114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4183 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4183  GDSL family lipase  100 
 
 		 267 aa  527  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4554  lipolytic protein G-D-S-L family  99.63 
 
 		 267 aa  526  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4697  lipolytic protein G-D-S-L family  94.01 
 
 		 267 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  52.86 
 
 		 269 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  51.17 
 
 		 275 aa  199  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  51.17 
 
 		 286 aa  198  6e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  49.77 
 
 		 275 aa  193  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  53.88 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0079  lipolytic protein G-D-S-L family  54.76 
 
 		 279 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848092  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1136  lipolytic protein G-D-S-L family  45.63 
 
 		 221 aa  159  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.527097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1996  GDSL family lipase  40 
 
 		 238 aa  129  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0220  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.71 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5252  lipolytic protein G-D-S-L family  38.79 
 
 		 322 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0138  lysophospholipase L1 and related esterase  33.92 
 
 		 327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  37.38 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0901  lipolytic enzyme, G-D-S-L  40.39 
 
 		 303 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0790  lipolytic protein  41.87 
 
 		 318 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0767  putative esterase/acetylhydrolase  33.64 
 
 		 379 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0045869  hitchhiker  0.00361745 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2227  lipolytic protein G-D-S-L family  33.63 
 
 		 285 aa  95.9  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2189  GDSL family lipase  31.1 
 
 		 250 aa  95.1  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00786475  normal  0.715805 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0137  hypothetical protein  30.94 
 
 		 253 aa  86.7  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2374  hypothetical protein  31.55 
 
 		 276 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  hitchhiker  0.00086593 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0221  hypothetical protein  32.84 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0766  hypothetical protein  29.37 
 
 		 252 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0644448  hitchhiker  0.00367044 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0988  hypothetical protein  32.52 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.552823  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0951  hypothetical protein  32.52 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5410  hypothetical protein  31.02 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0789  hypothetical protein  32.33 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161897  normal  0.103899 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4911  hypothetical protein  31.84 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.797649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5560  hypothetical protein  30.05 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0929  hypothetical protein  31.55 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0900  hypothetical protein  30.8 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5253  hypothetical protein  28.83 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.209286  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3748  GDSL family lipase  36.19 
 
 		 300 aa  67  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0394  GDSL family lipase  28.21 
 
 		 204 aa  62  0.000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00216683  hitchhiker  0.0000338179 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2747  lysophospholipase L1-like protein  30 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0275  lipolytic protein G-D-S-L family  26.73 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  25.29 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2989  GDSL family lipase  31.91 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.816827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0817  lipolytic protein G-D-S-L family  29.94 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00788434 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  32.31 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  26.26 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  22.64 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  27.69 
 
 		 216 aa  53.9  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0043  GDSL family lipase  29.26 
 
 		 202 aa  53.1  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000938694  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  28 
 
 		 200 aa  53.1  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  29.19 
 
 		 202 aa  52.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  36.36 
 
 		 223 aa  52.4  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  30.81 
 
 		 240 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2149  putative lipase  36.81 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.208079 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2112  lipolytic protein G-D-S-L family  31.41 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.835545 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4411  lipolytic protein G-D-S-L family  32.67 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0430  acyl-CoA thioesterase I  31.05 
 
 		 189 aa  50.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000157795  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  29.25 
 
 		 205 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  27.43 
 
 		 215 aa  50.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6500  lipolytic protein G-D-S-L family  28.04 
 
 		 237 aa  49.3  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1401  arylesterase  28.9 
 
 		 226 aa  49.3  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1302  lipolytic protein G-D-S-L family  30.37 
 
 		 204 aa  48.9  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5710  lipolytic protein G-D-S-L family  26.42 
 
 		 249 aa  48.9  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80532  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  29.93 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  28.65 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2068  arylesterase  28.11 
 
 		 217 aa  48.9  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.756828  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  30.16 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05801  arylesterase  28 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2714  lipolytic protein  28.32 
 
 		 200 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345336 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1154  lipolytic protein  27.98 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0285  arylesterase precursor  27.17 
 
 		 206 aa  47.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  28.12 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  29.51 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  24.51 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  28.33 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2048  lipolytic protein G-D-S-L family  34.57 
 
 		 207 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.137191 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2077  lipolytic protein G-D-S-L family  40.26 
 
 		 241 aa  47.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.66 
 
 		 211 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.29 
 
 		 183 aa  46.2  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1526  GDSL family lipase  31.86 
 
 		 206 aa  45.8  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0224358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2546  hypothetical protein  24.89 
 
 		 239 aa  45.8  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.109536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  29.76 
 
 		 261 aa  45.8  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  31.07 
 
 		 240 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2959  arylesterase  25.26 
 
 		 202 aa  45.8  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1451  acyl-CoA thioesterase I  28.08 
 
 		 210 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0796987  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  28.81 
 
 		 201 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  27.78 
 
 		 201 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1944  acyl-CoA thioesterase, putative  28.08 
 
 		 210 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  26.86 
 
 		 213 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4821  lipolytic protein G-D-S-L family  32.53 
 
 		 456 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000350884  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1973  arylesterase  23.89 
 
 		 208 aa  44.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2130  acyl-CoA thioesterase I  27.4 
 
 		 232 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0925332  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  27.81 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3360  acyl-CoA thioesterase I  28.08 
 
 		 226 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.323811  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2349  acyl-CoA thioesterase I  28.08 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342974  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1219  acyl-CoA thioesterase, putative  28.08 
 
 		 226 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  24.46 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2141  GDSL family lipase  26.17 
 
 		 189 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.953926  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3205  GDSL family lipase  25.25 
 
 		 201 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765552  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2263  hypothetical protein  22.78 
 
 		 371 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0267  lipolytic protein G-D-S-L family  29.68 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151639 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  26.23 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2468  acyl-CoA thioesterase I  28.08 
 
 		 232 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4035  arylesterase  29.92 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926755 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>