More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4410 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  100 
 
 		 344 aa  699    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  95.06 
 
 		 344 aa  634    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  100 
 
 		 344 aa  699    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  85.17 
 
 		 342 aa  580  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  82.27 
 
 		 342 aa  537  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  81.69 
 
 		 343 aa  521  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2055  GTP-binding protein Obg/CgtA  77.97 
 
 		 344 aa  510  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  72.29 
 
 		 353 aa  474  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  72.29 
 
 		 353 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3280  GTP-binding protein Obg/CgtA  76.69 
 
 		 346 aa  473  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0275403 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  71.43 
 
 		 353 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0415  GTP-binding protein Obg/CgtA  75.78 
 
 		 348 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  71.55 
 
 		 356 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  71.1 
 
 		 349 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  68.16 
 
 		 358 aa  455  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1845  GTPase ObgE  72.06 
 
 		 341 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  72.81 
 
 		 348 aa  451  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1778  GTPase ObgE  72.06 
 
 		 371 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  72.39 
 
 		 358 aa  448  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1054  GTPase ObgE  72.17 
 
 		 341 aa  443  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87865  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  74.22 
 
 		 349 aa  443  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0317  GTPase ObgE  67.77 
 
 		 339 aa  431  1e-120  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3874  GTPase ObgE  69.14 
 
 		 364 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849027 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3009  GTPase ObgE  68.75 
 
 		 336 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4198  GTPase ObgE  67.66 
 
 		 364 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  65.7 
 
 		 343 aa  412  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  61.77 
 
 		 391 aa  401  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  62.99 
 
 		 354 aa  402  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  61.78 
 
 		 348 aa  402  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4282  GTPase ObgE  70.59 
 
 		 366 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.358429  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  63.48 
 
 		 345 aa  399  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3514  GTPase ObgE  62.79 
 
 		 342 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3822  GTPase ObgE  62.79 
 
 		 342 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3802  GTPase ObgE  62.5 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  64.35 
 
 		 351 aa  390  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0233  GTPase ObgE  62.12 
 
 		 332 aa  383  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  58.94 
 
 		 350 aa  377  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  57.27 
 
 		 345 aa  371  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2283  GTPase ObgE  61.27 
 
 		 344 aa  363  2e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  56.77 
 
 		 348 aa  362  5.0000000000000005e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  55.27 
 
 		 352 aa  336  2.9999999999999997e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  56.35 
 
 		 387 aa  328  7e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 338 aa  312  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  50.97 
 
 		 356 aa  309  4e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  50.45 
 
 		 329 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  50.45 
 
 		 329 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0490  GTPase ObgE  50.16 
 
 		 340 aa  301  1e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.831388  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0543  GTPase ObgE  47.52 
 
 		 340 aa  299  5e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  51.82 
 
 		 353 aa  298  8e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  51 
 
 		 338 aa  295  9e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  52.2 
 
 		 338 aa  295  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.25 
 
 		 350 aa  294  1e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.43 
 
 		 356 aa  293  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  53.5 
 
 		 354 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  53.5 
 
 		 354 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  53.19 
 
 		 354 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  49.39 
 
 		 343 aa  292  6e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  51.15 
 
 		 422 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  46.11 
 
 		 352 aa  290  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  48.56 
 
 		 347 aa  290  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  49.7 
 
 		 345 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  52 
 
 		 458 aa  289  5.0000000000000004e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  51.17 
 
 		 338 aa  289  6e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  52.4 
 
 		 338 aa  289  6e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 392 aa  288  7e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  47.31 
 
 		 402 aa  288  7e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.95 
 
 		 463 aa  288  8e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  48.4 
 
 		 397 aa  288  8e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.16 
 
 		 426 aa  288  9e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  50.44 
 
 		 405 aa  288  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  49.86 
 
 		 362 aa  288  1e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  49.27 
 
 		 353 aa  288  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  47.8 
 
 		 337 aa  287  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  50.6 
 
 		 364 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  47.98 
 
 		 392 aa  287  2e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.64 
 
 		 417 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  48.4 
 
 		 407 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  48.75 
 
 		 361 aa  286  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.68 
 
 		 434 aa  286  4e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0524  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.74 
 
 		 390 aa  286  5e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000179136  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4505  GTPase ObgE  52.74 
 
 		 390 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000250571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  46.75 
 
 		 346 aa  285  5.999999999999999e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  50.3 
 
 		 364 aa  285  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  48.25 
 
 		 407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.49 
 
 		 464 aa  285  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3609  GTPase ObgE  49.7 
 
 		 390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696199  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3743  GTPase ObgE  49.7 
 
 		 390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3978  GTPase ObgE  49.7 
 
 		 390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000165157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  47.83 
 
 		 427 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3493  GTPase ObgE  50 
 
 		 390 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3598  GTPase ObgE  50 
 
 		 390 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3562  GTPase ObgE  50 
 
 		 390 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.238363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3660  GTPase ObgE  50 
 
 		 390 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0449011  normal  0.0890894 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3491  GTPase ObgE  50 
 
 		 390 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000240056  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  47.66 
 
 		 343 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  48.15 
 
 		 408 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  49.27 
 
 		 406 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  49 
 
 		 406 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0561  GTPase ObgE  52.48 
 
 		 390 aa  282  5.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00587502  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  49.56 
 
 		 397 aa  282  5.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>