More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4292 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4661  enoyl-acyl carrier protein reductase  100 
 
 
275 aa  570  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.281314 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4292  enoyl-acyl carrier protein reductase  100 
 
 
275 aa  570  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4810  enoyl-acyl carrier protein reductase  98.91 
 
 
275 aa  564  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356568  normal  0.368185 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5525  enoyl-acyl carrier protein reductase  86.94 
 
 
274 aa  495  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437087  normal  0.0379728 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0682  enoyl-acyl carrier protein reductase  86.86 
 
 
286 aa  496  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1759  enoyl-acyl carrier protein reductase  86.84 
 
 
286 aa  486  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4143  enoyl-acyl carrier protein reductase  79.1 
 
 
275 aa  448  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.296445 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  78.95 
 
 
282 aa  441  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0292918  normal  0.932772 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1392  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  77.65 
 
 
273 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0905177  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1140  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  76.89 
 
 
273 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.81 
 
 
282 aa  426  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1211  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  75.37 
 
 
272 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.484553 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1312  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  75.37 
 
 
272 aa  424  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2468  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  77.27 
 
 
277 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.791611  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0420  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  75 
 
 
272 aa  410  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0535  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  75 
 
 
272 aa  411  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0631  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  71.91 
 
 
272 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0428  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  74.62 
 
 
272 aa  409  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0727  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  74.62 
 
 
272 aa  407  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0512  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  72.28 
 
 
272 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852556  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0591  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  70.79 
 
 
272 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152317  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1021  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  69.32 
 
 
292 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0396  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  72.01 
 
 
272 aa  386  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.632907  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1147  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  69.12 
 
 
268 aa  383  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000336187  normal  0.125543 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.57 
 
 
279 aa  381  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.268862 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2476  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  68.28 
 
 
270 aa  377  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0264852  normal  0.0112643 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1051  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  68.82 
 
 
274 aa  371  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1019  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  69.2 
 
 
274 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0350664  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0857  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  65.82 
 
 
275 aa  367  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2344  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  69.2 
 
 
274 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.187833  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2624  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  68.08 
 
 
279 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1790  NADH dependent enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase  67.3 
 
 
272 aa  366  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00952782  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3131  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  63.41 
 
 
279 aa  355  2.9999999999999997e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.044421  normal  0.0801716 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0269  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  59.7 
 
 
280 aa  350  2e-95  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.134269  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0051  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  63.12 
 
 
267 aa  346  3e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0811  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  59.54 
 
 
266 aa  345  4e-94  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0085  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  62.4 
 
 
261 aa  343  1e-93  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4769  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  63.88 
 
 
267 aa  341  5.999999999999999e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0134326  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0657  enoyl-acyl-carrier-protein reductase  60.15 
 
 
275 aa  337  9.999999999999999e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.45449  normal  0.282453 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0347  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  59.33 
 
 
282 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0611  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.96 
 
 
281 aa  332  5e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.62 
 
 
276 aa  330  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0868707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0426  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.62 
 
 
291 aa  331  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.185416  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3448  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  61.54 
 
 
268 aa  331  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.23 
 
 
277 aa  330  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.917513  normal  0.103636 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0222  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.96 
 
 
281 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.31 
 
 
284 aa  330  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.190208 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4380  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  61.57 
 
 
268 aa  328  7e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0066  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  60.77 
 
 
266 aa  328  8e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0040  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.43 
 
 
282 aa  326  3e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0431  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  59.23 
 
 
269 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4058  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  60.23 
 
 
268 aa  324  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0384  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.07 
 
 
275 aa  324  9e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350006  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2227  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.46 
 
 
275 aa  323  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.26472  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0052  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  59.69 
 
 
282 aa  323  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.257261 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60 
 
 
276 aa  322  5e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2171  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  60.55 
 
 
272 aa  321  7e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0550079  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2083  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  60.55 
 
 
272 aa  321  7e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.464026  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0741  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  59.38 
 
 
272 aa  319  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0179  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  60.08 
 
 
264 aa  319  3.9999999999999996e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0032  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.92 
 
 
277 aa  314  8e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.236001 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.53 
 
 
278 aa  314  9e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.59 
 
 
288 aa  313  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.75394  hitchhiker  0.000398592 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3937  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  55.43 
 
 
282 aa  308  5e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.111733  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1657  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  58.91 
 
 
262 aa  302  3.0000000000000004e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0475935  normal  0.551485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3620  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  55.21 
 
 
260 aa  301  1e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000470966  normal  0.0807844 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.08 
 
 
262 aa  299  4e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.627709  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2204  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  60.31 
 
 
262 aa  298  5e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0180  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  58.75 
 
 
264 aa  294  1e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26134  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1734  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  55.91 
 
 
274 aa  291  7e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1399  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  55.91 
 
 
274 aa  291  7e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1270  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  53.9 
 
 
272 aa  290  1e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1587  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  55.91 
 
 
274 aa  288  8e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0818628  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0043  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  54.02 
 
 
265 aa  288  8e-77  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.159183  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1426  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  53.94 
 
 
274 aa  287  1e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0780  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  53.76 
 
 
273 aa  283  3.0000000000000004e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.11 
 
 
273 aa  281  6.000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1245  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.33 
 
 
273 aa  281  9e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.766036  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3176  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  58.53 
 
 
262 aa  280  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.53 
 
 
262 aa  280  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.445364  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3406  enoyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  54.65 
 
 
259 aa  278  5e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0513  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  53.15 
 
 
272 aa  278  7e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.882519  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1751  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  52.36 
 
 
273 aa  275  4e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0464231  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1555  enoyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  53.67 
 
 
259 aa  275  6e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1008  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  57.41 
 
 
262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.96 
 
 
263 aa  272  3e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1006  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  54.33 
 
 
254 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2277  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase  53.67 
 
 
263 aa  272  4.0000000000000004e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1139  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.51 
 
 
256 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000599586  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1119  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.51 
 
 
256 aa  271  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427423  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1113  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.51 
 
 
256 aa  271  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000710304  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.53 
 
 
254 aa  271  1e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1272  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.51 
 
 
256 aa  271  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00654977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1300  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.51 
 
 
256 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000387005 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1232  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.51 
 
 
256 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.674316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1377  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.51 
 
 
256 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0829066  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4070  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.51 
 
 
256 aa  270  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.100281  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.94 
 
 
254 aa  270  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228784  normal  0.117413 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1339  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.51 
 
 
256 aa  270  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.643434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1126  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.51 
 
 
256 aa  270  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0465054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>