290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4491 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2866  sulfite reductase  81.04 
 
 		 537 aa  878    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890512  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2298  sulfite reductase  87.83 
 
 		 534 aa  951    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253537  normal  0.965047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3748  sulfite reductase  78.7 
 
 		 540 aa  858    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5007  sulfite reductase  94.39 
 
 		 535 aa  1023    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.125173  normal  0.198772 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4491  sulfite reductase  100 
 
 		 534 aa  1095    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4954  sulfite reductase  99.63 
 
 		 534 aa  1090    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.526752  normal  0.219456 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4232  sulfite reductase  59.47 
 
 		 539 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1753  sulfite reductase  57.49 
 
 		 539 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274813  normal  0.0164644 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4136  sulfite reductase  57.17 
 
 		 535 aa  598  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2498  sulfite reductase  58.15 
 
 		 542 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1784  sulfite reductase  54.48 
 
 		 526 aa  568  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3056  FAD-binding domain protein  41.59 
 
 		 554 aa  403  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  43.11 
 
 		 1409 aa  303  5.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1738  FAD-binding domain-containing protein  46.13 
 
 		 659 aa  301  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0631  FAD-binding domain protein  44.68 
 
 		 376 aa  294  2e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.346009 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  44.62 
 
 		 1400 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0924  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  37.39 
 
 		 599 aa  290  6e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3066  sulfite reductase subunit alpha  37.39 
 
 		 599 aa  289  7e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.944096  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0948  sulfite reductase subunit alpha  37.39 
 
 		 599 aa  289  7e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.404353 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3790  FAD-binding domain-containing protein  42.52 
 
 		 388 aa  288  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.146822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  45.24 
 
 		 1401 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02609  sulfite reductase, alpha subunit, flavoprotein  37.17 
 
 		 599 aa  288  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02572  hypothetical protein  37.17 
 
 		 599 aa  288  2e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2904  sulfite reductase subunit alpha  36.68 
 
 		 599 aa  288  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3111  sulfite reductase subunit alpha  37.17 
 
 		 599 aa  288  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4018  sulfite reductase subunit alpha  37.17 
 
 		 599 aa  288  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.104123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2892  sulfite reductase subunit alpha  37.17 
 
 		 599 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  40.39 
 
 		 1407 aa  286  8e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3227  sulfite reductase subunit alpha  39.85 
 
 		 601 aa  284  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000595634  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  45.24 
 
 		 1403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  44.41 
 
 		 1427 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  44.41 
 
 		 1418 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  44.41 
 
 		 1418 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  44.41 
 
 		 1418 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  44.09 
 
 		 1397 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  44.41 
 
 		 1418 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  44.41 
 
 		 1418 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  44.41 
 
 		 1398 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  44.41 
 
 		 1418 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3159  sulfite reductase subunit alpha  36.24 
 
 		 599 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.534662 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  43.35 
 
 		 1397 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  43.09 
 
 		 1405 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3143  sulfite reductase subunit alpha  35.81 
 
 		 599 aa  280  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.49504  normal  0.285573 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3078  sulfite reductase subunit alpha  35.81 
 
 		 599 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282259  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3260  sulfite reductase subunit alpha  36.24 
 
 		 599 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.25406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2733  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  43.97 
 
 		 584 aa  278  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461724  hitchhiker  0.00000324313 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  42.55 
 
 		 1395 aa  277  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  40.1 
 
 		 600 aa  277  3e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3102  sulfite reductase subunit alpha  35.56 
 
 		 599 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3365  sulfite reductase subunit alpha  40.58 
 
 		 609 aa  276  6e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.834699  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  42.86 
 
 		 883 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  41.67 
 
 		 628 aa  275  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  43.09 
 
 		 1395 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  43.09 
 
 		 1395 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  43.09 
 
 		 1395 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2696  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  40.43 
 
 		 600 aa  272  9e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3527  sulfite reductase subunit alpha  39.79 
 
 		 609 aa  271  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400097  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4039  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  39.63 
 
 		 610 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  40.81 
 
 		 1383 aa  266  5e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  41.06 
 
 		 1384 aa  266  8e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  40.66 
 
 		 1342 aa  266  8.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  39.48 
 
 		 1257 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  38.6 
 
 		 607 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0682  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  40.79 
 
 		 613 aa  264  3e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  42.78 
 
 		 1396 aa  263  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  40.12 
 
 		 1338 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0810  sulfite reductase subunit alpha  39.69 
 
 		 599 aa  263  6e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1305  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  40.32 
 
 		 610 aa  263  6.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0827  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  39.27 
 
 		 607 aa  262  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03589  sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein)  38.5 
 
 		 608 aa  261  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0402  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  38.56 
 
 		 613 aa  261  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  38.41 
 
 		 614 aa  261  3e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  42.03 
 
 		 1357 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0590  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  40.68 
 
 		 613 aa  260  5.0000000000000005e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.257613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1770  molybdopterin oxidoreductase  42.36 
 
 		 1394 aa  258  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0309544  normal  0.0148137 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2194  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.38 
 
 		 595 aa  257  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002350  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  36.97 
 
 		 623 aa  257  4e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4759  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  37.29 
 
 		 612 aa  256  5e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00005  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein subunit alpha  37 
 
 		 631 aa  256  6e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3807  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  39.43 
 
 		 591 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0251884 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  43.31 
 
 		 1341 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0858  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  38.74 
 
 		 605 aa  253  7e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2236  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.75 
 
 		 595 aa  251  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680816  normal  0.170477 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2839  sulfite reductase subunit alpha  40.43 
 
 		 602 aa  251  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0932  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  38.61 
 
 		 599 aa  251  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.520918  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  41.54 
 
 		 1405 aa  250  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2512  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.02 
 
 		 595 aa  250  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.49097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3080  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  37.77 
 
 		 604 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  39.53 
 
 		 1232 aa  249  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0855  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  37.77 
 
 		 604 aa  248  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.111088  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2191  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  38.34 
 
 		 614 aa  247  3e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0944  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  37.14 
 
 		 599 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0919  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  37.14 
 
 		 599 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0953  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  37.66 
 
 		 599 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3442  sulfite reductase subunit alpha  39.42 
 
 		 600 aa  246  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0776  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  38.06 
 
 		 594 aa  246  9e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5483  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.58 
 
 		 589 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248188  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0975  sulfite reductase subunit alpha  39.42 
 
 		 600 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0892  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  37.37 
 
 		 604 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3311  sulfite reductase subunit alpha  38.29 
 
 		 612 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>