210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4887 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_4887  ADP-ribosylation/crystallin J1  100 
 
 
508 aa  1028    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0259  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  55.33 
 
 
490 aa  540  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0422  ADP-ribosylation/crystallin J1  54.1 
 
 
505 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4684  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  48.68 
 
 
314 aa  277  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00715956 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1073  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  50 
 
 
355 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4977  ADP-ribosylglycohydrolase  51.37 
 
 
336 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0165  ADP-ribosylation/Crystallin J1  46.64 
 
 
306 aa  270  5.9999999999999995e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.697838  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4610  ADP-ribosylation/crystallin J1  48.31 
 
 
304 aa  268  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.383385  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2490  ADP-ribosylation/Crystallin J1  44.82 
 
 
311 aa  264  3e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.360174  normal  0.126045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3893  ADP-ribosylation/crystallin J1  46.13 
 
 
306 aa  264  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5762  ADP-ribosylation/crystallin J1  47.83 
 
 
322 aa  263  6e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000610186 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6286  ADP-ribosylation/Crystallin J1  48.63 
 
 
301 aa  259  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000874505  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3018  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  46.9 
 
 
366 aa  259  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1562  ADP-ribosylglycohydrolase-like  46.62 
 
 
298 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000180951  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2513  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  44.3 
 
 
371 aa  253  7e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.836174  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0057  ADP-ribosylation/crystallin J1  44.85 
 
 
305 aa  249  7e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2761  ADP-ribosylation/crystallin J1  46.21 
 
 
371 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79492  normal  0.771767 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1119  ADP-ribosylation/crystallin J1  48.01 
 
 
307 aa  243  7e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2477  ADP-ribosylation/crystallin J1  40.46 
 
 
1138 aa  240  5e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.462272 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2362  ADP-ribosylation/crystallin J1  40.8 
 
 
331 aa  232  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00145614  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01599  dinitrogenase reductase activationg glycohydrolase  45.71 
 
 
286 aa  229  9e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.87176  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2268  ADP-ribosylation/crystallin J1  38.95 
 
 
329 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415258  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03415  ADP-ribosylglycohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G01570)  38.99 
 
 
329 aa  194  4e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00015397  normal  0.493778 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4768  dual specificity protein phosphatase  57.22 
 
 
185 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3200  hypothetical protein  55.31 
 
 
188 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0325  ADP-ribosylation/crystallin J1  37.91 
 
 
320 aa  171  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00576959  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1966  dual specificity protein phosphatase  45.74 
 
 
197 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3101  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  40.79 
 
 
260 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.5852 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2793  dual specificity protein phosphatase  50.87 
 
 
209 aa  162  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000240019 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3565  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  33.55 
 
 
330 aa  158  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5053  ADP-ribosylation/crystallin J1  32.89 
 
 
313 aa  156  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.962607  normal  0.612081 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3202  hypothetical protein  37.28 
 
 
294 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0746  ADP-ribosylation/crystallin J1  29.45 
 
 
312 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2658  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  35.49 
 
 
296 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1410  dual specificity protein phosphatase  50.88 
 
 
182 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.719702  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4025  ADP-ribosylation/Crystallin J1  30.29 
 
 
386 aa  149  9e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11130  ADP-ribosylglycohydrolase  35 
 
 
274 aa  148  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.11058 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1447  ADP-ribosylation/crystallin J1  34.81 
 
 
326 aa  146  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4406  ADP-ribosylation/Crystallin J1  41.03 
 
 
463 aa  146  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0255559  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0076  ADP-ribosylation/Crystallin J1  33.97 
 
 
309 aa  143  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0680  ADP-ribosylation/crystallin J1  32.62 
 
 
300 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.782258  normal  0.702569 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1446  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  33.55 
 
 
329 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00190171  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1008  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  33.91 
 
 
294 aa  139  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.861843  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1210  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  33.22 
 
 
317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0331208 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0877  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  32.87 
 
 
295 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2408  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  34.48 
 
 
297 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.194034  normal  0.0934858 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2793  ADP-ribosylation/Crystallin J1  30.97 
 
 
308 aa  134  5e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0338  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  30.9 
 
 
309 aa  133  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3462  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  32.28 
 
 
301 aa  130  7.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0420  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  29.43 
 
 
301 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156753  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6466  ADP-ribosylation/Crystallin J1  30.91 
 
