More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4471 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4935  Thiamine-phosphate diphosphorylase  99.59 
 
 
241 aa  454  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.539276  normal  0.373697 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4471  thiamine-phosphate diphosphorylase  100 
 
 
241 aa  456  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4985  Thiamine-phosphate diphosphorylase  91.32 
 
 
242 aa  362  3e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.399872  normal  0.177477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4969  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  75.45 
 
 
231 aa  311  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4940  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  73.21 
 
 
233 aa  279  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1959  thiamine-phosphate diphosphorylase  74.89 
 
 
248 aa  256  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155304  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3286  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.88 
 
 
211 aa  143  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450735  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2103  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.72 
 
 
219 aa  135  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.52 
 
 
219 aa  132  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48 
 
 
215 aa  132  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000146383  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3007  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.86 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  38.57 
 
 
204 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0492  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.38 
 
 
206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0900  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.39 
 
 
219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.2 
 
 
223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.44 
 
 
236 aa  123  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.23 
 
 
204 aa  123  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.09 
 
 
205 aa  120  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.71 
 
 
221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.33 
 
 
228 aa  115  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.84 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  44.19 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6680  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.96 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal  0.587855 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5776  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.25 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0281488  normal  0.147904 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4827  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.27 
 
 
224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0829  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.55 
 
 
213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.982504  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.42 
 
 
211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000752501  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17535  predicted protein  38.8 
 
 
478 aa  110  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.274913 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.9 
 
 
346 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.5 
 
 
207 aa  107  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  36.19 
 
 
209 aa  107  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.97 
 
 
206 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.14 
 
 
220 aa  105  9e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.97 
 
 
206 aa  105  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77822  predicted protein  32.69 
 
 
533 aa  104  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00729956  normal  0.350827 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2162  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.8 
 
 
210 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  hitchhiker  0.0000728866 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.75 
 
 
220 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10858  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.98 
 
 
208 aa  102  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.84468  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0584  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.77 
 
 
203 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.143376  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.17 
 
 
216 aa  102  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02990  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.81 
 
 
215 aa  102  5e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1657  hypothetical protein  34.74 
 
 
210 aa  102  6e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000901813 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.45 
 
 
206 aa  102  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0261  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.41 
 
 
211 aa  101  9e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.243144  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.52 
 
 
223 aa  101  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2520  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37 
 
 
207 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.77 
 
 
210 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1683  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.07 
 
 
218 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000047745  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10472  thiamine biosynthetic bifunctional enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08970)  37.36 
 
 
519 aa  99.8  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182627  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  40.88 
 
 
479 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.6 
 
 
211 aa  100  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0593  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.98 
 
 
206 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.91 
 
 
197 aa  99  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149529  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0687  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.83 
 
 
222 aa  98.6  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0645  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.09 
 
 
216 aa  98.6  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0076  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.41 
 
 
215 aa  98.6  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0077197  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.54 
 
 
219 aa  97.8  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2056  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.55 
 
 
216 aa  97.4  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.343455 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.84 
 
 
379 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.32 
 
 
343 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.5 
 
 
343 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.96 
 
 
214 aa  95.5  6e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0648  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.48 
 
 
203 aa  95.5  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2301  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.48 
 
 
203 aa  95.5  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.127394 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3406  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.38 
 
 
203 aa  95.5  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405155  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.46 
 
 
352 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0842  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.82 
 
 
223 aa  94.7  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.385725  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0403  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.72 
 
 
211 aa  94.7  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.647684  normal  0.48024 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1918  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.18 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0604  thiamine-phosphate diphosphorylase  39.3 
 
 
217 aa  94  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0199515  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2015  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.7 
 
 
204 aa  94  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0030252  normal  0.0171267 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2205  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.93 
 
 
220 aa  94  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.36 
 
 
202 aa  93.2  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.24 
 
 
220 aa  93.2  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0276  hypothetical protein  32.07 
 
 
212 aa  92.8  5e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.714214 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0349  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.54 
 
 
219 aa  92  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.5 
 
 
234 aa  92  8e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5185  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.83 
 
 
228 aa  92  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0364  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.73 
 
 
217 aa  92  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2663  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.02 
 
 
209 aa  92  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.989358 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  36.41 
 
 
213 aa  91.7  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0246  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.52 
 
 
222 aa  91.3  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0770  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.32 
 
 
227 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  0.090821 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.54 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.71 
 
 
218 aa  90.9  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0547  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40 
 
 
178 aa  91.3  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000291317  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.67 
 
 
221 aa  91.3  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1711  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.97 
 
 
220 aa  91.3  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.98196  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0081  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.95 
 
 
215 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.51 
 
 
219 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5993  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.38 
 
 
218 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.554232 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5050  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.64 
 
 
219 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0093  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.72 
 
 
222 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000282535  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0209  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.41 
 
 
211 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.67 
 
 
356 aa  90.9  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0363  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.02 
 
 
219 aa  89.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.45254  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0377  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.02 
 
 
219 aa  89.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.71 
 
 
218 aa  89.4  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0090  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.39 
 
 
221 aa  89.4  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.64 
 
 
365 aa  89.4  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>