More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl058 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B5671  excinuclease ABC subunit B  56.72 
 
 
658 aa  667    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0441  excinuclease ABC subunit B  52.85 
 
 
668 aa  643    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3262  excinuclease ABC subunit B  50.49 
 
 
664 aa  637    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0981  excinuclease ABC, B subunit  52.3 
 
 
707 aa  644    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.14704  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1052  excinuclease ABC subunit B  54.87 
 
 
661 aa  672    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0552725  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0426  excinuclease ABC subunit B  57.42 
 
 
661 aa  686    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3175  excinuclease ABC subunit B  57.21 
 
 
658 aa  700    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5272  excinuclease ABC subunit B  56.72 
 
 
658 aa  669    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5286  excinuclease ABC subunit B  56.72 
 
 
658 aa  667    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1464  excinuclease ABC subunit B  52.2 
 
 
663 aa  645    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0799  excinuclease ABC subunit B  57.42 
 
 
661 aa  682    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5016  excinuclease ABC subunit B  56.72 
 
 
658 aa  672    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4845  excinuclease ABC subunit B  56.72 
 
 
658 aa  672    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl058  excinuclease ABC subunit B  100 
 
 
615 aa  1264    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4860  excinuclease ABC subunit B  56.56 
 
 
658 aa  669    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0047  excinuclease ABC, B subunit  53.26 
 
 
687 aa  667    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63144  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0418  excinuclease ABC subunit B  52.52 
 
 
664 aa  647    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5213  excinuclease ABC subunit B  51.21 
 
 
665 aa  639    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.100311  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4967  excinuclease ABC subunit B  52.45 
 
 
698 aa  641    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0410  excinuclease ABC, B subunit  55.48 
 
 
663 aa  660    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.662388  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4680  excinuclease ABC subunit B  52.92 
 
 
665 aa  650    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3669  excinuclease ABC subunit B  52.6 
 
 
667 aa  642    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3957  excinuclease ABC subunit B  52.45 
 
 
674 aa  637    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000186158  hitchhiker  0.0000000163265 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3705  excinuclease ABC subunit B  52.37 
 
 
670 aa  640    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3723  excinuclease ABC subunit B  52.6 
 
 
667 aa  642    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.22049  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0383  excinuclease ABC subunit B  54.06 
 
 
690 aa  671    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.629136  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3219  excinuclease ABC subunit B  51.14 
 
 
665 aa  635    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0533109  hitchhiker  0.000839421 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0309  excinuclease ABC subunit B  54.31 
 
 
660 aa  651    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00254602  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0135  excinuclease ABC subunit B  52.27 
 
 
666 aa  646    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5396  excinuclease ABC subunit B  56.72 
 
 
658 aa  672    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4735  excinuclease ABC subunit B  55.02 
 
 
683 aa  664    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0563  excinuclease ABC subunit B  51.46 
 
 
666 aa  639    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.733421  normal  0.043063 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0773  excinuclease ABC subunit B  72.06 
 
 
665 aa  913    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0247007  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0251  excinuclease ABC subunit B  54.4 
 
 
663 aa  653    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2037  Excinuclease ABC subunit B  53.26 
 
 
658 aa  641    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000674762 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2064  excinuclease ABC subunit B  50.81 
 
 
672 aa  639    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0943348  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1753  excinuclease ABC subunit B  50.81 
 
 
666 aa  637    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3710  excinuclease ABC subunit B  58.03 
 
 
658 aa  682    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.343081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3066  excinuclease ABC subunit B  54.26 
 
 
672 aa  657    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000537997  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02727  excinuclease ABC subunit B  52.61 
 
 
671 aa  657    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5329  excinuclease ABC subunit B  56.72 
 
 
658 aa  667    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2992  excinuclease ABC subunit B  58.92 
 
 
659 aa  698    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000124238  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0291  excinuclease ABC subunit B  50.65 
 
 
664 aa  635    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00669418  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16230  excinuclease ABC, B subunit  54.01 
 
 
672 aa  644    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2021  excinuclease ABC subunit B  53.48 
 
 
625 aa  645    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39565  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0782  excinuclease ABC subunit B  57.42 
 
 
661 aa  682    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.24339  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5252  excinuclease ABC subunit B  56.72 
 
 
658 aa  672    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4959  excinuclease ABC subunit B  56.23 
 
 
658 aa  667    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2061  excinuclease ABC subunit B  51.46 
 
 
673 aa  640    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000836148  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1914  excinuclease ABC subunit B  51.78 
 
 
673 aa  642    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00112158  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3530  excinuclease ABC subunit B  53.83 
 
 
670 aa  646    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.220409  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0583  excinuclease ABC subunit B  51.56 
 
