57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4268 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4268  putative alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 342 aa  680    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489115  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4635  putative alpha/beta hydrolase fold protein  96.48 
 
 		 343 aa  632  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.709746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4783  putative alpha/beta hydrolase fold  94.43 
 
 		 342 aa  617  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.878297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2882  alpha/beta hydrolase fold  65.71 
 
 		 342 aa  388  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652094  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5702  alpha/beta hydrolase fold  62.39 
 
 		 342 aa  362  4e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  hitchhiker  0.00380393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6447  putative alpha/beta hydrolase fold  54.55 
 
 		 322 aa  312  6.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1321  alpha/beta hydrolase fold  51.21 
 
 		 327 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.918656 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0258  alpha/beta hydrolase fold  52.81 
 
 		 329 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.125918  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1220  Alpha/beta hydrolase  48.44 
 
 		 327 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4013  Alpha/beta hydrolase  48.66 
 
 		 317 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.0298464 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1405  alpha/beta hydrolase fold  50.52 
 
 		 331 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.301031  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1697  alpha/beta hydrolase fold  48.29 
 
 		 317 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3768  alpha/beta hydrolase fold  48.32 
 
 		 317 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0122064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1259  hypothetical protein  51.19 
 
 		 316 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909105  normal  0.0175405 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0565  alpha/beta hydrolase fold  41.69 
 
 		 321 aa  189  8e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4130  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608421 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2807  alpha/beta hydrolase fold protein  32.42 
 
 		 311 aa  103  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.16124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2474  alpha/beta hydrolase fold protein  32.65 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0898  alpha/beta hydrolase fold protein  29.9 
 
 		 320 aa  99.8  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1914  alpha/beta hydrolase fold  34.77 
 
 		 289 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204003  unclonable  0.0000086861 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2157  alpha/beta hydrolase fold protein  31.7 
 
 		 293 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.048331  hitchhiker  0.0048272 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2969  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 		 327 aa  88.2  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248343  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0495  alpha/beta hydrolase fold  34.91 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2288  Alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.906188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0656  Alpha/beta hydrolase fold  30.32 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198236  decreased coverage  0.00768241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0937  alpha/beta hydrolase fold protein  28.64 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1638  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  29.09 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0512  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106161  normal  0.950535 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3663  alpha/beta hydrolase fold  25.78 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30576  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3062  hypothetical protein  26.19 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3531  alpha/beta hydrolase fold protein  27.93 
 
 		 329 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.290128  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  26.26 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3223  Alpha/beta hydrolase fold  23.9 
 
 		 300 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  27.45 
 
 		 314 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0829  alpha/beta hydrolase fold  26.7 
 
 		 290 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.41609  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  34.17 
 
 		 308 aa  47  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.2 
 
 		 285 aa  47  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.76 
 
 		 370 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  23.61 
 
 		 293 aa  46.2  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  23.53 
 
 		 330 aa  46.2  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 		 248 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  24.58 
 
 		 325 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  26.17 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3781  alpha/beta hydrolase fold  22.67 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.668878  normal  0.527561 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.66 
 
 		 372 aa  44.3  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  31.3 
 
 		 332 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 		 279 aa  43.9  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  24.05 
 
 		 350 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1269  hypothetical protein  26.22 
 
 		 285 aa  43.5  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0068  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  23.83 
 
 		 297 aa  43.5  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2433  hypothetical protein  25.6 
 
 		 306 aa  43.5  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_4818  predicted protein  24.52 
 
 		 280 aa  43.5  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4208  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 		 268 aa  43.1  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 		 308 aa  42.7  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0537  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  27.95 
 
 		 292 aa  42.7  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.169084  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 		 299 aa  42.4  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1296  alpha/beta hydrolase fold protein  41.38 
 
 		 292 aa  42.7  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0671878  hitchhiker  0.00361499 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>