.98 
 
 
179 aa  255  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  67.98 
 
 
179 aa  256  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  67.98 
 
 
179 aa  254  4e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  68 
 
 
183 aa  253  7e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  65 
 
 
180 aa  253  8e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  66.85 
 
 
179 aa  253  9e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  66.85 
 
 
179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 
179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  66.85 
 
 
179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  66.85 
 
 
179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 
179 aa  251  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 
179 aa  251  5.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 
179 aa  251  5.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  66.85 
 
 
179 aa  251  6e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  64.61 
 
 
179 aa  249  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  64.44 
 
 
180 aa  249  2e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.5322100000000002e-28 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  65.73 
 
 
179 aa  248  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  63.33 
 
 
180 aa  248  3e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  64.04 
 
 
181 aa  246  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  65.34 
 
 
180 aa  244  6e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  63.07 
 
 
179 aa  244  6.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  61.02 
 
 
179 aa  242  3e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 
180 aa  241  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  61.45 
 
 
180 aa  242  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0208  50S ribosomal protein L5  60.56 
 
 
180 aa  241  3.9999999999999997e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0607  50S ribosomal protein L5  62.78 
 
 
180 aa  241  5e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000230236  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  62.78 
 
 
180 aa  241  5e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 
182 aa  240  6e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 
220 aa  241  6e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0770  50S ribosomal protein L5  62.92 
 
 
180 aa  240  7e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000253341  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0307  50S ribosomal protein L5  64.04 
 
 
180 aa  240  9e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000563605  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  61.11 
 
 
180 aa  239  1e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 
179 aa  237  5e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4926  ribosomal protein L5  60.8 
 
 
179 aa  238  5e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000138257  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  59.44 
 
 
193 aa  237  6.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 
179 aa  236  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 
178 aa  236  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  62.29 
 
 
180 aa  236  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 
179 aa  235  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  62.36 
 
 
179 aa  235  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2052  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 
196 aa  235  3e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000691649  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0713  50S ribosomal protein L5  62.78 
 
 
184 aa  235  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000209145  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 
179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 
179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  63.48 
 
 
179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 
179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 
179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 
180 aa  234  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0859  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 
185 aa  234  6e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246885  hitchhiker  0.001984 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0779  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 
183 aa  233  8e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000663663  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 
192 aa  233  8e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  60.8 
 
 
180 aa  233  9e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  60.11 
 
 
179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  61.58 
 
 
185 aa  233  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 
180 aa  232  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0509  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 
180 aa  231  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0543565  hitchhiker  0.000000000388642 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0339  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 
180 aa  231  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  59.89 
 
 
181 aa  232  3e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  58.99 
 
 
180 aa  231  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  58.99 
 
 
180 aa  231  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 
180 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  61.71 
 
 
186 aa  231  4.0000000000000004e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  58.99 
 
 
180 aa  231  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 
179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0417  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 
179 aa  231  5e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000918773  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  55.62 
 
 
179 aa  231  6e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3305  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 
180 aa  231  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000419375  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  60.45 
 
 
191 aa  230  7.000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 
179 aa  230  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 
179 aa  230  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 
179 aa  230  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 
179 aa  230  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0193  50S ribosomal protein L5  59.22 
 
 
194 aa  230  9e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.368513  normal  0.701941 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1967  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 
179 aa  230  9e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0393  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 
179 aa  230  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00978346  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2938  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 
180 aa  229  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000312511  hitchhiker  0.000000922003 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  60.11 
 
 
179 aa  229  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 
179 aa  229  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 
179 aa  229  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0385  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 
179 aa  230  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000000334346  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 
179 aa  229  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3285  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 
180 aa  229  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000500711  hitchhiker  0.00000237864 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19911  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 
179 aa  228  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  58.99 
 
 
179 aa  229  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  58.99 
 
 
179 aa  228  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1855  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 
179 aa  228  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215848  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5058  ribosomal protein L5  61.93 
 
 
179 aa  229  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0491308  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 
179 aa  229  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1117  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 
179 aa  228  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1839  50S ribosomal protein L5  58.99 
 
 
195 aa  228  3e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314483  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0613  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 
179 aa  228  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554021  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  57.3 
 
 
179 aa  228  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 
193 aa  228  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2284  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 
196 aa  228  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000542096  hitchhiker  0.00336631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>