26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl016 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl016  putrescine/ornithine APC transporter  100 
 
 
537 aa  1063    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl664  putrescine/ornithine APC transporter  38.01 
 
 
577 aa  351  2e-95  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0811  hypothetical protein  38.58 
 
 
515 aa  296  7e-79  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf753  amino acid permease  26.06 
 
 
561 aa  65.5  0.000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  26.53 
 
 
443 aa  60.5  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3314  amino acid permease-associated region  26.36 
 
 
442 aa  58.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00103412  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0128  amino acid permease-associated region  25.08 
 
 
443 aa  56.6  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000357804  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  23.1 
 
 
453 aa  55.1  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2592  amino acid permease-associated region  25.51 
 
 
452 aa  55.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000351303  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  24 
 
 
437 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  28.38 
 
 
440 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  28.38 
 
 
440 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  23.64 
 
 
438 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  23.64 
 
 
437 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  23.64 
 
 
438 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  23.64 
 
 
438 aa  48.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  23.64 
 
 
437 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  23.64 
 
 
438 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  23.64 
 
 
438 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0924  amino acid permease-associated region  24.05 
 
 
449 aa  47.8  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.200497  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  23.64 
 
 
438 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  25.71 
 
 
435 aa  46.6  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  22.22 
 
 
489 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  22.16 
 
 
485 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0683  amino acid transporter protein  26.12 
 
 
529 aa  43.5  0.009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1589  amino acid permease, putative  22.01 
 
 
450 aa  43.5  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000140221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>