 
368 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1243  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  32.7 
 
 
462 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.555691 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1525  ADP-ribosyl-[dinitrogen reductase] hydrolase  32.7 
 
 
462 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3043  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  35.25 
 
 
298 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1208  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  30.27 
 
 
343 aa  125  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0350047  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2136  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  32.62 
 
 
301 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000382928 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0024  ADP-ribosylation/Crystallin J1  32.04 
 
 
312 aa  124  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0739  ADP-ribosylation/Crystallin J1  27.6 
 
 
308 aa  123  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3689  ADP-ribosylation/Crystallin J1  38.24 
 
 
467 aa  123  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0849  ADP-ribosylation/crystallin J1  36.31 
 
 
701 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495566  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2800  dinitrogenase reductase activating glycohydrolase  28.99 
 
 
309 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0622873  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2093  ADP-ribosylglycohydrolase  30.26 
 
 
307 aa  120  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1731  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  32.58 
 
 
308 aa  120  7e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0831  ADP-ribosylation/crystallin J1  35.67 
 
 
698 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0849  ADP-ribosylation/crystallin J1  35.67 
 
 
698 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2082  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  31.43 
 
 
301 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  43.26 
 
 
179 aa  115  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3959  dual specificity protein phosphatase  44.44 
 
 
197 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0383  ADP-ribosylation/Crystallin J1  33.77 
 
 
338 aa  115  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0950  ADP-ribosylation/Crystallin J1  29.39 
 
 
295 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1100  ADP-ribosylation/crystallin J1  34.3 
 
 
483 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3365  ADP-ribosylation/Crystallin J1  30.32 
 
 
308 aa  106  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  hitchhiker  0.000474604 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5181  ADP-ribosylation/crystallin J1  33.75 
 
 
318 aa  106  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0763  ADP-ribosylation/Crystallin J1  28.97 
 
 
273 aa  105  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5360  ADP-ribosylation/Crystallin J1  27.27 
 
 
632 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.277365 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2379  ADP-ribosylation/Crystallin J1  33 
 
 
469 aa  103  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000403878  hitchhiker  0.00126048 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  37.91 
 
 
189 aa  103  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1119  ADP-ribosylation/crystallin J1  32.42 
 
 
308 aa  101  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.600884  normal  0.12634 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1495  ADP-ribosylation/crystallin J1  22.73 
 
 
302 aa  101  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.944205  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0983  ADP-ribosylation/crystallin J1  23.39 
 
 
302 aa  100  7e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3034  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  32.73 
 
 
306 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1926  phosphatase family protein, putative  38.04 
 
 
167 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  34.84 
 
 
438 aa  96.7  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1579  dual specificity protein phosphatase  38.31 
 
 
155 aa  96.3  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1645  ADP-ribosylation/crystallin J1  22.03 
 
 
302 aa  95.1  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.932283  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3713  putative phosphatase  33.33 
 
 
170 aa  93.6  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.207477  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0035  ADP-ribosylation/Crystallin J1  33.33 
 
 
320 aa  93.6  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.378473  normal  0.263925 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3638  phosphatase  30.59 
 
 
168 aa  92.8  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0269  ADP-ribosylation/crystallin J1  22.03 
 
 
302 aa  92.4  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16086  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1670  ADP-ribosylation/Crystallin J1  25.7 
 
 
315 aa  92  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.820356  normal  0.114795 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1306  beta-lactamase domain-containing protein  26.97 
 
 
279 aa  90.9  5e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0488  ADP-ribosylation/crystallin J1  30.09 
 
 
319 aa  89.7  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.711054  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1105  ADP-ribosylation/crystallin J1  31.21 
 
 
484 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0588  putative phosphatase  34.3 
 
 
165 aa  89  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1521  dual specificity protein phosphatase  33.74 
 
 
166 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.454288  normal  0.906405 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1958  ADP-ribosylation/crystallin J1  29.12 
 
 
270 aa  87.4  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.667193  normal  0.919157 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4021  dual specificity protein phosphatase  47.01 
 
 
121 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.427109 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0825  putative ribosylglycohydrolase  25.78 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.435184  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0289  ADP-ribosylglycohydrolase  25.46 
 
 
347 aa  80.5  0.00000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0836  ADP-ribosylation/Crystallin J1  26.26 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>