More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl001 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl001  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 
443 aa  872    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0001  chromosomal replication initiation protein  48.97 
 
 
450 aa  398  1e-109  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.14003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.99 
 
 
469 aa  215  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280164  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3008  chromosomal replication initiation protein  36.97 
 
 
471 aa  213  7e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  34.44 
 
 
524 aa  212  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3373  chromosomal replication initiation protein  36.5 
 
 
460 aa  211  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.63 
 
 
503 aa  208  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0001  chromosomal replication initiation protein  35.61 
 
 
477 aa  207  3e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0001  chromosomal replication initiation protein  36.2 
 
 
491 aa  207  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.96301  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.51 
 
 
516 aa  206  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000003522  unclonable  0.00000000000722922 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0001  chromosomal replication initiation protein  33.18 
 
 
453 aa  203  4e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.817172  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.83 
 
 
461 aa  203  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.86 
 
 
469 aa  202  8e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000259143  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0001  chromosomal replication initiation protein  34.89 
 
 
490 aa  202  8e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  33.64 
 
 
463 aa  202  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.72 
 
 
453 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  33.64 
 
 
466 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  33.64 
 
 
466 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2133  chromosomal replication initiation protein  34.88 
 
 
489 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000845727  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.64 
 
 
483 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  33.64 
 
 
466 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  31.87 
 
 
442 aa  202  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  33.64 
 
 
466 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 
467 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.46 
 
 
456 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  33.64 
 
 
466 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 
467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.33 
 
 
467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 
467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.33 
 
 
462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  28.67 
 
 
441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 
462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  33.33 
 
 
467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 
467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 
467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 
462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 
467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  33.96 
 
 
465 aa  201  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.33 
 
 
464 aa  201  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0001  chromosomal replication initiation protein  36.5 
 
 
492 aa  200  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.983579  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 
450 aa  201  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000634969  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 
465 aa  201  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.5 
 
 
443 aa  201  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00010  chromosomal replication initiation protein  34.58 
 
 
478 aa  200  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499294  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  27.79 
 
 
451 aa  200  5e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  27.79 
 
 
451 aa  200  5e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 
467 aa  199  7.999999999999999e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0001  chromosomal replication initiation protein  34.07 
 
 
492 aa  199  7.999999999999999e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.943807  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  29.04 
 
 
451 aa  199  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  30.5 
 
 
453 aa  199  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  30.5 
 
 
453 aa  199  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0001  chromosomal replication initiation protein  34.59 
 
 
494 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0001  chromosomal replication initiation protein  31.47 
 
 
454 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0001  chromosomal replication initiation protein  32.59 
 
 
507 aa  197  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366311  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  27.79 
 
 
450 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.92 
 
 
463 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  29.15 
 
 
462 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.02 
 
 
470 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000133107  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.75 
 
 
447 aa  196  7e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0001  chromosomal replication initiation protein  33.63 
 
 
436 aa  196  7e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.76217  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0001  chromosomal replication initiation protein  34.48 
 
 
511 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0001  chromosomal replication initiation protein  34.72 
 
 
487 aa  196  8.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605191  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.48 
 
 
511 aa  196  9e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.1 
 
 
480 aa  195  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0206444  normal  0.0774659 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  33.94 
 
 
468 aa  196  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000552796  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  32.74 
 
 
443 aa  195  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  31.98 
 
 
450 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0001  chromosomal replication initiation protein  31.4 
 
 
477 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.839498  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0001  chromosomal replication initiation protein  33.96 
 
 
512 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.97 
 
 
449 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  26.16 
 
 
454 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00010  chromosomal replication initiation protein  33.96 
 
 
514 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373198  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  31.45 
 
 
450 aa  194  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  31.64 
 
 
449 aa  194  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.53 
 
 
441 aa  194  3e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00105638  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0009  chromosomal replication initiation protein  34.8 
 
 
468 aa  193  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00184157  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0001  chromosomal replication initiation protein  33.82 
 
 
482 aa  193  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0001  chromosomal replication initiation protein  34.28 
 
 
511 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.424003  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.57 
 
 
453 aa  193  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3606  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.42 
 
 
476 aa  193  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  33.64 
 
 
472 aa  193  5e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0010  chromosomal replication initiation protein  33.86 
 
 
506 aa  193  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645293  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  33.14 
 
 
449 aa  193  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0001  chromosomal replication initiation protein  33.86 
 
 
505 aa  193  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390724  normal  0.0464489 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3182  chromosomal replication initiation protein  33.23 
 
 
525 aa  193  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.143434  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  33.64 
 
 
468 aa  193  6e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.33 
 
 
474 aa  193  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00208216  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0003  chromosomal replication initiation protein  33.96 
 
 
510 aa  193  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  33.44 
 
 
462 aa  193  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.13 
 
 
481 aa  192  7e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168448  unclonable  0.00000204804 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  34.32 
 
 
443 aa  192  7e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3239  chromosomal replication initiation protein  33.23 
 
 
536 aa  192  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457996  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0001  chromosomal replication initiation protein  34.12 
 
 
491 aa  192  8e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0001  chromosomal replication initiation protein  31.86 
 
 
524 aa  192  8e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57647  hitchhiker  0.0000195718 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0001  chromosomal replication initiation protein  32.83 
 
 
465 aa  192  9e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000010295  decreased coverage  0.002869 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1938  chromosomal replication initiation protein  35.57 
 
 
473 aa  192  9e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.13 
 
 
481 aa  192  9e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000310067  unclonable  0.000054574 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0001  chromosomal replication initiation protein  33.23 
 
 
525 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0001  chromosomal replication initiation protein  33.23 
 
 
525 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.54964 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2833  chromosomal replication initiation protein  30.79 
 
 
448 aa  192  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>