30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4748 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4748  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  741    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00502344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5215  hypothetical protein  98.36 
 
 		 366 aa  728    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.16684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5290  hypothetical protein  81.94 
 
 		 366 aa  541  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.166591  normal  0.774539 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5568  hypothetical protein  61.89 
 
 		 357 aa  352  7e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0456  hypothetical protein  58.41 
 
 		 368 aa  334  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.903333  normal  0.0155871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1641  hypothetical protein  57.67 
 
 		 344 aa  325  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0531921  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3675  hypothetical protein  33.67 
 
 		 433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00960143  normal  0.0655925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2206  hypothetical protein  29.44 
 
 		 389 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4721  hypothetical protein  30.11 
 
 		 411 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431186 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2063  hypothetical protein  28.2 
 
 		 381 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.80257  normal  0.561686 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3376  hypothetical protein  28.29 
 
 		 383 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0915509 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2084  hypothetical protein  25.08 
 
 		 399 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.413022 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0132  hypothetical protein  30.65 
 
 		 370 aa  99.8  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1486  hypothetical protein  25 
 
 		 370 aa  97.8  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2007  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1226  hypothetical protein  24.35 
 
 		 363 aa  96.7  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3496  hypothetical protein  27.1 
 
 		 392 aa  90.5  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1561  putative signal peptide protein  27.34 
 
 		 377 aa  69.3  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385818  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0954  hypothetical protein  40.66 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5206  hypothetical protein  34.64 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1392  hypothetical protein  29.86 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4024  hypothetical protein  32.12 
 
 		 226 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70749  normal  0.220156 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1372  hypothetical protein  30.22 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.425718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4700  hypothetical protein  34.21 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574193  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3483  hypothetical protein  26.44 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.765061 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1888  hypothetical protein  32.52 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0846  hypothetical protein  35.59 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4859  hypothetical protein  36.67 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6994  hypothetical protein  31.97 
 
 		 218 aa  57  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7361  hypothetical protein  38.75 
 
 		 277 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2729  hypothetical protein  32.67 
 
 		 316 aa  43.5  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0839286 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>