More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4191 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  100 
 
 		 244 aa  473  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  95.9 
 
 		 244 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  84.91 
 
 		 236 aa  341  5.999999999999999e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  64.75 
 
 		 225 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  70.4 
 
 		 240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  66.07 
 
 		 226 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  58.54 
 
 		 225 aa  225  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  56.16 
 
 		 218 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  56.1 
 
 		 230 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  55.2 
 
 		 230 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  52.97 
 
 		 234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  53.69 
 
 		 226 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  51.43 
 
 		 236 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  57.51 
 
 		 230 aa  211  7.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  55.92 
 
 		 221 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  57.97 
 
 		 208 aa  210  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  58.2 
 
 		 214 aa  209  5e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  58.51 
 
 		 211 aa  208  7e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  58.65 
 
 		 217 aa  208  8e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  56.73 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  54.9 
 
 		 226 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1536  dTMP kinase  53.55 
 
 		 237 aa  199  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0543  dTMP kinase  60.98 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  54.33 
 
 		 209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2679  thymidylate kinase  53.21 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18582  normal  0.346659 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  51.9 
 
 		 214 aa  189  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2715  thymidylate kinase  53.21 
 
 		 252 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.956607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1454  thymidylate kinase  55.03 
 
 		 211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.499935  hitchhiker  0.00267857 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  49.74 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  51.96 
 
 		 209 aa  181  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 217 aa  178  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  48.34 
 
 		 213 aa  175  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  45.75 
 
 		 213 aa  174  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  44.66 
 
 		 219 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  47.96 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  44.5 
 
 		 212 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  53.08 
 
 		 210 aa  172  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  52.88 
 
 		 210 aa  170  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  50.71 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  52.63 
 
 		 688 aa  169  4e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  50.79 
 
 		 671 aa  169  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  51.47 
 
 		 218 aa  168  6e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  46.73 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  44.7 
 
 		 688 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  45.98 
 
 		 244 aa  166  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  42.33 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  50 
 
 		 211 aa  166  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  51.56 
 
 		 213 aa  166  5e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  47.92 
 
 		 686 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  49.77 
 
 		 210 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0027  dTMP kinase  52.63 
 
 		 215 aa  164  8e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.0709229 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  46.48 
 
 		 686 aa  164  9e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  51.76 
 
 		 210 aa  164  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  50.23 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  50.25 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  49.74 
 
 		 214 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  47 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  48.69 
 
 		 217 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1277  thymidylate kinase  46.34 
 
 		 208 aa  163  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  48.77 
 
 		 208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  50.5 
 
 		 207 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 212 aa  162  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  50 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  46.31 
 
 		 208 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  49.75 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  47.25 
 
 		 210 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  48.45 
 
 		 901 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  44.44 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  47.57 
 
 		 210 aa  159  5e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  39.32 
 
 		 204 aa  158  6e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  43.06 
 
 		 223 aa  158  8e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  49.21 
 
 		 207 aa  158  9e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  47.25 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  47.06 
 
 		 213 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1628  thymidylate kinase  48.28 
 
 		 215 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000125837  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  47.87 
 
 		 199 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  40.5 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  48.08 
 
 		 207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  48.42 
 
 		 705 aa  155  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  45.85 
 
 		 204 aa  154  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  43.13 
 
 		 217 aa  154  9e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  45.41 
 
 		 217 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  45.41 
 
 		 217 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2802  thymidylate kinase  46.6 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  48.69 
 
 		 703 aa  153  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  44.61 
 
 		 214 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1592  thymidylate kinase  45.79 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116501  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  42.72 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  46.12 
 
 		 206 aa  152  4e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  44.17 
 
 		 202 aa  152  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  43.69 
 
 		 215 aa  152  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  49.75 
 
 		 225 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  43.96 
 
 		 212 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  42.08 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  45.03 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  44.44 
 
 		 207 aa  151  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  44.93 
 
 		 243 aa  150  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  40.48 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  44.61 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>