More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4752 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  100 
 
 		 259 aa  512  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  96.53 
 
 		 259 aa  477  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  87.64 
 
 		 259 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0249  Methyltransferase type 11  61.75 
 
 		 260 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220437  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  54.15 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  56.85 
 
 		 254 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  55.73 
 
 		 258 aa  263  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  53.2 
 
 		 250 aa  262  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.42 
 
 		 256 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  55.42 
 
 		 254 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  56.43 
 
 		 254 aa  261  6e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0336  methyltransferase type 11  57.6 
 
 		 261 aa  261  6.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.549644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.02 
 
 		 256 aa  261  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  50.59 
 
 		 257 aa  260  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5564  methyltransferase type 11  61.2 
 
 		 258 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.02 
 
 		 256 aa  260  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  54.62 
 
 		 254 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  52.16 
 
 		 255 aa  257  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  51.21 
 
 		 256 aa  256  4e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  53.75 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  53.2 
 
 		 250 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2729  SAM-dependent methyltransferase  52.61 
 
 		 264 aa  251  8.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  55.14 
 
 		 256 aa  249  4e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  49.6 
 
 		 256 aa  246  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  53.82 
 
 		 250 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  53.47 
 
 		 253 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  51.61 
 
 		 256 aa  244  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  51.61 
 
 		 256 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  51.21 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  51.21 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3440  Methyltransferase type 11  49.01 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2361  methyltransferase type 11  58.87 
 
 		 254 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  51.21 
 
 		 256 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  53.01 
 
 		 250 aa  240  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  53.33 
 
 		 254 aa  240  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  52.21 
 
 		 250 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3930  Methyltransferase type 11  55.19 
 
 		 250 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.56855 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  53.33 
 
 		 254 aa  240  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4043  Methyltransferase type 11  55.19 
 
 		 250 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  51.81 
 
 		 250 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  51.21 
 
 		 256 aa  237  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  51.81 
 
 		 250 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  51.81 
 
 		 250 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.19 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  51 
 
 		 250 aa  232  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  49.2 
 
 		 261 aa  230  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  50.2 
 
 		 250 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.8 
 
 		 251 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.8 
 
 		 251 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0587  UbiE/COQ5 methyltransferase  50.79 
 
 		 261 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846793  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52 
 
 		 251 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52 
 
 		 251 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52 
 
 		 251 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52 
 
 		 251 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  51.79 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00203  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  50.75 
 
 		 207 aa  202  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00208  hypothetical protein  50.75 
 
 		 207 aa  202  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3398  Methyltransferase type 11  50.25 
 
 		 207 aa  202  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3455  methyltransferase type 11  50.25 
 
 		 207 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.915003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0206  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  50.25 
 
 		 207 aa  199  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3145  hypothetical protein  48.02 
 
 		 204 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.725921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3296  hypothetical protein  48.02 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.114197  normal  0.0687983 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23770  putative biotin synthesis protein  53.85 
 
 		 187 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0761957 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3284  methyltransferase type 11  52.1 
 
 		 173 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.859694  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1066  putative methyltransferase  35.51 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000495873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2339  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.91 
 
 		 261 aa  142  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260847 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  30.13 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.49 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2697  methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.13 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  30.13 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.13 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.71 
 
 		 261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.71 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.71 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0301  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.56 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  35.5 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3752  Methyltransferase type 11  34.64 
 
 		 259 aa  88.6  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.51014  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.26 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.85 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  31.87 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 327 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  31.61 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1836  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  31.45 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  32.29 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6077  Methyltransferase type 11  39.13 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.28 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.84 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  28.57 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  37.32 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  37.82 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  39.42 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  38.94 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.17 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  34.25 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  40.16 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3376  Methyltransferase type 11  38.69 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0407493  hitchhiker  0.00438973 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  45.36 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.14 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>