More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4645 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  95.85 
 
 		 337 aa  654    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  100 
 
 		 337 aa  676    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 337 aa  676    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  78.34 
 
 		 337 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  75 
 
 		 331 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  73.21 
 
 		 331 aa  482  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  60.9 
 
 		 335 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  59.82 
 
 		 333 aa  394  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  59.52 
 
 		 333 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  60.06 
 
 		 333 aa  379  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  57.61 
 
 		 333 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  54.93 
 
 		 333 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  57.7 
 
 		 333 aa  363  3e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  56.12 
 
 		 333 aa  359  4e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  57.01 
 
 		 333 aa  359  4e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  56.12 
 
 		 333 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  53.12 
 
 		 330 aa  352  4e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  56.07 
 
 		 328 aa  351  1e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  54.13 
 
 		 337 aa  342  4e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  51.5 
 
 		 330 aa  342  5.999999999999999e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  51.5 
 
 		 330 aa  342  5.999999999999999e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  50.45 
 
 		 331 aa  334  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  49.85 
 
 		 330 aa  333  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  50.45 
 
 		 330 aa  332  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  51.81 
 
 		 330 aa  332  7.000000000000001e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  50.75 
 
 		 330 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  52.41 
 
 		 407 aa  326  3e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  49.55 
 
 		 338 aa  311  9e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  47.88 
 
 		 342 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  44.41 
 
 		 335 aa  300  3e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  49.23 
 
 		 332 aa  299  5e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  48.82 
 
 		 329 aa  298  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  50.76 
 
 		 338 aa  295  9e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  43.5 
 
 		 335 aa  294  1e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  49.85 
 
 		 337 aa  293  2e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  42.77 
 
 		 348 aa  293  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  49.7 
 
 		 331 aa  287  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  46.5 
 
 		 338 aa  278  9e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  45.4 
 
 		 330 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  45.4 
 
 		 330 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  48.62 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  46.59 
 
 		 330 aa  263  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  38.55 
 
 		 338 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  38.91 
 
 		 334 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  39.09 
 
 		 333 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  39.39 
 
 		 333 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  43.02 
 
 		 331 aa  243  3e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  40.47 
 
 		 330 aa  238  8e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  42.43 
 
 		 335 aa  225  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  42.41 
 
 		 333 aa  219  6e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  41.02 
 
 		 333 aa  209  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  35.78 
 
 		 328 aa  189  4e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  35.62 
 
 		 330 aa  189  9e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  34.57 
 
 		 336 aa  182  8.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  35.4 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  35.56 
 
 		 327 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  35.24 
 
 		 327 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  34.07 
 
 		 328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  36.22 
 
 		 360 aa  159  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  33.74 
 
 		 370 aa  153  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  34.05 
 
 		 334 aa  142  7e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  34.6 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  28.66 
 
 		 341 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  28.66 
 
 		 339 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  28.57 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  31.56 
 
 		 317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  34.07 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  33.83 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  30.41 
 
 		 303 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  34.78 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  34.42 
 
 		 300 aa  97.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  33.94 
 
 		 288 aa  97.1  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  31.71 
 
 		 273 aa  95.1  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  31.52 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  31.64 
 
 		 304 aa  89  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  29.62 
 
 		 309 aa  87  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  30.69 
 
 		 297 aa  87  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  29.48 
 
 		 321 aa  86.7  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  31.69 
 
 		 298 aa  86.3  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  34.73 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  31.1 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  28.32 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  32.6 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  33.2 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  34.08 
 
 		 305 aa  82.4  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  31.45 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  32.91 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  30.63 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  29.04 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  27.87 
 
 		 645 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  27.22 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  25.65 
 
 		 644 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  32.72 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  32.72 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  25.65 
 
 		 644 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  29.2 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  28.62 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  28.32 
 
 		 304 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  28.83 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  30.86 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>