More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4622 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
391 aa  774  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  97.95 
 
 
390 aa  725  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  75.07 
 
 
393 aa  526  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  44.3 
 
 
384 aa  314  2e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  45.43 
 
 
392 aa  298  1e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  42.09 
 
 
391 aa  285  1e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  44.02 
 
 
404 aa  275  1e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  39.49 
 
 
394 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  39.12 
 
 
410 aa  258  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  37.76 
 
 
401 aa  258  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  37.6 
 
 
392 aa  221  1e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 
403 aa  194  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
403 aa  189  5e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 
404 aa  188  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  30.2 
 
 
401 aa  185  1e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6389  glycosyl transferase group 1  34.08 
 
 
387 aa  183  5e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  38.15 
 
 
403 aa  182  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4490  glycosyl transferase, group 1  37.01 
 
 
398 aa  178  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 
445 aa  176  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5004  glycosyl transferase group 1  35.93 
 
 
435 aa  174  3e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  3.72843e-05 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  32.59 
 
 
409 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
414 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 
426 aa  159  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 
415 aa  150  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
405 aa  150  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
415 aa  147  2e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1077  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 
402 aa  147  3e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  1.45174e-05 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1203  glycosyl transferase, group 1  33.94 
 
 
386 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359152  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  26.91 
 
 
401 aa  135  1e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  35.43 
 
 
418 aa  135  2e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1095  glycosyl transferase group 1  33.86 
 
 
376 aa  134  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174275  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
405 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  30.96 
 
 
426 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3806  glycosyl transferase group 1  33.44 
 
 
428 aa  120  5e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773329  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0472  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 
424 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465878  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 
419 aa  117  4e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5224  glycosyl transferase group 1  34.53 
 
 
384 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 
413 aa  114  4e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  35.29 
 
 
413 aa  112  8e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  30.35 
 
 
539 aa  112  8e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4354  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 
421 aa  109  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2225  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 
423 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  32.44 
 
 
425 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  30.31 
 
 
425 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  32.17 
 
 
403 aa  106  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 
403 aa  106  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3216  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 
414 aa  106  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.573386  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  33.53 
 
 
353 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2183  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 
424 aa  104  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0575473  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2501  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
423 aa  102  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
440 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  34.76 
 
 
409 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  38.34 
 
 
350 aa  97.4  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
441 aa  97.1  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  39.41 
 
 
353 aa  97.1  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  48.32 
 
 
381 aa  96.3  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  37.18 
 
 
398 aa  96.3  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 
424 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 
401 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
447 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3101  glycosyl transferase group 1  38.34 
 
 
369 aa  92.8  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.542778 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13821  hypothetical protein  23.89 
 
 
442 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
414 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.89 
 
 
412 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  37.69 
 
 
346 aa  89.7  8e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0471  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 
422 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2182  glycosyl transferase group 1  34.22 
 
 
443 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.347756  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.8 
 
 
407 aa  88.6  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 
411 aa  87.8  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2500  glycosyl transferase group 1  31.64 
 
 
434 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0602967  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6431  glycosyl transferase group 1  34.35 
 
 
380 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  28.85 
 
 
426 aa  87  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  39.36 
 
 
414 aa  86.7  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2224  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 
434 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307523  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1720  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 
422 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.523158  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  35.48 
 
 
378 aa  85.9  1e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  35.47 
 
 
371 aa  85.5  1e-15  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  22.77 
 
 
778 aa  85.5  1e-15  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3557  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 
417 aa  85.1  2e-15  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  34.24 
 
 
406 aa  84.7  2e-15  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.27 
 
 
419 aa  85.1  2e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  27.73 
 
 
350 aa  84.3  3e-15  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 
452 aa  84.7  3e-15  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  33.6 
 
 
440 aa  83.6  5e-15  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  34.05 
 
 
414 aa  83.2  6e-15  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  36.72 
 
 
395 aa  83.2  7e-15  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 
373 aa  83.2  8e-15  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1445  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 
379 aa  82.8  9e-15  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  9.27133e-06 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4355  glycosyl transferase group 1  34.42 
 
 
420 aa  82.4  1e-14  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4705  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 
440 aa  82.8  1e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.625922 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  34.91 
 
 
377 aa  81.6  2e-14  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
360 aa  81.6  2e-14  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  34.91 
 
 
377 aa  81.3  2e-14  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  36.96 
 
 
373 aa  81.6  2e-14  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  36.81 
 
 
366 aa  80.9  3e-14  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  34.46 
 
 
394 aa  81.3  3e-14  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 
356 aa  80.5  4e-14  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
304 aa  80.5  5e-14  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  35.17 
 
 
395 aa  80.1  6e-14  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  34.13 
 
 
419 aa  80.1  6e-14  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>