More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4293 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4293  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 		 316 aa  609  1e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4662  heat shock protein DnaJ domain protein  99.68 
 
 		 316 aa  608  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201642 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5524  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  75.72 
 
 		 308 aa  411  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal  0.0430544 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4811  heat shock protein DnaJ domain protein  92.41 
 
 		 314 aa  408  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0626175  normal  0.377738 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1070  heat shock protein DnaJ domain protein  67.52 
 
 		 310 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709759  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2102  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  64.97 
 
 		 312 aa  334  9e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0238412 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2480  chaperone DnaJ domain-containing protein  50.47 
 
 		 317 aa  251  9.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.129591  normal  0.116583 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1207  heat shock protein DnaJ  50.93 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.480945 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1138  chaperone DnaJ-like  49.69 
 
 		 325 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1106  chaperone DnaJ domain-containing protein  51.33 
 
 		 323 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.495657  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0767  chaperone DnaJ-like  50.79 
 
 		 319 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.937963  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0624  heat shock protein DnaJ  50.78 
 
 		 316 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.541417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2465  putative heat shock (dnaJ-kile)  50.31 
 
 		 320 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1391  heat shock protein DnaJ domain protein  50 
 
 		 322 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83675  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1086  chaperone DnaJ domain protein  48.92 
 
 		 324 aa  236  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1309  chaperone DnaJ-like  48.31 
 
 		 323 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0418  chaperone protein DnaJ, putative  48.11 
 
 		 313 aa  233  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0395  DnaJ family protein  43.59 
 
 		 299 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.460833  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0534  chaperone DnaJ domain-containing protein  47.55 
 
 		 318 aa  232  7.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449663  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0426  putative chaperone protein DnaJ  47.8 
 
 		 313 aa  232  8.000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0726  heat shock protein DnaJ-like  47.15 
 
 		 302 aa  230  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.749707  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1264  heat shock protein DnaJ domain protein  45.45 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0110281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0655  chaperone DnaJ-like protein  45.54 
 
 		 305 aa  195  7e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.610813  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2626  chaperone DnaJ  40.89 
 
 		 326 aa  195  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2015  chaperone DnaJ  41.48 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0999133  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0404  heat shock protein DnaJ-like protein  40 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.203167 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3756  chaperone DnaJ domain protein  39.48 
 
 		 303 aa  187  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.144463  normal  0.652228 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3908  chaperone DnaJ domain protein  36.74 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7804  putative heat shock protein- DnaJ-like protein  41.67 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0934  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.29 
 
 		 320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0828376 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5146  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.94 
 
 		 392 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.67 
 
 		 317 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0507  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.97 
 
 		 304 aa  179  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.830824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6365  chaperone DnaJ domain protein  40.67 
 
 		 304 aa  178  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0593575  normal  0.238878 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1602  chaperone DnaJ domain protein  35.14 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000490827 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  39.01 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  40.66 
 
 		 294 aa  176  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  40.19 
 
 		 335 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.37 
 
 		 323 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6186  chaperone DnaJ domain protein  39.67 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.364765 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  39.88 
 
 		 319 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.88 
 
 		 319 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  39.69 
 
 		 302 aa  172  5.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  40.59 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2992  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.39 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.81 
 
 		 313 aa  169  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.44 
 
 		 315 aa  170  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  36.91 
 
 		 311 aa  169  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0213  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.94 
 
 		 291 aa  169  6e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  39.63 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  37.71 
 
 		 299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  36.74 
 
 		 315 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  37.5 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4905  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.97 
 
 		 318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113006 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  36.56 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.8 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  36.45 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  35.46 
 
 		 333 aa  163  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4186  chaperone DnaJ domain protein  34.42 
 
 		 333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5306  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.72 
 
 		 297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.764434 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  39.16 
 
 		 315 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  34.86 
 
 		 340 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  34.21 
 
 		 339 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.24 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.38 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2674  chaperone DnaJ domain protein  37.83 
 
 		 309 aa  159  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1727  curved DNA-binding protein  37.38 
 
 		 308 aa  159  5e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.7 
 
 		 315 aa  159  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3803  heat shock protein DnaJ  37.94 
 
 		 293 aa  159  6e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.185873 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  35.51 
 
 		 313 aa  159  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  36.09 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2100  heat shock protein DnaJ-like  35.45 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0047  heat shock protein DnaJ-like  33.63 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.940459  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.38 
 
 		 325 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  35.05 
 
 		 330 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2296  chaperone DnaJ domain protein  36.89 
 
 		 331 aa  156  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  33.23 
 
 		 306 aa  155  7e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  38.78 
 
 		 318 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  34.44 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  33.23 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  33.23 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  33.23 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  33.23 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  34.04 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  33.23 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  33.23 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  33.23 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.62 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.75 
 
 		 334 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0049  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.76 
 
 		 339 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  36.93 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0203  chaperone DnaJ domain protein  39.34 
 
 		 333 aa  153  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00279971  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.39 
 
 		 319 aa  153  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0442  chaperone DnaJ domain protein  38.64 
 
 		 325 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1382  heat shock protein DnaJ-like  36.65 
 
 		 313 aa  152  8e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2984  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.45 
 
 		 331 aa  152  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  32.92 
 
 		 306 aa  152  8.999999999999999e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.93 
 
 		 289 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1011  chaperone DnaJ domain protein  34.17 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0185  chaperone DnaJ domain protein  35.83 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.522529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>