More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4446 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 280 aa  550  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  98.93 
 
 		 280 aa  545  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  95.27 
 
 		 278 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  80.66 
 
 		 278 aa  428  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3382  tryptophan synthase subunit alpha  82.35 
 
 		 279 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0477  tryptophan synthase subunit alpha  80.36 
 
 		 275 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178989  hitchhiker  0.00299272 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  67.77 
 
 		 277 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  68.12 
 
 		 278 aa  362  4e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  68.12 
 
 		 278 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  67.39 
 
 		 278 aa  361  8e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  65.07 
 
 		 279 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  63.97 
 
 		 279 aa  356  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  66.67 
 
 		 278 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  64.71 
 
 		 279 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  66.3 
 
 		 278 aa  354  1e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  63.33 
 
 		 281 aa  350  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  64.39 
 
 		 279 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  65.22 
 
 		 277 aa  344  7e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  61.9 
 
 		 279 aa  343  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  64.13 
 
 		 278 aa  343  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  61.54 
 
 		 279 aa  340  1e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  61.17 
 
 		 279 aa  338  8e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  60.43 
 
 		 279 aa  338  9e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1402  tryptophan synthase subunit alpha  69.68 
 
 		 282 aa  333  2e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.362344 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1695  tryptophan synthase subunit alpha  65.45 
 
 		 281 aa  330  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  hitchhiker  0.000000673783 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  57.62 
 
 		 269 aa  316  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  57.04 
 
 		 270 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  58.74 
 
 		 269 aa  312  3.9999999999999997e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  56.3 
 
 		 268 aa  308  4e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  59.78 
 
 		 267 aa  308  8e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  66.38 
 
 		 272 aa  308  9e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  56.3 
 
 		 268 aa  304  8.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  57.25 
 
 		 269 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  57.25 
 
 		 269 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  65.27 
 
 		 263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  57.04 
 
 		 269 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  60.9 
 
 		 263 aa  302  4.0000000000000003e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  57.62 
 
 		 269 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  56.88 
 
 		 269 aa  301  9e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  56.3 
 
 		 270 aa  298  5e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  64.26 
 
 		 263 aa  291  6e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  64.26 
 
 		 263 aa  291  6e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  59.93 
 
 		 271 aa  276  3e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0333  tryptophan synthase subunit alpha  56.04 
 
 		 265 aa  276  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0090  tryptophan synthase, alpha chain  54.78 
 
 		 265 aa  251  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1329  tryptophan synthase subunit alpha  54.3 
 
 		 276 aa  238  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0798301  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4977  tryptophan synthase subunit alpha  53.16 
 
 		 275 aa  234  9e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1965  tryptophan synthase subunit alpha  52.59 
 
 		 274 aa  233  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2727  tryptophan synthase subunit alpha  55.27 
 
 		 271 aa  232  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.186329  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  46.13 
 
 		 270 aa  232  5e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  46.49 
 
 		 271 aa  230  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1301  tryptophan synthase subunit alpha  53.11 
 
 		 266 aa  230  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.699121  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  44.81 
 
 		 268 aa  225  7e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  47.39 
 
 		 267 aa  223  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  47.15 
 
 		 266 aa  222  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  47.39 
 
 		 267 aa  222  7e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  47.76 
 
 		 265 aa  221  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0468  tryptophan synthase subunit alpha  45.61 
 
 		 272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.270777  normal  0.54371 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  48.95 
 
 		 268 aa  219  5e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  48.95 
 
 		 268 aa  219  5e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  50.21 
 
 		 264 aa  217  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0433  tryptophan synthase subunit alpha  46.03 
 
 		 278 aa  218  1e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0756  tryptophan synthase subunit alpha  45.19 
 
 		 275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000897023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  47.91 
 
 		 274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1726  tryptophan synthase subunit alpha  43.96 
 
 		 272 aa  216  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195248  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2068  tryptophan synthase subunit alpha  43.96 
 
 		 272 aa  216  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  42.56 
 
 		 268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0804  tryptophan synthase, alpha subunit  41.76 
 
 		 272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.28241  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1557  tryptophan synthase subunit alpha  43.96 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  46.09 
 
 		 271 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  44.19 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1683  tryptophan synthase subunit alpha  46.77 
 
 		 271 aa  208  6e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01272  tryptophan synthase subunit alpha  51.24 
 
 		 268 aa  208  8e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  43.4 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  50.21 
 
 		 277 aa  207  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  42.91 
 
 		 265 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  40.07 
 
 		 272 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  42.86 
 
 		 272 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  43.28 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  42.91 
 
 		 265 aa  206  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 262 aa  206  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1063  tryptophan synthase subunit alpha  49.08 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.50074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  42.49 
 
 		 268 aa  206  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  44.58 
 
 		 265 aa  206  5e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  42.58 
 
 		 272 aa  206  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1770  tryptophan synthase subunit alpha  45.11 
 
 		 264 aa  205  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86943  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1269  tryptophan synthase subunit alpha  40.07 
 
 		 272 aa  205  8e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4376  tryptophan synthase subunit alpha  42.59 
 
 		 271 aa  204  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  44.03 
 
 		 269 aa  202  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1787  tryptophan synthase subunit alpha  43.8 
 
 		 273 aa  202  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  43.39 
 
 		 270 aa  202  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  45.34 
 
 		 273 aa  202  7e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  42.7 
 
 		 267 aa  201  8e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  42.49 
 
 		 273 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1803  tryptophan synthase, alpha subunit  50 
 
 		 273 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  37.78 
 
 		 265 aa  200  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  44.4 
 
 		 266 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  44.54 
 
 		 271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1911  tryptophan synthase subunit alpha  41.74 
 
 		 279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.293474  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  44.21 
 
 		 285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0210268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>