 
692 aa  660    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0372  excinuclease ABC subunit B  53.53 
 
 
673 aa  662    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1318  excinuclease ABC subunit B  52.42 
 
 
671 aa  649    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000791691  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0392  excinuclease ABC subunit B  53.67 
 
 
669 aa  666    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1457  excinuclease ABC subunit B  52.95 
 
 
668 aa  660    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.174778  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2166  excinuclease ABC subunit B  50.89 
 
 
673 aa  637    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000274119  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1280  excinuclease ABC, B subunit  54.58 
 
 
658 aa  646    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1416  excinuclease ABC subunit B  53.59 
 
 
664 aa  641    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_383  excinuclease ABC, B subunit  52.85 
 
 
668 aa  640    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2506  excinuclease ABC subunit B  50.97 
 
 
673 aa  633  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2963  excinuclease ABC subunit B  50.32 
 
 
669 aa  632  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000919416  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1407  excinuclease ABC, B subunit  53.64 
 
 
656 aa  634  1e-180  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1033  excinuclease ABC subunit B  49.92 
 
 
685 aa  634  1e-180  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.568445  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0259  excinuclease ABC subunit B  50.81 
 
 
662 aa  631  1e-179  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000897839  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0080  excinuclease ABC subunit B  49.84 
 
 
702 aa  628  1e-179  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.935466  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0150  excinuclease ABC subunit B  51.48 
 
 
662 aa  628  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00713104  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1890  excinuclease ABC subunit B  50 
 
 
676 aa  629  1e-179  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.570377  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2678  excinuclease ABC subunit B  50.72 
 
 
677 aa  629  1e-179  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.292307 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1852  excinuclease ABC subunit B  51.14 
 
 
668 aa  630  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1426  excinuclease ABC subunit B  50.97 
 
 
678 aa  630  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1828  excinuclease ABC subunit B  50.9 
 
 
672 aa  629  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00277406  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2271  excinuclease ABC subunit B  51.14 
 
 
668 aa  628  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000100123  normal  0.665936 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21171  excinuclease ABC subunit B  49.68 
 
 
678 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0293  excinuclease ABC subunit B  51.8 
 
 
674 aa  626  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2046  excinuclease ABC subunit B  50.33 
 
 
675 aa  628  1e-178  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2257  excinuclease ABC subunit B  51.14 
 
 
668 aa  628  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000590019  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2159  excinuclease ABC subunit B  51.14 
 
 
668 aa  627  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000173586  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3444  excinuclease ABC subunit B  50.41 
 
 
665 aa  626  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00237393  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2113  excinuclease ABC subunit B  51.14 
 
 
668 aa  628  1e-178  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000859502  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0941  excinuclease ABC subunit B  49.35 
 
 
696 aa  626  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0936229 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0799  excinuclease ABC subunit B  50.41 
 
 
665 aa  627  1e-178  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.298665  normal  0.975396 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0134  excinuclease ABC subunit B  51.32 
 
 
662 aa  626  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2170  excinuclease ABC subunit B  51.79 
 
 
663 aa  625  1e-178  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4543  excinuclease ABC subunit B  51.14 
 
 
668 aa  628  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1825  excinuclease ABC, B subunit  52.27 
 
 
681 aa  623  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0508947  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2554  excinuclease ABC subunit B  50.08 
 
 
671 aa  624  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00351574  normal  0.0265518 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1247  excinuclease ABC subunit B  49.52 
 
 
678 aa  623  1e-177  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.118971  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05320  Excinuclease ABC subunit B  52.04 
 
 
708 aa  622  1e-177  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1509  excinuclease ABC subunit B  49.92 
 
 
670 aa  622  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00045733  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1442  excinuclease ABC subunit B  51.46 
 
 
665 aa  623  1e-177  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1759  excinuclease ABC subunit B  50.81 
 
 
674 aa  623  1e-177  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2351  excinuclease ABC subunit B  50.08 
 
 
667 aa  622  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00949955  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2516  excinuclease ABC, B subunit  50.97 
 
 
716 aa  622  1e-177  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0251  excinuclease ABC subunit B  52.59 
 
 
665 aa  622  1e-177  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00546906  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0884  excinuclease ABC, B subunit  53.1 
 
 
662 aa  623  1e-177  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1413  excinuclease ABC subunit B  52.2 
 
 
660 aa  622  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000981349  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19950  Excinuclease ABC subunit B  52.44 
 
 
698 aa  622  1e-177  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0946  excinuclease ABC, B subunit  49.54 
 
 
746 aa  622  1e-177  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1242  excinuclease ABC, B subunit  50.65 
 
 
677 aa  622  1e-177  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>