75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4140 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  100 
 
 
176 aa  355  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  98.3 
 
 
176 aa  349  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  91.72 
 
 
177 aa  298  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  68.33 
 
 
184 aa  245  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  63.22 
 
 
177 aa  216  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1917  MxaD protein, putative  54.09 
 
 
176 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740927  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0481  MxaD protein, putative  56.13 
 
 
176 aa  179  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  48.78 
 
 
174 aa  167  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3003  MxaD protein, putative  44.51 
 
 
177 aa  157  7e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0105582  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2034  MxaD protein, putative  44.97 
 
 
167 aa  154  7e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  47.44 
 
 
173 aa  141  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0195  hypothetical protein  46.5 
 
 
183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32187 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  46.54 
 
 
176 aa  139  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  46.95 
 
 
179 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  44.72 
 
 
178 aa  136  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2381  MxaD gene product  41.95 
 
 
175 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.1214  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  43.6 
 
 
187 aa  131  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  44.81 
 
 
179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  44.03 
 
 
176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  43.4 
 
 
176 aa  129  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  41.52 
 
 
181 aa  128  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2727  putative signal peptide  42.95 
 
 
177 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  44.3 
 
 
178 aa  126  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1840  hypothetical protein  39.05 
 
 
177 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2175  hypothetical protein  39.47 
 
 
177 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.286876  normal  0.507077 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1819  MxaD protein, putative  42.44 
 
 
195 aa  115  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  41.36 
 
 
176 aa  111  6e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0024  hypothetical protein  40 
 
 
183 aa  107  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1791  putative exported protein of unknown function  35.03 
 
 
178 aa  105  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.813923  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0851  hypothetical protein  39.46 
 
 
185 aa  99  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  37.95 
 
 
157 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  42.73 
 
 
158 aa  90.1  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  36.17 
 
 
161 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  34.04 
 
 
166 aa  83.6  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2419  MxaD protein  33.14 
 
 
168 aa  83.2  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0515899  normal  0.905694 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  37.59 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  41.58 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  32.93 
 
 
164 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  33.33 
 
 
136 aa  70.9  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  32.57 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  31.74 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  30.4 
 
 
168 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  29.93 
 
 
135 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4812  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  61.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  30.77 
 
 
138 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3442  hypothetical protein  30.07 
 
 
138 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  30.07 
 
 
138 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3211  hypothetical protein  30.07 
 
 
138 aa  58.2  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3430  hypothetical protein  30.07 
 
 
138 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3464  hypothetical protein  30.07 
 
 
138 aa  58.2  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.21504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3189  hypothetical protein  30.07 
 
 
138 aa  58.2  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  29.73 
 
 
145 aa  58.2  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4407  hypothetical protein  26.8 
 
 
144 aa  57.8  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  30.5 
 
 
138 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000036824  normal  0.167338 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3426  hypothetical protein  30.07 
 
 
138 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0586777  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  27.86 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  27.86 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  32.21 
 
 
138 aa  55.1  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7414  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  51.6  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156921  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0713  hypothetical protein  24.83 
 
 
153 aa  51.6  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  34.62 
 
 
138 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  34.62 
 
 
138 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  33.65 
 
 
138 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5012  hypothetical protein  28.04 
 
 
159 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5458  hypothetical protein  25.45 
 
 
158 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2463  hypothetical protein  27.46 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00011136  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1841  Polyketide cyclase/dehydrase  33.04 
 
 
144 aa  45.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0826  hypothetical protein  25 
 
 
141 aa  45.8  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1866  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.85 
 
 
157 aa  44.3  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3994  hypothetical protein  29.2 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0672627  normal  0.158861 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1985  hypothetical protein  27.52 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0625  hypothetical protein  28.15 
 
 
144 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1464  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.15 
 
 
152 aa  41.6  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5073  cyclase/dehydrase  27.1 
 
 
156 aa  41.2  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.053477  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2981  hypothetical protein  26.39 
 
 
149 aa  41.2  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>