41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4420 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4884  Patatin  99.75 
 
 		 397 aa  797    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4930  Patatin  94.46 
 
 		 397 aa  708    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.149942 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4420  patatin  100 
 
 		 397 aa  799    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0052323  normal  0.804694 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3360  patatin  74.61 
 
 		 395 aa  556  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5819  Patatin  65.65 
 
 		 395 aa  448  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.16646  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5259  patatin  65.65 
 
 		 395 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  0.312042 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3407  patatin  53.89 
 
 		 400 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2041  patatin  55.5 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2174  Patatin  52.56 
 
 		 396 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0775647  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6391  alpha/beta superfamily hydrolase  51.9 
 
 		 389 aa  345  8.999999999999999e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.892369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3579  patatin  52.34 
 
 		 396 aa  342  9e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4284  patatin  44.09 
 
 		 398 aa  281  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5658  Patatin  39.78 
 
 		 393 aa  256  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595864  normal  0.124932 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3027  patatin  40.05 
 
 		 424 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6656  patatin  38.5 
 
 		 423 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7175  Patatin  40.69 
 
 		 409 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.656867  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1656  patatin family phospholipase  39.22 
 
 		 418 aa  243  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3530  patatin family phospholipase  39.22 
 
 		 418 aa  243  6e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288489  normal  0.0848725 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1768  patatin  39.22 
 
 		 418 aa  243  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2755  Patatin  43.59 
 
 		 409 aa  240  4e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1962  patatin  43.25 
 
 		 403 aa  235  9e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.105403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0164  patatin  43.45 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.607133  normal  0.62412 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2253  patatin  39.23 
 
 		 410 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4389  Patatin  37.5 
 
 		 434 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.525618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6318  patatin  39.69 
 
 		 454 aa  225  8e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1086  patatin  39.52 
 
 		 411 aa  225  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477256  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3916  patatin  40.61 
 
 		 431 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.158973 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0343  hypothetical protein  35.88 
 
 		 401 aa  223  6e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4284  Patatin  40.3 
 
 		 437 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.401301  normal  0.127899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3783  hypothetical protein  36.46 
 
 		 412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0368  hypothetical protein  40.62 
 
 		 401 aa  220  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4658  patatin  40.06 
 
 		 438 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.631828 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2447  patatin  38.62 
 
 		 375 aa  200  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191371  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0147  Patatin  29.59 
 
 		 380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01156  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily protein  29.9 
 
 		 486 aa  50.4  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  27.17 
 
 		 250 aa  48.5  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  23.86 
 
 		 298 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  23.72 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  28.38 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  25.31 
 
 		 263 aa  45.1  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1593  Patatin  27.97 
 
 		 340 aa  43.9  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>